文章 BSA分析之MutMap分析原理详解！

...sequence was constructed by replacing nucleotides in Nipponbare with those of Hitomebore at the 124,968 SNP positions identified between the two cultivars by alignment of 12.25 Gb of Illumina Hitomebore short reads to the Nipponbare reference genome MutMap适用条件： 1. 一般为隐性突变...

问题 python rpy2 报错

.../site-packages/rpy2/robjects/__init__.py", line 18, in <module>    from rpy2.robjects.robject import RObjectMixin, RObject  File "/share/work/biosoft/python/Python3/lib/python3.8/site-packages/rpy2/robjects/robject.py", line 86, in <module>    class RObjectMixin(abc.ABC):  File "/s...

问题 WGCNA分析，前期数据载入Rstudio中出现“error reading from connection”，这该怎么解决？我看到官方网站就是这样的代码。

...第二部建立模块的数据调入过程中，总出现“error reading from connection”，这需要怎么解决？

问题 生存分析datExpr数据的bcr_patient_barcode列是 . 号分隔，后续报错

...####################clin <- clin[clin_info$bcr_patient_barcode %in% datExpr$bcr_patient_barcode,]exprSet<-merge(clin_info,datExpr,by.x="bcr_patient_barcode",by.y="bcr_patient_barcode") 的时候clin和exprSet都会显示0 obs

问题 老师，您好，我在运行gatk的HaplotypeCaller时，过程中总是显示：WARN Strand BiasBySample - Annotation will not be calculated,genotype is not called or alleleLikelihoodMap is null 属于正常现象么？而且，运行这样一个样本数据真菌的，参考基因组为32.2Mb大概需要运行多久呢？

...：WARN Strand BiasBySample - Annotation will not be calculated,genotype is not called or alleleLikelihoodMap is null 属于正常现象么？而且，运行这样一个样本数据真菌的，参考基因组为32.2Mb大概需要运行多久呢？

问题 index.sh构建索引时，其他文件都正常，但是这个unknown_refGeneMrna.fa文件是空的

WARNING: Cannot identify sequence for PH02Gene38415.t1 (starting from hic_scaffold_16:44053792) NOTICE: Finished writting FASTA for 0 genomic regions to unknown_refGeneMrna.fa

问题 Error: C++17 standard requested but CXX17 is not defined

请教给各位老师： 在Rstudio Server装包时，提示Error: C++17 standard requested but CXX17 is not defined。  在网上找了相关方法，更新GCC版本，设置.R/Makevars, 最后还是报错。 以下是我的GCC版本和.R/Makevars.

文章 Mac | Mac M 芯片应用意外退出问题

...执行以下命令 /usr/sbin/softwareupdate --install-rosetta --agree-to-license 安装Rosetta 2成功后，即可成功打开应用 ————————————————

问题 get_gene_exon_from_gff.pl 这个脚本提取不出CDS信息，无法绘制基因结构图

GFF文件如下： 脚本信息：

文章 GWAS分析哪个模型最优

...hromosomal position of SNP markers associated with flower color in soybean from eight models including Analysis of Variance (ANOVA) (A), General Linear Model (GLM) (B), Mixed Linear Model (MLM) (C), Compressed MLM (CMLM) (D), Enriched Compressed MLM (ECMLM) (E), Settlement of MLM Under Progressively...

问题 求助：Docker启动不了了。

老师，我的Docker Toolbox启动不了了。 您上次建议我把系统升级到win10，并且安装桌面版。（我的上一个问题见链接：https://www.omicsclass.com/question/4670） 我看安装桌面版的链接里说需要先开启Hyper-V。由于我的电脑是华为matebook x pro...

文章 NCBI下载SRR并转换为fastq文件

...opulation-genomic analyses reveal bottlenecks and asymmetric introgression from Persian into iron walnut during domestication | Genome Biology | Full Text (biomedcentral.com) 数据可用性：The entire genome resequencing data have been deposited at GenBank under the accession PRJNA356989.  ...

文章 绘制venn图报错Unexpected parameter length for "category"

...259 VennDiagram绘制venn图基本语法： VennDiagram::venn.diagram( x = venn,filename =NULL,#filename = "./figure_final/tif/Venn.tiff", resolution =300, disable.logging = FALSE, col = NA, fill = palette, cat.col = palette, cat.cex =1, cat.dist =-0.15, rotation.degree =0, ...

问题 老师您好，重新启动docker时daemon is not running该怎么解决?

文章 利用 NAS 对实验室数据进行存储备份

...助：https://kb.synology.cn/zh-cn/DSM/tutorial/How_to_map_network_drives_from_your_Synology_NAS 2、 macOS系统网络存储设置：https://kb.synology.cn/zh-cn/DSM/tutorial/access_nas_from_mac 数据安全性有保障 NAS网络存储一般多块硬盘之间会做RAID，独立磁盘冗余...