蛋白质分析，经常要分析蛋白质的保守结构域，通常要展示多序列比对结果才能说明不同序列间的保守性；看到别人分析的蛋白保守结构域都有一个漂亮的多序列比对结果；今天我们就来介绍绘制这种氨基酸比对图： 1. 获得...
老师，请问我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图，我上传了两个文件，第一个文件是图一，第二个文件是图二，我不想用OTU的ID号做分析相，想做门水平的细菌，第二个表是抗性基因的数据，想观察抗性基因和门水平菌的...
mcscanX可以分析基因组内的共线性，分析详情见：mcscanX安装与使用;会输出很多文件,这里给大家解释一下，方便从结果文件中找到想要的信息： 1.T.tandem 基因组内所有的串联重复基因对 2.T.collinearity 基因组内所有的共线性...
...程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学...
...很多生物科研工作者都接触了基因组相关实验。在做数据分析的时候，会用到一个很重要的文件，就是基因组的注释文件，也就是今天分享内容的主角GFF文件！ 什么是GFF文件 GFF格式是Sanger研究所定义，是一种简单的、方...
OTU分析按照视频中方法一(pick_de_novo_otus.py)做的，显示usearch版本不对
木薯NBS基因家族分析原文献下载：木薯基因家族文章.pdf 日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决： 1. 单细胞/空间转录组正在大...
老师，您好！ 我正在学习基因家族分析，用meme搜索蛋白质的motif，-nmotifs设置为10， 但是网页上只显示了5个且motif location里面没有图片显示，而用tb-tools打开.xlm文件里面有10个 请问导致网页与Tb-tools结果不一致的原因是什么呀...
...到2维中。二者的差别如下图： （图片源自 ggplot2: 数据分析与图形艺术） 以内置数据mpg 演示 facet_wrap() 使用 ，设置形式 ~ a + b +c 同时可以基于nrow , ncol 修改默认设置 library(ggplot2)> data(mpg)> print(mpg)# A tibble: 234 x ...
... BAM 文件进行排序，ReorderSam 重新排序读取 SAM/BAM 文件以匹配提供的引用文件中的重叠群顺序，由确切的名称匹配确定的重叠群。 映射到新引用中不存在的重叠群的读取将取消映射。 （2）排序前后文件大小变化 我们对bam文件...
...ALSE) to see 1 hidden frame. monocle2 igraph 报错 这是由于igraph 版本高，导致 monocle2 与igraph版本冲突报错，这个问题需要 更改 monocle2的源代码 才能适应高版本的igraph。 这是修改好的monocle2 R包： 链接: https://pan.baidu.com/s/18EMB-uDo0FpOxG...
1 、Nr：NCBI非冗余蛋白数据库，包含的信息很全面, 注释到的基因较多。 2、COG ：中文释义即“同源蛋白簇”。COG 分为两类，一类是原核生物的，另一类是真核生物。原核生物的一般称为 COG 数据库；真核生物的一般称为 KOG 数...
... 内置的讨论功能可以设定成员，实现小组的在线讨论，如需相关信息直接在论坛查找，而不是都在一个渠道比如邮箱之类的，混杂在一起很难管理。 使用Wiki可以快速打造内网，在成员间共享项目的材料，...