问题 想问一下，边界分析做出的图，和它描述的序列特征表中的各个区的长度不一致的话，是正常的吗？会不会有什么影响呢 叶绿体分析

文章 docker配置国内源加速下载，linux版本

0、镜像源参考 中国区官方镜像：https://registry.docker-cn.com 中科大源：https://docker.mirrors.ustc.edu.cn 阿里源：https://cr.console.aliyun.com 腾讯源：https://mirror.ccs.tencentyun.com 网易源：http://hub-mirror.c.163.com ...... 注：除了中科大源，其他未...

问题 在做WGCNA分析时，生成的模块数量过多，且模块之间的相似性不高，如何减少模块的数量？

问题 请教：基因与mRNA的对应关系分析不正确

我的物种序列只有NCBI上有公布，在做mRNA和gene的ID对应关系输出的时候出现问题，请问怎么解决？   下面是gff文件的信息： rna文件信息如下，ID是以XM_开头。 protein文件信息如下，ID是以XP_开头。 对gff文件进行处...

问题 老师您好，我在做泛基因家族分析中存在缺失分析得到的基因家族泛基因编号文件和泛基因列表一样，不知道为什么

老师您好，我在做泛基因家族分析中存在缺失分析，下面是基因家族列表这是通过泛基因集构建得到的泛基因列表， 下面是整理格式后的结果 下一步是获得该家族基因的泛基因编号，grep -f foxtail_millet.GRASgene.list foxtail_millet.pa...

问题 泛基因家族分析-SV和表达量

老师你好，有个问题我一直不理解。 #删除一些不需要的基因的表达量（B73的一些基因在其他物种中不存在同源基因） perl $scriptsdir/grep_famgene_fpkm.pl WRKY_gene_fpkm.xls ../03.PAV/PAV_gene.list WRKY_gene_fpkm.filter.xls ${ref} 以上这个命令。 1....

问题 在基因家族分析的第四节课中，我得到的比对序列数量和视频讲解中的数量不一样

问题 在ncbi里转录组分析里的名称和Ensembl里检索的名称对应不上怎么办

问题 MCScanX分析时 transcript_id与基因组蛋白序列ID不一致，不能获得对应的.pep文件

基因组.protein.faa文件 新准备的转录组ID.gff文件 提取对应的序列蛋白失败 transcript_id与基因组蛋白序列ID不一致

问题 老师您好，在做GWAS分析的时候，性状数据不是连续的数字，是0，1这种，这样的数据也可以按照上课讲的流程分析吗？性状数据没有多年数据，在后续的分析步骤中，不定义tassel_trait这个变量可以吗？

问题 老师，麻烦您帮我看一下我在做共线性分析时用到vlookup, 方法跟您的一样，就是筛不出来

共线性分析vlookup.docx

问题 请问mcscanx做基因组间分析时，有以下报错是什么原因呢？是因为Python环境不到位

问题 群体结构分析课程中文件格式转换这一步按着课程代码输入怎么也不成功，这是为什么呀

问题 使用Bwa mem命令时，使用-M和不适用时候，对后续数据分析有影响？是否需要加-M？

问题 请教老师，用自己的hmm文件，进行了domain的二次搜索，结果如下图所示。结果显示仍然会有很多只是匹配了一部分序列片段。我用这些部分比对上的结果截取序列后，再三大数据库对比发现也存在我想要的domain. 现在的问题是，如果要这些部分的结果截取序列，做进化树就会差异太大。如果不要部分比对上的，又怕少了家族序列。这样的情况如何处理，有没有相关的标准？谢谢