文章 跨物种进化研究必备的‘单拷贝直系同源基因’如何查找

...=NONE 具体操作 具体操作步骤包括创建数据库、转换序列格式、过滤、比对、解析结果和聚类等步骤，详细说明如下： （1）创建数据库并建表 这一部分就是依据刚才配置的config文件，对mysql进行配置，在数据库里建立一些空...

问题 做亚细胞定位，请问老师cyto_nucl这个说的是哪个位置；后面的数字又如何理解；cyto是说细胞质还是细胞骨架，因为开头字母都一样

FaMATE38  cyto: 4.5, chlo: 3, cyto_nucl: 3, vacu: 2, mito: 1, plas: 1, extr: 1, E.R.: 1 

问题 做亚细胞定位，请问老师cyto_nucl这个说的是哪个位置；后面的数字又如何理解；cyto是说细胞质还是细胞骨架，因为开头字母都一样

FaMATE38  cyto: 4.5, chlo: 3, cyto_nucl: 3, vacu: 2, mito: 1, plas: 1, extr: 1, E.R.: 1 

问题 做亚细胞定位，请问老师cyto_nucl这个说的是哪个位置；后面的数字又如何理解；cyto是说细胞质还是细胞骨架，因为开头字母都一样

 FaMATE38  cyto: 4.5, chlo: 3, cyto_nucl: 3, vacu: 2, mito: 1, plas: 1, extr: 1, E.R.: 1 

文章 轻松搞定fasta索引文件、序列提取

fasta是常用的序列存储格式，很多软件（如GATK、IGV等）在导入序列以及进行快速查找时通常需要建立索引文件。下面就来介绍如何使用 samtools 便捷的建立fasta文件的索引以及快速进行序列提取。 1 建立索引 建立索引只需在Linu...

问题 单细胞测序的细胞通讯分析 cellchat

用的课程里提供的代码跑的，出来的这个图为什么最后多了没有对应的一列，而且这里应该展示的是在S组中上调的signaling，但是为什么感觉N组的圆圈的颜色比S组的更深呢？而且为什么HLA-DQB1和CD4在上调和下调中都出现了呢？

文章 HPA：人类蛋白图谱数据库

...况      以PAX8为例 2.    SINGLE CELL TYPE ATLAS     单细胞类型图谱包含13种不同人体组织的单细胞RNA测序（scRNAseq）数据，以及内部生成的免疫组织化学染色组织切片，显示相应的空间蛋白表达模式。     以blood & immune ce...

文章 远程服务器登录putty（云服务器，实验室服务器等）

...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门...

问题 请问拿到转录组数据后如何打开fq 文件？又如何生成Excel表格？

问题 circos

下面的这种图用circos怎么画了？文章中写的是用circos软件做的，那咱们课堂中做的圈图的脚本怎么修改就可以做这样的图了，谢谢！

问题 conda

我再我的服务器上安装的conda，在安装软件的时候怎么总是出现错误， 在你们服务器上就没有错误，这是怎么回事？加入的频道也是一样的

问题 Docker 打开显示这个，但是我的wsl是新下的应该是最新的

文章 转录组必备说明书！

...十页结题报告和几百兆的结果文件的时候，一定会想：这怎么下手？！如果再配个说明书该多好啊！ “说明书”应该具备的作用 一份合格的“说明书”应该能够让0基础的同学看懂庞杂的数据结果，知道结果背后的生物学意义...

文章 谷歌学术搜索可以用了（免费，不用翻墙）google scholar

没有谷歌学术，怎么做科研？？ 由于种种无法明说的原因，在国内谷歌学术无法访问；长期以来，大家都尝试着去找谷歌学术的替代品，比如百度学术等等，百度搜搜中文还好，对于英文文献的搜索还是不尽人意，用过谷歌...

问题 结合转录组分析基因家族

老师，您好，我下载了别人发表的转录组数据，想拿结合做热图，但是文件太大，有十几个G，这样的文件该怎么打开筛选表达量数据呢