找到约 15 条结果

问题 单倍型分析报错

...in data.frame(Hap = haps, Type = infos) : arguments imply differing number of rows: 168, 0”。我已经检查了自己的文件,包括gff3文件,site文件,表型文件以及分组文件,对比了demo文件,可以非常确定,这些文件没有任何问题。进一步发现,在我的...

问题 执行ALLHiC分组不成功

...lean.bam -r draft.asm.fasta -e DPNII -k $k ## Extract CLM file and counts of restriction sites  #(HindIII: AAGCTT; MboI: GATC) allhic extract sample.clean.bam draft.asm.fasta --RE GATC ## 排序和方向优化 for K in `seq  1 $k`; do     allhic optimize sample.clean.counts_GATC.${k}g${K...

文章 subset_row.r 提供列表,在行上取数据子集

....27602 69.15157 39.07867 54.38476 34.75987 53.74329 17.22876 45.18002 SCYL3 2.480883 1.120544 4.504755 2.020254 2.454489 2.806747 1.956408 2.751801 C1orf112 1.972838 0.657791 4.021506 1.796665 0.86856 2.489893 0.568309 1.631315 FGR 0.640395 5.7056...

问题 请问mapman分析kegg时,总提示这个 Data does not fit mapping used (no data points mapped),please choose the appropriate mapping which matces your data

请问mapman分析kegg时,总提示这个 Data does not fit mapping used (no data points mapped),please choose the appropriate mapping which matces your data

问题 老师您好,今天利用docker进行基因家族分析进入组学大讲堂虚拟机时报错,之前一直正常

...pipe%2Fdocker_engine/v1.40/containers/create: open //./pipe/docker_engine: The system cannot find the file specified. In the default daemon configuration on Windows, the docker client must be run elevated to connect. This error may also indicate that the docker daemon is not running. See 'C:\Progra...

文章 kraken2生成的biom文件处理

...tput biom file', required=True) args = parser.parse_args() # Load the BIOM table table = load_table(args.input) # Get the OTU IDs and the data otu_ids = table.ids(axis='observation') data = table.matrix_data # Get the taxonomy metadata metadata = table.metadata(axi...

文章 NCBI上下载参考基因组信息

... 点击之后,就进入下载页面: 注意,点击Download the RefSeq assembly与Download the GenBank assembly都可以下载物种的全基因组信息,但是Download the GenBank assembly会提供RNA、蛋白的一个gff格式文件,而Refseq上没有(gff.是一个基因注释...

问题 老师,您好,我按照课程执行重测序里面的变异结果统计与绘图,其中indel可以正常执行,但是snp运算没有结果,请问老师是什么原因呢?

...art.pl -vcf snp.unknown_multianno.vcf -type snp时总是出错,显示Use of uninitialzed value in division (/) at /work/scripts/vcf_stat.pl line 313.还有Illegal division by zero at /work/scripts/vcf_stat.pl line 312.运算没有结果,请问老师是什么原因呢?

问题 /sbin/mount.vboxsf: mounting failed with the error: Protocol error 模拟器设置公共文件夹时候出的错实在不知道从何下手

文章 univariate_cox_batch.r 基因表达量批量单因素cox回归分析

...0291076 参考文献: 使用R包 survival 做cox分析 Therneau T (2021). A Package for Survival Analysis in R. R package version 3.2-11, https://CRAN.R-project.org/package=survival. Terry M. Therneau, Patricia M. Grambsch (2000). Modeling Survival Data: Extending the Cox Model. Springer...

问题 老师您好!装完linux虚拟机后,不能和windows实现共享怎么解决呢?出现了这个/sbin/mount.vboxsf: mounting failed with the error: Protocol error。谢谢

文章 AI 写代码之绘制GWAS 曼哈顿图

没有做任何修改,全靠 对话AI,利用AI给的R代码绘图结果,还是不错的: 这是对话链接大家可以看看:https://www.doubao.com/thread/w1d46b45b18549316

文章 11月8日见刊(IF=4.5)水稻U-box E3基因家族分析文献解析

...刚在线发表的水稻U-box E3家族的文章,发表在International Journal of Molecular Sciences期刊上,影响因子IF=4.556,我们就一起看看这篇文章都写了哪些内容,希望对您的思路有所帮助。 U-box E3 Ubiquitin Ligase简介 泛素蛋白酶体途径是己知...

文章 IF=13.8 | 青藏高原人群肠道微生物生物标志物的荟萃分析及微生物群衍生的丁酸盐在高海拔适应中的功能

...ntifying gut microbial biomarkers of Qinghai-Tibet Plateau populations and the functionality of microbiota-derived butyrate in high-altitude adaptation”的文章,该文章找到了可能与高原适应相关的肠道微生物标志物,并揭示了丁酸在减轻高原环境造成的肠道损...

问题 做WGCNA分析时,得到的CytoscapeInput-edges文件都是空的,请问该如何解决?

老师您好,我看到您在2021-03-20提问的问题:在做WGCNA分析时,得到的CytoscapeInput-edges文件都是空的,请问该如何解决?我也遇到了相同的问题,请问您后来如何解决的呢?感谢您!