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文章 Linux中用户组的管理:添加、修改 删除

...保留账号,可以指定UID,例:useradd –u 600 user3 2、使用 passwd 命令为新建用户设置密码 例:passwd user1注意:没有设置密码的用户不能使用。 3、命令 usermod 修改用户账户 例:将用户 user1的登录名改为 u1, usermod –l u1 user1 1 ...

文章 linux命令之cp

cp命令目录基本操作 cp命令用来将一或多源文件或者目录复制到指定的目的文件或目录。它可以将单源文件复制成一指定文件名的具体的文件或一已经存在的目录下。cp命令还支持同时复制多文件,当一次复制多...

问题 Error running system command:

...snp.refGene.logsnp,refGene.variant functionsnp,refGene,exonic variant这几大小为0,运行提示如下NOTICE: Running with system command <convert2annovar.pl  -includeinfo -allsample -withfreq -format vcf4 /work/my_reseq/4.snp_indel/all.clean.snp.vcf.gz &gt; /work/my_reseq/5.var_ann/snp.a...

文章 ELISA实验做不好怎么办?QuicKey ELISA试剂盒来帮你!

...验室有自动洗板机还好,要是手动洗板的小伙伴,一次来几块甚至十几块板子,拍板那痛啊,说多了都是泪。 而Elabscience的QuicKey ELISA试剂盒,在常规夹心法试剂盒的基础上,减少了实验操作步骤,仅需两次洗涤、三次孵...

问题 请教一问题:linux的文件中文件没有末尾结束符用vi打开地段会显示[noeol],虽然只要把这文件wq保存后,vim会自动添加末尾结束符。可是现在我有10000文件,我肯定不能一的打开保存,批量给文件添加末尾换行符也没用,我还怎么办?救急救急

问题 使用GSDS来可视化基因的顺势作用元件,发现有些元件显示不出来。只能修改那些元件颜色和形状,不能移动元件标识。用那GSDS自带的edit功能,进去之后之前修改的元件形状又变成修改之前的样子,edit只能移动不会修改元件颜色和形状,也不会保存到本地。请老师给想办法?

问题 WGCNA样本必须至少15吗?

WGCNA样本必须至少15基因吗?我有三处理,每处理三重复,供9样本,这样可以做WGCNA吗?这样做出来有意义吗

问题 基因家族成员如何取舍,命名?如何查找外显子和内含子结构?

...的家族基因序列,用于本地blast我的转录组数据,获得62含结构域的基因。通过CDD-search确定其中46基因含有完整的结构域,但有16基因只有部分结构,如图,黄色标记的是含部分结构域的基因。这些基因我怎么取舍呢? ...

文章 Seqkit,一款好用的蛋白质翻译软件

...件提取序列 seqkit subseq -r 1:12 x.fasta #提取每条序列的前12核苷酸 fastq到fasta的格式转换: seqkit fq2fa x.fq.gz -o x.fa.gz 以及建索引: seqkit faidx x.fa 查看fq文件: seqkit seq x.fq.gz 序列位点突变 seqkit mutate -p -1:x --quiet x.fasta #突变每...

问题 conet构建网络图

您好,我想问一下,在用cytoscape的conet绘制otu网络图,目的是为了探究抗性基因与微生物群落co-occurrence关系,至少要几微生物样本结果才是可信的呢?只有5样本可以作出来吗?

文章 Python学习-利用Python对植物基因组注释文件(gff3格式)进行处理

...的版本信息,第三列通常为gene,mRNA,CDS等信息,同时一基因可能对应多mRNA,对生物有些了解的也知道,一mRNA即是一转录信息, 这和注释过后的序列文件也是一一对应的。第四列和第五列分别为基因的第三列信息在...

问题 寻找合适做分析的基因家族

老师您好,我看了这文章,鉴定了9物种,后面的生理实验只用了葡萄一种,我可以选择其他八物种中的一再进行鉴定和后续的实验吗

问题 请问老师用McscanX做基因组内共线性分析,在准备family.ctl文件时,对染色体编号有撒要求没,我的染色体编号中还有chrA01,chrC01,以及chrA01_random,以及 chrAnn_random,我看有人说染色体编号只能有2字母加数字,谢谢!

问题 老师 就是 我在过滤数据的时候 下面截屏中利用vcfutils.pl进行过滤的时候 生成的文件还有7.2 Gb,但是用vcftools进行过滤后还剩764Mb的文件,这是不是过滤掉的太多啦呀 麻烦您重新帮我设置一过滤参数嘛 谢谢我重测序的体才36

文章 一文教你使用Excel画GO富集分析图

...果文件中一般都会有GO_enrich.xls的文件,该文件一般在每差异组合的差异分析结果文件夹下。打开后格式大致如下图所示,各公司稍有不同,图上红色箭头所指的列应该都有,这几列分别是:Term_type、Description、Corrected_P-value...