文章 Root microbiota assembly and adaptive differentiation among European Arabidopsis populations

...之间的相似度高于特定采样点上不同区室之间的相似度，显示拟南芥根部微生物在大陆范围上的结构趋同性。通过Bray-Curtis距离的变异多变量方差分析（PERMANOVA）证实了这种观察结果，这表明位点因素比采样部位更能解释真菌和...

文章 anaconda快速搭建python学习环境-windows

...写代码和运行代码，代码的运行结果也会直接在代码块下显示。如在编程过程中需要编写说明文档，可在同一个页面中直接编写，便于作及时的说明和解释。 我们安装完成anaconda之后，jupyter就已经安装成功了，因为anaconda中已...

文章 最好用的测试管理工具是什么？

...滤器。     4、缺陷列表还可以根据查看需要来设置视图，满足每个人不同的查看习惯，有表格、分栏、看板、统计、导图分类等。   CORNERSTONE最大的特点就是系统页面简洁，功能简洁又强大。最重要的是有好多走心的设...

文章 PBS 命令

...                  -q 列出队列状态，并以alternative 形式显示                          -au userid 列出指定用户的所有作业                          -B 列出PBS Server 信息                          -r 列出所有正在运行...

文章 ls常用参数及ls只列出部分目录或文件

1.只显示目录 命令1: ls -al | grep "^d" 命令2: ls -F | grep "/$" -F 文件类型（File type）：-F可以在每一个列举项目之后添加一个符号，例如：/ 表明是一个目录；@ 表明是到其它文件的符号链接；* 表明是一个可执行文件 2.只显示...

文章 组装"预实验" | 基因组调研图

...出现的次数；第二列是y，表示出现x次数的kmer数目。# -v 显示详细信息# -t 线程数# -h x的最大值，默认是10000# -o 输出文件的名字。 3. 统计k-mer jellyfish stats A.sif -o A.stats 结果有四行： Unique: 只出现过一次的k-mer数量Distinct: 特异...

文章 你不知道的微生物互作分析方法

...聚类分析，从而划分模块。而开始分析的页面也就是下图显示的页面。 导入数据与设置 点击Data menu。在弹出的窗口选项——Select  file中导入丰度矩阵，并进行相关设置（如下图）。 完成初步数据设置之后，选择该...

问题 用sudo mount -t vboxsf gene-family gene-family将Windows中的共享文件夹挂载到Linux中的共享文件夹中显示mounting failed with the error: No such device

问题 老师，您好，我在将windows中的共享文件夹，挂载到linux系统的共享文件夹目录的时候，显示错误信息/sbin/mount.vboxsf:mounting failed with the error:No such device。麻烦问一下，应该怎么解决，谢谢啦！

文章 Linux join命令合并文件

...#连接testfile_1、testfile_2中的内容  Hello 95 2005    #连接后显示的内容  Linux 85 2009  test 30 2006  join其他可用选项： -a FILENUM：打印指定文件的所有行，包括没有匹配到的行。FILENUM 表示要打印的文件编号，1 表示第一个文件...

问题 老师您好，想向您请教关于GWAS分析时的问题

...据都处理好了，最后到用emmax进行关联分析的时候.ps文件显示只有23条染色体（其实有26条+2条性染色体），但是.e文件也没有报错.o文件也显示成功完成，前边map文件也显示28个染色体，不知道那里出了问题，请老师指教，谢谢！

问题 我买了基因组重测序方面的课程，其中课上的老师是在win10 状态下把目录建在D盘上，但是在Linux系统上我也把目录建立在D盘上显示错误，这个怎么样解决呢，方便解答下？

问题 请问大家，我现在用linux虚拟机4G进行rna-seq是不是内存不太够要求呢？我现在学习到了hisat2比对的环节，但是log文件显示这样的信息，sam文件是0字节，有点摸不着头脑。

问题 gVCF文件转换成VCF格式时，已经在后台运行了很久了，突然程序关闭了，报错信息显示：

16:11:06.922 INFO  GenotypeGVCFs - Shutting down engine [2023年12月4日 下午04时11分06秒] org.broadinstitute.hellbender.tools.walkers.GenotypeGVCFs done. Elapsed time: 2,326.36 minutes. Runtime.totalMemory()=19664470016 java.lang.IllegalStateException: No likelihood sum exceeded zero -- m...

文章 R语言基础入门—数据结构（2）

...素设置名字 names(list_data) <- c("Sites", "Numbers", "Lists")# 显示列表 print(list_data) 执行以上代码输出结果为： $Sites[1] "Google" "Runoob" "Taobao"$Numbers [,1] [,2] [,3] [1,] 1 3 5 [2,]    2    4    6$Lists $Lists[[1]] [1] "runoob"$List...