文章 grep 两个文件内容取交集

利用grep 筛选两个文件中共有的信息 N.txt cat N.txtZm00001d003640_P001Zm00001d003640_P002Zm00001d003640_P003Zm00001d010870_P001Zm00001d011034_P001 C.txt cat C.txtZm00001d003640_P001Zm00001d003640_P002Zm00001d003640_P003Zm00001d010870_P001Zm00001d011035_P001 N.txt 和C.txt 的交集gre...

文章 exprs.MA函数提取MAList芯片红绿强度（表达量）

limma包进行双通道芯片分析过程，基于原始数据可以通过校正标准化获得对象MAList，其中存放了M值和A值，可以利用exprs.MA将MAList转换成红绿荧光强度值（已经对数转化log2），每个芯片都将有两列数据，一列对应R(红）一列对应G(...

文章 Excel数据分析技巧之双因素方差分析

...项--转到--加载宏--分析工具库--确定。具体可以参考Excel数据分析技巧之方差分析。  02  打开excel表（版本为 Excel2010），输入需要分析的数据，本次演示的数据是温度和PH值对水稻种子萌发率的影响。在这里，我们没有设置...

问题 hgmd,omim,lovd数据库

老师 能分享一下最新的这几个数据库的下载数据吗，多谢多谢

问题 如何从TCGA下载长链非编码RNA的数据？

一些文章中说长链非编码RNA的表达数据是从TCGA数据库中下载的，请问如何下载lncRNA的数据？

文章 R包更新网站

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 GDCRNATools一个TCGA数据分析的全能选手

GDCRNATools：软件是一个分析TCGA数据的全能选手，其功能覆盖了TCGA数据的下载，分析以及结果的可视化，具体的如下图所示 如果您对TCGA数据挖掘感兴趣，请学习我的TCGA系列课程： 《TCGA-生存分析》《TCGA-基因差异表达分析...

文章 微生物互作网络构建教程网站--Microbial association network construction tutorial

基于微生物16s测序数据中的OTU丰度矩阵可以进行微生物互作网络构建，从而探索微生物之间的互作关系。而网络的构建方法多种多样，下面给大家推荐一个网站，Microbial association network construction tutorial （打开链接可以点这里）...

问题 您好，我想问一下关于《基因家族鉴定分析操作手册》当中2.3blast的问题

...化树构建，还是要像w.sh文件里面一样用脚本对文件进行筛选啊。

问题 基因组数据的下载

在Ensembl和phytozome（JGI）上都找不到要下载的物种的基因组数据怎么办，在NCBI上下载数据（gff、gene、protein、CDS）的话是不是就不适用于课程的分析脚本和方法了呀

问题 黄老师，怎么利用BSA测序的数据的双亲和子代池的重测序数据设计KASP标记，有没有这方面的脚本可供学习

最近在分析BSA数据，然后获得区间后需要根据候选区间进行KASP标记的设计，然后向老师请教一下方法，以及或者这方面的课程

问题 老师 在做WGCNA分析中，只有一份表达数据 没有性状数据。。能仅继续做共表达分析吗 应该略过哪段代码

问题 请教一下，基因组hifi数据组装可不可以用一个近缘品种的Hi-C数据进行辅助拼装和染色体挂载

问题 mapman数据NA等的处理

老师，请问转录组数据用log2FC做mapman分析，数据中的NA， #NAME？，inf 等字符应该怎么处理呢？谢谢

问题 请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量

我有几个不同浓度胁迫下的转录组数据，想利用此数据分析一下某基因家族，请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量？