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因为这个家族只在拟南芥里鉴定过，只有18个成员，我做的亚族只有4个成员。现在拟南芥和大麦构建进化树的结果没法做比较
使用说明： metadata中按列分组，做差异比较分析，可以利用 merge_tsv_files.r 或者 merge_metadata_genexpdata.r 将比较的信息合并到metadata中： usage: /share/nas1/huangls/test/TCGA_immu/scripts/compare_stat_boxplot.r [-h] -m filepath -v variate [...
高通量测序这几年比较热门，蛋白质组学也慢慢火起来了。 那么分析蛋白质组的数据的软件，那个值得推荐呢？ 我查询了不少资料，发现不少蛋白质组分析软件都偏向于收费，而且很多都是windows上运行。在众多软件中，我比...
...nknown", text, skipNul = FALSE) 每个参数都有自己的意义，其中比较常用的有header,sep等. file是我们读入的文件名称；header，设置为T或F,是否把第一行定义为header；sep是设置文件内的分隔符。我们看个例子： mydata <- read.table("read.table")...
...会犯“有病看成无病”或者“无病看成有病’的错误，相比较而言，“无病看成有病“的错误更严重，故应将“问诊人有病”作为原假设。而在某项疾病普查中，将“被检查人有病’作为原假设就不恰当了。 假设检验是统计分...
...站 GOrilla: http://cbl-gorilla.cs.technion.ac.il/ 可以针对几种比较常见的动植物进行GO富集分析。 1、第一步是选定物种，下拉列表中的物种涉及了以下几种： Arabidopsis thaliana 拟南芥Saccharomyces cerevisiae 酿酒...
...的应用过程中，其纯度对于酶切、PCR扩增等实验结果有着比较大的影响，因此需要保证质粒DNA提取的纯度和效率。 在细菌中提取质粒DNA通常按照以下步骤进行: 第一步，培养细菌，使质粒扩增; 第二步，进行...
...刊是“皇帝女儿不愁嫁”，稿源丰富，相应地拒稿率也会比较高。通常情况下，一般期刊的接受率会在10%-30%，40%以上就是相当友好的期刊了，期刊不同，数字也会有所浮动。可以在投稿前将摘要发送给期刊主编，询问主题是否...
...？MEGA能满足这一分析的绝大部需求。 MEGA是已经大家都比较了解的一个分子进化遗传分析的软件，所以今天其实是来卖安利的。告诉大家利用它能干群体遗传进化相关的哪些事儿。 第一步：Align 建立一个align是进行多序列...
比较两组不同数据时，每组分别设置了四个生物学重复，那么比较这两组数据的差异蛋白时应该怎么把这些生物学重复的数据归一呢？还是要对其中的每一对生物学重复组分别进行比较？
老师好，我在做课时20 比较基因组学分析时 在/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH Zj --cscore=0.7这一步出错，没有生成anchors文件，请老师指点bed与cds名字也是对应的 这是唯一生成的一个文件last 请老师指...
...，分别构建了拟南芥MYB和木麻黄MYB家族基因系统发育树，比较发现木麻黄MYB分群和拟南芥中MYB分群具有较高的一致性，如下图： 3. 木麻黄MYB基因结构和Motif分析 作者进一步分析MYB家族基因的Motif，并按不同分群分别介绍了相...