文章 植物转录因子基因家族分类及对应的pfam号

...里有关于植物转录因子基因家族的对应的Pfam查询表： 数据来源：http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/help_famschema.php  或者：http://planttfdb.gao-lab.org/ 更多可观看《基因家族分析实操课程》学习1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基...

文章 DNA SequenceLogo

...家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA...

文章 R语言中的回归分析公式中各种符号的含义

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

问题 单细胞测序得出蛋白表达如何与GEO data已发表的数据进行比对以验证数据的有效性

问题 mapman导入自己的转录组数据，从网站上下载了数据分析时用的参考物种的mapping数据，但使用时显示data does not fit mapping used(no data points mapped)! 请问该怎么解决？谢谢

文章 关于基因家族成员构建进化树时报错如何处理！

...网站进一步鉴定自己搜索到的基因家族成员，从而进一步筛选鉴定结果。

文章 Scanpy数据结构：AnnData

AnnData是python中存储单细胞数据的一种格式 1. AnnData数据结构： 主要包含四个slots：X（数据矩阵）： 存储单细胞数据的核心矩阵，通常是一个二维数组，其中行表示细胞，列表示特征（基因或其他测量值）。obs（观测信息）： ...

文章 agilent表达谱芯片注释信息提取

1、GEO数据库中  agilent表达谱芯片由与其设计往往比较个性化，涉及的芯片型号很多，使用的Cy5/Cy3的双色芯片 或者仅使用Cy3的单色芯片，数据上比较混乱，而GEO中提供的GPL信息文件格式和affymetrix  、illumina 的表达谱芯片对应的G...

问题 外泌体检测方法

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 基因家族分析如何能发到cells？！

...基因组中，总共鉴定出35个TaPHT1，结合作者从Phytozome或NCBI数据库中收集了16种植物的109种PHT1蛋白质的序列，及一个酵母蛋白，共145个PHT1基因蛋白构建系统发育树；PHT1蛋白分为八个亚家族（I，II，III，IV，V，VI，VII和VIII组），小...

文章 grep 两个文件内容取交集

利用grep 筛选两个文件中共有的信息 N.txt cat N.txtZm00001d003640_P001Zm00001d003640_P002Zm00001d003640_P003Zm00001d010870_P001Zm00001d011034_P001 C.txt cat C.txtZm00001d003640_P001Zm00001d003640_P002Zm00001d003640_P003Zm00001d010870_P001Zm00001d011035_P001 N.txt 和C.txt 的交集gre...

问题 转录组测序数据分析哪个公司做的好？刚拿到测序原始数据，但本人对此一窍不通，想找公司/人做...

问题 请问各位大神，有没有公共服务器（大家交钱的那种），大家可以用来处理高通量测序数据，跑测序数据啊等等

问题 GSDS 报错总是提示第一列数据输入有错，难道基因名称是必须从特定的数据库下载么？

文章 awk匹配替换gsub

...sub(A,B)在$0中利用B替换A gsub(A,B,C)在指定的C中用B替换A 以数据test为例（TAB分隔）： ABCD    abcd    HJIKEL  AbDE    SGWA 全部替换 A字符换成DA字符 awk -F "\t" '{gsub("A","DA");print $0}' test 结果： DABCD   abcd    HJIKEL  DA...