老师,看了您的视屏Ilumina 的只有用limu 包处理txt 格式的数据,怎么处理idat 格式的数据?
awk 具有内置算术函数log(x),以e 为底可以对数据取对数运算,而以其他数值为底进行取对数可以基于这一函数进行转换,譬如 以2为底取对数: log(x)/log(2)即可。 下面针对数据第二列进行取对数,(数据从第二行开始进行计算,...
老师,宏基因组经过组装后的数据进行分布进行功能和分类注释,功能通路的丰度用tpm表示,分类注释用相对丰度表示,这两者数据本质上区别不大吧。因为我找到一篇论文他做mmvec分析时,用的宏基因组通路的对数转换后的丰...
处理16s测序数据时,相信很多同学已经看倦了常见的Alpha、Beta多样性分析,PCA分析之类,那么除了这些标准内容,我们还能做些什么呢? 此前,我们介绍了如何进行网站在线OTU互作网络分析——OTU互作网络分析用MENA,而今天...
...网站进一步鉴定自己搜索到的基因家族成员,从而进一步筛选鉴定结果。
老师我想问下这样的数据RNA降解图怎么解释
...家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...
箱线图,又称盒形图,常用来展示数据的整体分布情况,也是目前科研论文中经常出现的一类图形。标准的箱线图包含几个重要的元素,如下图所示,包括下四分位数(第25%数据的大小)、上四分位数(75%数据的大小)、中位数...
BSA数据在哪里下载呢?
...文章) 那么在Excel中如何快速添加呢? 以下图中的测量数据的均值(Excel函数:AVERAGE计算)绘制出A、B、C处理结果的柱状图,如何在柱状图上添加误差线呢?以标准差计算为例:1、 在Excel中选中对应的单元格,插入函数进行...
1、Vennerable包绘图过程 是由Venn函数 对各组数据构成的列表 进行处理返回一个Venn 对象,该对象是s4 譬如: library(Vennerable)data(StemCell)w <- Venn(Sets=StemCell[1:2])plot(w, type="squares") 查看w显示其为Venn object: > wA Venn object o...
利用grep 筛选两个文件中共有的信息 N.txt cat N.txtZm00001d003640_P001Zm00001d003640_P002Zm00001d003640_P003Zm00001d010870_P001Zm00001d011034_P001 C.txt cat C.txtZm00001d003640_P001Zm00001d003640_P002Zm00001d003640_P003Zm00001d010870_P001Zm00001d011035_P001 N.txt 和C.txt 的交集gre...
...网络进行分析(Analyze the networks),其中一项是结合性状数据,又或者说环境性状(因子)进行联合分析。 其主要步骤如下: 1、 点击网页左侧Analyze the networks 进入分析页面,点击选择进行OTU与环境因子相关性等计算,如下图...
...化树构建,还是要像w.sh文件里面一样用脚本对文件进行筛选啊。
...不一样,在这种情况下应该以什么标准来选择下载哪一组数据进行分析呢?大家有什么经验没啊