找到约 15 条结果

文章 bcftools创建vcf索引失败

在使用bcftools创建vcf索引,如果染色体长度大于512MB时会失败,报错信息: 可以换用tabix 创建索引,命令如下: tabix -p vcf filter2.vcf.gz

问题 TCGA下载数据更改了工作目录

各位老师:TCGA下载数据下载了一半,又改了另外一个工作目录,结果出现下面信息,如何解决?谢谢了!

问题 基因家族分析:基因结构

老师,您好!我分别用了GSDS2.0和TBtools分别做了基因结构图,GSDS图里没有展示UTR区,TBtools里面有展示,这种情况我应该用哪个图呢? 下面是我的gff信息和结构图

文章 如何计算基因组中的连锁不平衡

...,每一行为一个LD block,包含了block里面的所有snp位点的id信息,该文件为.blocks结尾:然后是更详细的LD blocks结果文件(后缀为.blocks.det),里面的信息更全面一些,包含了每个block的起始和终止snp位点的位置信息,以及block的长...

文章 蛋白定量-Maxquant软件输出结果说明

...文件。另外summary.txt文件记录了所有原始数据文件的总体信息;evidence.txt文件记录了已鉴定肽段的所有信息。每个文件的列数(表头)都很多,就不一一列举了,需详细了解的同学可自行查阅结果中tables.pdf文件,所有文件都有详...

文章 生物汪看《疯狂的外星人》,心真累!

...”基因求“在口腔里打转,保持15分钟,这样人类的基因信息就能存储在”基因球“里了,外星人回收“基因球”,就可以获取人类的基因组信息了。 女朋友在旁惊呼“真神奇”! 不过,对于小编这样一个在测序行业摸爬滚打...

文章 TCGAbiolinks 错误 Error in value[[3L]](cond) : GDC server down, try to use this package later

...ndle) : SSL certificate problem: Invalid certificate chain 从返回的信息看,是由于GDC网站的证书有问题。 2. 直接访问GDC的API站点,查看状态信息     站点地址:https://gdc-api.nci.nih.gov/status/   遇到这样的问题,只能采用GDC的页面和数据...

文章 转录组数据分析

...基因组研究的 一项重要内容。转录组是连接基因组遗传信息与生物功能 (蛋白质组)的必然纽带.   

问题 docker安装失败

您好!昨天可能是因为改变了path 或是清理了C盘 还是啥原因 docker打开后 cmd命令不能运行 我就把docker卸了 重装老是失败 提示信息如图 想问问原因在哪 第一次安装完运行一直还可以 我的是win10家庭版 安装过程是严格按教程来的

文章 综合转录组学和代谢组学分析揭示了菜豆响应冷胁迫的关键调控网络

...借助液相色谱质谱仪(LS-MS)检测不同样本中代谢物数据信息。LS-MS共检测到18166种代谢物。最后注释到7670种代谢物。之后对代谢物进行聚类分析和PCA分析。(图ac为正离子模式下检测到的代谢物、图bd为负离子模式下检测到的代...

问题 《微生物宏基因组分析实操》课程,配制分析环境(doc.sh)遇到Bug

...学大讲堂服务器上进行操作,输入“. doc.sh”,出现报错信息“? Please select an image:   ▸ docker.io/omicsclass/metagenomics:v1.0    quay.io/omicsclass/metagenomics:v1.0” 我在doc.sh文件代码中输入第一个镜像,可以启动docker pull进行镜像下载,但...

问题 《微生物宏基因组分析实操》课程,配制分析环境(doc.sh)遇到Bug

...学大讲堂服务器上进行操作,输入“. doc.sh”,出现报错信息“? Please select an image:   ▸ docker.io/omicsclass/metagenomics:v1.0    quay.io/omicsclass/metagenomics:v1.0” 我在doc.sh文件代码中输入第一个镜像,可以启动docker pull进行镜像下载...

文章 双通道芯片MA和density

...片数据挖掘、GEO芯片数据标准化、R语言画图 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 核苷酸多样性π的计算

... (SNP / InDel)的文件格式,主体部分每一行代表一个variant的信息,包含10列以上的数据,第10列及之后记录样本的基因型信息。 群体分类文件 :记录某个群体的样本ID,ID需与vcf文件中的ID一致。 2.运行指令 软件:vcftools 命令...

问题 R语言中$符号和@符号取值区别?

想得到Vennerable绘制韦恩图,每一个交叉位置对应的ID信息,不知道怎么取得?