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问题 TCGA分析

TCGA筛选出来的差异基因绘制火山图的时候出现这样的提示,是什么原因呢?怎么解决,对后面分析有影响吗?

文章 TCGA数据库中临床样品编号详解(Barcode)

... BCR从TSS收到参与者的样本和他们相关的元数据。然后BCRs分配人可读的IDs(barcode),也就是TCGA barcode给参与者的元数据和样本。TCGA barcode用来把扩展到整个TCGA网络中的数据联系在一起,因为IDs可以唯一识别一个特定样本的一...

问题 一个家族基因隐马尔科夫模型

请问老师,如何确定搜索到得模型是可以用得?是模式生物得?还是同源物种得?

问题 vcf合并

...,一部分是自己测的,现在做到gvcf了,还有一部分是从发表的文章中的vcf文件里提取出来一部分,参考基因组是相同。我的困难是怎么把这两部分数据做成一个整个的vcf,网上那个是按染色体(chr1、chr2)分的,一个染色体一个v...

问题 vlookup使用

老师您好,我做PPI图时,按照视屏教学中的步骤使用的vlookup,但筛选不出结果,请问是excel的问题还是其他什么原因?

文章 一秒让你读懂 DevOps 的本质及行业现状与趋势

...时间内开发并交付。 在CORNERSTONE任务模块里,任务分配给谁,就会是谁的责任。而且任务支持多责任人与子任务关联,所有的任务和状态都会体现在任务模块里,这个任务过程中的参与人员随时知道任务的状态和目前碰到...

问题 用linux绘制circos图出现问题

最后绘图输入命令 perl /home/manager/share1/script/circos.pl --chr chr_length.txt --circle link.txt --type link --circle text.txt --type text  --od circose1 但显示出现如下问题 注:bio-linux版本更新 请求老师帮助指点

问题 家族基因鉴定

老师您好!再按照基因家族分析视频的步骤建立了物种特异的NBs-LRR.hmm后再次进行NBs-LRR的搜索时,出现Error: TC bit thresholds unavailable on model SES208_domain。 操作步骤都是按视频上来的,为什么会出现这种情况呢?

文章 一文教你使用Excel画GO富集分析图

...一般是前20位富集程度最高的GO条目,没有经过qvalue值的筛选。如果你想筛选一下qvalue值或者其他参数再做GO富集分析图,那么请继续往下看。小编为您讲解如何使用Excel画GO富集分析图。 数据文件准备 转录组测序分析的结果...

问题 为什么win10安装mapman,显示无法安装,版本不符

安装java10,并设置环境变量,点击mapman的exe程序,显示该程序版本不适合windows系统,请与开发者联系。

问题 关于挂载共享文件夹失败

如图,按照课程挂载共享文件夹后,ll搜索验证,Windows系统下文件夹有的,在终端这里还是没有看到,请问这会是什么原因呢,麻烦老师了!非常感谢1

文章 vif.cca 筛选环境变量:VIF是非常有用的指示符,表明数据集中存在多重共线性。 它不能很好地指示应从模型中删除哪个预测变量。

原文地址: https://quantpalaeo.wordpress.com/2014/04/14/variance-inflation-factors-and-ordination-model-selection/ Variance inflation factors and ordination model selection Posted on 14/04/2014by richard telford Variance inflation factors (VIF) give a measure of the extent of multico...

文章 silva做菌种鉴定

...:    https://www.arb-silva.de/ 菌种鉴定方法: 1.选择序列搜索。 2.输入fasta格式的序列 3.搜索结果如下,可将结果导出,方便查看。 此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下: 1. 文章越来...

文章 CAR-T疗法:综合概述及临床应用

...员,在恶性浆细胞中高表达。调节B细胞增殖和存活。它成为抗体药物偶联物、双特异性抗体、嵌合抗原受体T细胞疗法和其他多发性硬化骨髓瘤免疫治疗的关键靶点。   CAR-T细胞可以靶向B细胞肿瘤上的另一种过表达抗原CD22。...

问题 关于TCGA的下载,学了课程还是遇到点问题,求老师指点

...直肠癌,并且要腺癌的样本数据,有点复杂,这是我网页筛选条件,代码不知道怎么写。 看了论坛里老师筛选原发位点的帖子 我想先根据原发位点筛一下 > library(GenomicDataCommons) > resp = cases() %>% filter(~ {project.project_id...