...进行t.test,如果写成循环,运算速度非常慢,可以利用apply()函数辅助完成计算过程。 譬如有如下数据,共2000行6列,对A组数据和B组数据进行t.test计算: > head(data,2) A1 A2 A3 B1 ...
...:tandem duplication和segmental duplication的区别与联系,关于这个问题的解答,我已经在我们组学大讲堂问答网站上进行了详细回答,感兴趣的可以到 www.omicsclass.com 网站上搜索关键词“tandem”就可以得到详细答案,我这里就不详细介...
...-9 应该是运行内存不够,目前是1T运存,是否可以分成几个批次组装,然后合并组装后的final.contigs文件,再去冗余,这样可行吗
...之中为学生答疑解惑。使用mininum snps分析时最终会产生两个结果对应两个txt文件,软件左侧Sets of MinimumSNPs found应该对应使用标记的个数和鉴别效率。然后总共32个标记却产生了35和44的结果。txt结果文件表明使用7个标记时鉴别效...
Perl有个内置函数叫做sort毫无疑问的可以排序一个数组。 其最简单的形式是传递一个数组,它会返回排序后的元素组成的数组。@sorted = sort @original。 基于ASCII码排序 #!/usr/bin/perl use strict; use warnings; use 5.010; use Data::Dumper qw(Dumper)...
...ar 是变量名,# 号是运算符,*// 表示从左边开始删除第一个 // 号及左边的所有字符即删除 http://结果是 :www.omicsclass.com/123.htm2. ## 号截取,删除左边字符,保留右边字符。echo ${var##*/}##*/ 表示从左边开始删除最后(最右边)一个 ...
...局和临床治疗敏感性。免疫浸润也是近几年肿瘤研究的一个重要方向。 解读文献: 研究背景: 随着人类基因测序的发展,基于基因的生物标志物预测患者的预后变得越来越流行。随着免疫疗法的凯歌不断奏响,如何快速...
... A B C D E F G 可获得基础初始网络如下(E独立出现): 如果单纯从Cytoscape识别的数据文件去理解,很多人以为这样两列格式的对应关系,显示的是一个二元关系网络? 三元...
...k" exit fi mkdir 04.time_tree_pep cd 04.time_tree_pep #选择一个满意的树 ln -s ../03.Phylo_Tree/raxml.cds.raxml.support species.tre #准备数据 ln -s ../03.Phylo_Tree/single_copy.cds_msa.4d.fasta . ln -s ../03.Phylo_Tree/single_copy.cds_msa.fasta . ln -s ../03.Phylo_Tree...
...选择表达数据探针对应的探针注释文件 点击上图第一个Show会出现下图界面,可以设置更多参数: 第一个箭头:可以设置结果文件名称 第二个箭头:计算差异度量时采用的算发,默认Signal2Noise 第三个箭头和第四个箭头是过...
...-9 应该是运行内存不够,目前是1T运存,是否可以分成几个批次组装,然后合并各个批次组装后的final.contigs文件,再去冗余,之后再进行基因预测或者分箱的操作这样可行吗
...rthamus_tinctorius_L_via_Whole_Genome_Re-sequencing),该草图仅建一个小片段文库,测序深度21×,参考价值较差;红花主要有效成分为黄酮类次生代谢物。所以本文作者利用三代全长转录组主要是鉴定与红花黄酮类次生代谢物合成相关的...