...样本的基因，lncRNA,和miRNA表达数据，进行差异表达分析，筛选差异表达的分子。 差异表达的火山图如下： 差异表达聚类热图如下： 3. 生存分析 3.1 单因素生存分析 基于差异表达的结果，分别针对差异表达的分子与临...
输入数据： 代码部分，筛选基因也可以参照另一篇文章，而不一定是选取200个变化最大的基因，R筛选基因： myfpkm<-read.table("All_gene_fpkm.xls",header=TRUE,comment.char="",sep = "\t",check.names=FALSE,row.names=1)probesetvar = apply(myfpkm, 1, var) #...
...标记完之后我们就可以用其他工具，把标记为"PASS"的列给筛选出来，这样方便后续分析。如果没有应用缺失值"."代替。INFO 为附加信息列，一般以=；形式添加额外的注释信息列，常见的如DP=18 表示该位点测序深度为18X；AF=0.1表示...
...下结果 -[1] FALSE 4. 赋值运算符 这些运算符用于向向量分配值。 <−，<<−和= - 叫作左分配符。参考以下代码 -v1 <- c(3,1,TRUE,2+3i); v2 <<- c(3,1,TRUE,2+3i); v3 = c(3,1,TRUE,2+3i); print(v1); print(v2); print(v3); 执行上面示例代码，...
您好，电脑是联想Thinkbook，W11系统，未进行任何操作前电脑显示虚拟化已开启，但是我后续勾选hyper-V，开始过程中一直失败，为什么呀？
我通过转录组和蛋白质组学分析筛选了一些关键基因，想进一步分析转录因子结合调控
...示的错误，求指点一下，谢谢了。 补充：图中错误问题已解决，文件配置错误导致这种情况的出现，但是我用图中的参数以及视频里老师讲解时候的参数作图，发现图均为以下情况，两个物种的染色体距离非常的近，请老师帮...
各位老师请教一下： 利用HMM模型搜索到的基因，怎么判断是真基因还是假基因呢？
已解决
...大家分享过：下载TCGA数据库内转录组/LncRNA等数据，通过筛选差异基因进行生存分析，构建预后模型的文章思路，感兴趣的可以点下以下三个链接查看详细内容。 1. 1分钟给你5分的SCI论文思路！要不要？ 2. TCGA-人类癌症数据库...
...因的检索方法 在做数据分析的时候很多老师经常需要搜索某一类功能的基因，有两种思路可以实现这一目标。第一种是直接序列比对，认为序列相似即具有相似的功能；第二种是利用这一类基因共有的蛋白保守结构域搜索，...
TCGA筛选出来的差异基因绘制火山图的时候出现这样的提示，是什么原因呢？怎么解决，对后面分析有影响吗？
您好，lr2rmats这个软件您使用过吗？已按照要求进行安装，测试文件报错，想请您帮助解决一下。下图是测试文件出现的报错，不知道该如何解决，谢谢！
...因构建木薯特异的 HMM模型，然后使用新建的 HMM模型重新搜索木薯NBS基因家族成员，这样才能得到比较全面的NBS基因家族成员。流程如下图所示： 鉴定过程中值得注意的是，部分NBS-LRR基因在进化过程中丢失了完整的NBS domai...
...的实验方法，因此不过于叙述这部分信息。 3.2实验方法筛选 实验方法主要有两种思路：1.通过已知TF寻找未知TFBS；2.通过已知TFBS寻找未知TF。无论哪种手段，前提都是基于蛋白与DNA之间的结合关系寻找，即交叉寻找目标，这有...