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文章 Java安装与配置

...桌面左下角的“开始”菜单中,点击“运行”输入"CMD",打开DOS窗口,输入命令 "java -version" 并回车。 OK,系统显示了我们的java版本为 9.0.1。这样,我们的电脑就支持Java程序在电脑上运行了。

文章 最新2区转录组文章!看人家是怎么写的!

...个性化分析,求人不如求己,一切痛点都能解决: 1. 单细胞/空间转录组正在大火,高分文章必备,0基础学单细胞/空间转录组分析,做更牛的个性化分析,绘更漂亮的图,点这个链接:单细胞/空间转录组分析实操  2. 2区文章...

文章 华大 空间转录组与10X 公司比较

生信课堂单细胞空间转录组专用云服务器免费领取 Stereo-seq基于华大自主研发的DNBSEQ测序技术,利用携带空间条形码(Coordinate ID,CID)信息、规则阵列式排布的DNA纳米球(DNA Nano Ball,DNB),制备成时空芯片,原位捕获组织中...

文章 细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE146771)

数据介绍: 来自谷歌翻译: 单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 是定义肿瘤细胞多样性的强大工具,但其在剖析免疫调节疗法潜在机制方面的应用很少。我们对结直肠癌患者的免疫和基质群体进行了 scRNA-seq 分析,确定了特定的巨噬细胞...

文章 细胞转录组数据挖掘流程记录-非小細胞肺癌(NSCLC)(GSE127465)

数据介绍: 来自谷歌翻译: 肿瘤浸润性髓系细胞 (TIM) 包括单核细胞、巨噬细胞、树突状细胞和中性粒细胞,已成为癌症生长的关键调节因子。这些细胞可以分化成一系列状态,这些状态可能会促进或限制肿瘤生长,但目前...

问题 叶绿体基因组组装

您好,我组装得到一条完成的fasta序列,但是在bandage中打开gfa文件,是几个环,这种情况该怎么处理啊?

问题 老师您好,利用per脚本去除重复的转录本那一步我执行perl script/select_redundant_mRNA.pl mRNA2geneID.txt PTR2_domain_new_out_selected.txt PTR2_remove_redundant_IDlist.txt命令之后得到的文件中只有一行,和老师讲的格式完全不一样,如下图,我也截图了我的gff文件您看是因为它的原因吗?不知道该怎么解决了,请求老师指点一下

我得到的PTR2_remove_redundant_IDlist.txt如下我的gff文件如下 执行命令所用的PTR2_domain_new_out_selected文件 执行命令所用的mRNA2geneID文件

文章 叶绿体或线粒体重复序列圈图绘制

细胞器基因组分析的重复序列展示中有时会展示为下面这种circos圈,用来描述基因组的微卫星重复序列(SSR)、串联重复序列(Tandem repeats)的分布以及散在重复序列(Dispersed repeats)的共线性关系,简洁美观,今天带大家一起...

问题 已经windows系统里下载了docker 也打开了,但还是运行不了. doc.sh

问题 请问,gff文件打开后没有biotype,就不用运行保留蛋白编码基因那个命令了吗?

文章 如何预测CpG岛

...DNA序列文件:将需要预测CpG岛的DNA序列保存为文本文件,格式为FASTA的格式。运行CpGPlot:在命令行界面下,使用以下命令来运行CpGPlot工具: cpgplot -sequence input.fa -window 100  -minlen 200 -minoe 0.6 -minpc 50 -outfile cpgplot.txt -noplo...

文章 基因编辑iPSCS敲除技术原理与潜在的治疗应用

诱导多能干细胞(iPS细胞),是一种从成年(成熟)细胞生成的未成熟细胞,已经恢复了分化为体内任何类型细胞的能力。诱导的多能干细胞(iPS细胞)不同于胚胎干细胞(ES细胞),后者形成胚胎的内部细胞团,但也是多能的...

文章 流式细胞术一定要设置对照组吗?对照原则了解下

...对照设置好了吗? 有的同学说,我只是简单地检测一下细胞凋亡,就不需设置空白对照和单染对照,根据未处理组设定就行; 然而也有人说,你这样的对照设置是不可取的。 那么有关流式实验的对照设置,你的心中是否存在...

文章 细胞转录组-inferCNV拷贝数变异分析介绍

...。这些变异可能覆盖几千到几百万个碱基对。而肿瘤恶性细胞通常伴随着拷贝数变异,通过影响相关基因的表达促进肿瘤发生。在肿瘤单细胞转录组数据分析过程中,肿瘤细胞类型的注释可通过tumor related marker gene的表达情况(是...

文章 细胞培养中的胎牛血清正确使用指南

牛血清是细胞培养中最常用的天然培养基,与合成的基础培养基配合使用,一般添加使用量在10~20%,主要作用是提供细胞生长所需的营养物质、激素和生长因子等。 养过细胞的小伙伴们应该都知道:血清,由于其复杂的内在...