如图所示，正在进行kaks的计算，由于时间较长且没有挂后台运行，所以断网后再进入出现了这种情况，目前也看不到代码是否在运行
1准备文件： 1. 1 下载安装Oracle VM VirtualBox 在windows中安装vbox很简单，只要下载好vbox软件，双击运行一直下一步就安装好了：下载地址：https://www.virtualbox.org/wiki/Downloads 1.2 下载centos7系统iso文件： 海量的高通量测序数据，w...
...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门...
...过sftp连接服务器前需要为FileZilla指明本机私钥位置。 在FileZilla中，导航栏FileZilla->Settings->Connection->SFTP->Add key file，会调用操作系统的Finder，一般来说SSH的公钥私钥在"~/.ssh"目录下。但是调用操作系统的Finder没有直接...
...定的字符串做分割： #唤起code alignmentctrl + shift + =#然后在唤起的窗口输入作为分隔符的字符串，下图： 用正则表达式做分割： 暂时没有唤起的快捷键，可以指定： 然后输入正则表达式就ok了。
...素会影响差异表达基因的数量呢？ 第一：样品的处理，在取样时样品的处理很重要，处理之间（或者表型差异比较大）对差异基因的数量影响很大。 第二：生物学重复之间的相关性（也就是重复性），生物学重复之间的相关...
在课程基因家族分析中的章节5 课时15中提到的一个脚本get_fa_by_id.pl 与该课程之前提到的get_fa_by_id.pl脚本一样吗？是否通用吗？ 两个脚本名字一样 内容好像又不太一样
这是因为你在docker容器里面删除数据，容器一直挂在后台导致quota没有及时更新 应该及时清除容器，这样quota才刷新存储限额： docker rm -f $(docker ps -qa) #删除所有容器 参考：https://unix.stackexchange.com/questions/156897/why-does-du-...
自建hmm模型，检查了wrky.hmm与自建xx.hmm 文件（图一、图二）。 在hmmsearch 时：hmmsearch --domtblout xx_hmm_out.txt --cut_tc xx.hmm xx.pep.all.fa 报错：Error: bad file format in HMM file NLRP.hmm 图一 图二 图三
自建hmm模型，检查了wrky.hmm与自建xx.hmm 文件（图一、图二）。 在hmmsearch 时：hmmsearch --domtblout xx_hmm_out.txt --cut_tc xx.hmm xx.pep.all.fa报错：Error: bad file format in HMM file NLRP.hmm图一图二图三
...选择“高级系统设置”，找到“环境变量(N)...”。 在系统变量里找到“Path”，点“编辑”。 点击新建，将路径复制过来。一路“确定”退出即可。 3.测试 右键“开始菜单”，选“运行”，输入cmd进到Windows命令行界面。...
我在用GenomeScope软件预测一个种质的基因组大小的时候，结果显示基因组大小是348M。但是，我做kmer分析的时候，kmer总数量是16756256187，主峰的深度是42，这样计算的话（kmer数量除以深度）基因组大小应该是397M。而且测序公司也...
1.抽平方法： single_rarefaction.py -i pick_de_novo_otus/otu_table_clean.biom -o pick_de_novo_otus/otu_table_clean_rare.biom -d 2032 2.css方法或者deseq2方法 normalize_table.py -i otu_table_clean.biom -a CSS -o otu_table_clean_css.biomnormalize_table.py -i otu_table_clean.biom -a DESeq...