找到约 15 条结果

文章 R| set.seed()作用使随机结果具有复现性

...似回答:https://stackoverflow.com/questions/23511853/set-seed-function-what-is-the-best-value-for-setting-a-seed 种子的唯一真正好处是使随机结果具有复现性。至于seed数值的设置一般来说没有偏好。它们只是为伪随机生成器提供一个具体的种子,而...

文章 保姆式教程!手把手教你使用Simplot,绘制高大上的序列相似性图片

...很美观!!! 参考文献: 《Monsavirus in monkey rectal swab and throat swab specimens in China: Proposal for Posaliviridae as a new family in Picornavirales》; Han Z, Song Y, Xiao J, Zhao X, Lu H, Zhang K, Jia S, Zhou J, Li J, Si F, Sun Q, Zhu S, Wang D, Yan D, Xu W, Fu X, Zhang Y. ...

文章 快速解读:3-5分的蛋白质组学文章思路

...iu J, Sui Y, Chen H, et al. Proteomic Analysis of Kiwifruit in Response to the Postharvest Pathogen, Botrytis cinerea[J]. Frontiers in Plant Science, 2018, 9: 158.

文章 Horticulture Research | 基因组变异揭示了莲花的种群历史和生物适应性

...Genomic variation reveals demographic history and biological adaptation of the ancient relictual, lotus (Nelumbo Adans.)”。该论文组装了高质量的‘太空莲3号’基因组,研究了莲突变积累系(MA)的基因组变异,并基于野莲资源的重测序数据重建了野莲群...

文章 遗传图谱构建基础知识

...完全连锁重组率r=0.5时,不连锁 LOD值 概念:LOD = Log of the likelihood odds ratio ,估计值在观察结果中出现的这种概率的可能性。用来反映重组率估计值的可靠性程度或作为连锁是否真实存在的一种判断尺度。计算公式:LOD=Log10(L(r)/...

文章 OthroFinder-物种同源基因分析工作原理

Orthofinder是做直系同源基因分析时常用软件,除此之外,还可以使用OrthoMCL,今天主要介绍Orthofinder软件的工作流程。 1. Orthofinder发表的工作流程如上图:     1.1 (a)将所有物种的全部蛋白序列通过序列比对和调用MCL聚类实...

问题 tassel计算PCA

ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - Index 436980866 out of bounds for length 436980866

问题 tassel 计算PCA

 ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - Index 436980866 out of bounds for length 436980866

文章 iTOL修改进化树的标签基因ID名称

...文件即可,文件格式如下: LABELS#use this template to change the leaf labels, or define/change the internal node names (displayed in mouseover popups)#lines starting with a hash are comments and ignored during parsing#=================================================================##  ...

文章 遗传图谱构建基础知识

...完全连锁重组率r=0.5时,不连锁 LOD值 概念:LOD = Log of the likelihood odds ratio ,估计值在观察结果中出现的这种概率的可能性。用来反映重组率估计值的可靠性程度或作为连锁是否真实存在的一种判断尺度。计算公式:LOD=Log10(L(r)/...

文章 批量邮件推送python代码模板,可支持html邮件格式

...    <title>Tutsplus Email Newsletter</title>   <style type="text/css">    a {color: #d80a3e;}  body, #header h1, #header h2, p {margin: 0; padding: 0;}  #main {border: 1px solid #cfcece;}  img {display: block;}  #top-message p, #bottom p {color: #3f4042; font-size: 12px;...

文章 几个样品的转录组文章很难发了?这篇文章一定能给您启示

...tomeprofiling of Salvia miltiorrhiza fordiscovery of genes associated with the biosynthesis of tanshinones and phenolicacids[J]. Scientific Reports, 2017, 7(1):10554.

文章 topGO报错

...s) <- names(termsNames)                    ## return NAs for the terms that are not found in the DB and make sure the 'names' attribute is as specified          shortNames <- shortNames[whichTerms]          names(shortNames) <- whichTerms                    r...

问题 重测序

我把命令放到sh 中运行后显示日志错误 2.data_qc.sh: line 23: syntax error: unexpected end of file, 附件是命令2.data_qc.sh 1ea1d5175cd7f119f2635ceb660d9e2.jpg

文章 小尺度的种群历史分析——∂a∂i原理解析

...群体多样性的文章 “A genomic variation map provides insights into the genetic basis of cucumber domestication and diversity”,在这个文章中,作者对来自印度、西双版纳、欧洲和东亚四个地方的黄瓜进行了种群分化的研究,同时通过遗传多样性和选...