...号做分析相，想做门水平的细菌，第二个表是抗性基因的数据，想观察抗性基因和门水平菌的共现性网络。但是总是显示报错，请问您知道大概有什么原因吗？
...基因芯片等技术的发展，研究人员可以得到了空前庞大的数据量，而利用微生物16S测序数据得到的OTU丰度矩阵也可以进行网络分析，探究不同操作单元之间的互作关系。 因此，今天要给大家推荐一个网站：MENA，一个可以利用OTU...
老师你好，想问下二代数据质控中GC content出现双峰除了污染，还有其他可能吗？和基因组杂合度有关吗？我分析了7 8 个不同物种，不同平台的下机数据，都报错。
在实验研究过程中，实验数据常会产生batch effect，而批次效应的来源可能和生物或者科学变量没有任何关系，当处理不当，会对结果产生影响，产生假阳性或者假阴性 #################################################### http://genomicsclass.gith...
使用orthomcl分析同源基因时，需要用到MySQL数据库，具体操作如下： mysql -uroot -p #先用root登录create database orthomcl; #创建名为orthomcl的数据库create user 'user01' @'localhost' identified by '123.com'; #创建名为user01的用户，并设置...
我报名了conet网络构建的课程，用提供的数据文件分析完全可以，但是用我的数据文件就报错。我尝试了用测序公司提供的xlsx格式，并把数据形式改成和课程提供数据完全一样，再转化成txt制表符文件格式后输入，选择第二个选...
.../smart.embl.de/）是我们常用来进行domain搜索和蛋白质注释的数据库，它集成了很多蛋白结构预测和功能分析的工具，比如可以预测蛋白的一些二级结构：跨膜区（Transmembrane segments）、复合螺旋区（coiled coil regions）、信号肽（Signal ...
老师你好，我前一段听了你讲的SRA数据库数据的下载。我想问一下，直接按照runinfo 信息下载的数据的格式是什么格式？如何转化为fastq格式？ 如下面的下载地址：https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos2/sra-pub-run-11/SRR1218151/SRR12181...
VennDiagram是进行Venn图绘制的 R包，最多能够绘制五组数据，其中一个主要的绘图函数为venn.diagram() 针对该参数相关的参数调整，可以直接对Venn图的颜色字体等多主题进行修改。而其绘图数据，也就是venn.diagram() 对应的数据是一...
单位需求：想咨询如何做一个科研单位的基因组数据库，或者有没有能够做这一数据库的公司。 对黄河濒危鱼类全基因组序列进行扫描建库，共得到455.4亿个基因碱基原始数据，数据量为156.35 Gb。 对序列片段进行基因组组装，...
老师好，GWAS教程最后一章提到了LD热图的做法以及候选基因的筛选，但“优势单倍型”结果的统计并没有提及。想问一下老师，有没有这部分的教程或者代码？（ps:有没有实操性强一点的教程，针对没有R语言基础的小白）
...功能分类以及相关的通路信息，你也能分析基因的表达谱数据，但是你知道如何将二者进行结合吗？在功能分类或者通路图上显示出基因的表达数据？有一个工具可以做到——Mapman！ (官方网址：https://mapman.gabipd.org/）。 Mapman...