文章 漫威英雄人物的基因改造，离我们还远吗？

...发关于基因编辑的文章，还是有可能的！ crispr/cas9文库筛选服务—高分论文利器! 巴菲尔crispr/cas9文库筛选服务可以完成精准sgRNA序列的设计并精确人工合成，在基因敲除成功后，对测序结果进行基因表达谱分析、染色体DNA拷贝...

问题 外泌体检测方法

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 Scanpy数据结构：AnnData

AnnData是python中存储单细胞数据的一种格式 1. AnnData数据结构： 主要包含四个slots：X（数据矩阵）： 存储单细胞数据的核心矩阵，通常是一个二维数组，其中行表示细胞，列表示特征（基因或其他测量值）。obs（观测信息）： ...

文章 agilent表达谱芯片注释信息提取

1、GEO数据库中  agilent表达谱芯片由与其设计往往比较个性化，涉及的芯片型号很多，使用的Cy5/Cy3的双色芯片 或者仅使用Cy3的单色芯片，数据上比较混乱，而GEO中提供的GPL信息文件格式和affymetrix  、illumina 的表达谱芯片对应的G...

问题 转录组测序数据分析哪个公司做的好？刚拿到测序原始数据，但本人对此一窍不通，想找公司/人做...

问题 请问各位大神，有没有公共服务器（大家交钱的那种），大家可以用来处理高通量测序数据，跑测序数据啊等等

问题 GSDS 报错总是提示第一列数据输入有错，难道基因名称是必须从特定的数据库下载么？

文章 awk匹配替换gsub

...sub(A,B)在$0中利用B替换A gsub(A,B,C)在指定的C中用B替换A 以数据test为例（TAB分隔）： ABCD    abcd    HJIKEL  AbDE    SGWA 全部替换 A字符换成DA字符 awk -F "\t" '{gsub("A","DA");print $0}' test 结果： DABCD   abcd    HJIKEL  DA...

文章 Pacbio Sequel 下机数据介绍

Pacbio Sequel 下机数据， 一般包括如下几个数据： m54134_180724_220656.scraps.bam m54134_180724_220656.subreads.bam m54134_180724_220656.scraps.bam.pbi m54134_180724_220656.subreads.bam.pbi m54134_180724_220656.baz2bam_1.log m54134_180724_220656.sts.xml m54134_180724_220656.subreadset...

问题 老师您好，我本来打算做BSA，因为担心BSA定位区间过多，所以对F2群体中极端个体各40株进行了单株测序，现在打算拿这个数据做一下BSA相关分析，请问如何利用单株测序数据模拟混池测序数据呢，麻烦您了

文章 endnote 插入文献 变成临时 大括号{} 不自动更新文献

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 aggregate对数据分组处理

aggregate这个函数的功能比较强大，它首先将数据进行分组（按行），然后对每一组数据进行函数统计，根据数据对象不同它有三种用法，分别应用于数据框（data.frame）、公式（formula）和时间序列（ts）： aggregate(x, by, FUN, ..., si...

文章 maftools|突变数据可视化-瀑布图绘制及脚本使用

...受并用于存储体细胞变异情况。由体细胞变异组成的结果数据以突变注释格式存储。只要数据为MAF格式，maftools包便可以高效的方式汇总、分析、注释和可视化。这次主要介绍使用maftools包绘制组学突变结果（MAF）的oncoplot（瀑布...

问题 原始数据标准化以后做的DEG跟原始数据直接做的DEG不一样，做标准化的意义是什么？

问题 GEO数据库下载问题：我想要的GSE数据对应的GPL里面没有Annotation SOFT table怎么办？