GDC上的TCGA的转录组数据，目前支持3中类型下载，分别是Count, FPKM和FPKM-UQ， 下载哪一种比较好呢？
老师您好，我在使用raxml-ng构建进化树时，发生了报错，模型选的是LG+G8+F，错误如下：
...想查找某个文件所在的包时，此快捷键非常有用（特别在比较大的项目中）。8.【Ctrl+L】定位到当前编辑器的某一行，对非Java文件也有效。9.【Alt+←】、【Alt+→】后退历史记录和前进历史记录，在跟踪代码时非常有用，用户可...
使用fpocket计算出来的蛋白质靶点不能使用pocketmatch比较，它报这个错误Step0-cabbage-core: malloc.c:2401: sysmalloc: Assertion `(old_top == initial_top (av) && old_size == 0) || ((unsigned long) (old_size) >= MINSIZE && prev_inuse (old_top) && ((unsig...
...相关性、相似性以及距离计算时，我想设定pearson,spearman系数>0.6的边构建网络。 请问老师设置参数的时。是在进行permutation时设置，还是在进行Bootstrap时设置。此外我发现在设置相关性参数后，进行permutation，完毕后...
...ASCII码表排序，所有的大写字母都排在小写字母前边。 比较函数 Perl的sort的工作方式是这样的，它遍历原始数组的每两个元素；每次把左边的值放入变量$a，把右边的值放入变量$b。 然后调用比较函数。如果$a的内容应该在左边...
...代表1个OUT，不同颜色代表不同的OUT模块，皮尔逊相关性系数大于0.6的OUT则用线相连，线越短相关性越强）。 4、 对模块119的OUT进行分析，发现其中包含很多与甲烷代谢相关的微生物，并对模块119在不同取样位置的OUT丰度进...
老师，我做拟南芥和苜蓿之间我的基因的协同性分析，拟南芥中有3个，苜蓿中有七个，协同性分析结果只有一条基因配上了， 水稻里面也是三个，一个都没配上，请问正常吗？
近期想做个BSA实验，子代混池规模是50+50，导师让我每个子代提取一份DNA，然后混合成一个池测序，可是公司不愿意这么干，我想问下，这个是必须的吗？
问一下为什么很多文献中TCGA的甲基化只分析配对样本，而不是比较所有正常样本和肿瘤样本？
老师我在学习了咱们课程后可以做出两个物种的共线性图，但是我在看文献都是这种多个物种放在一起的图，我自己琢磨不明白是怎么做的，希望老师帮我解答
在采用Bioconductor安装一些软件包的时候，经常遇到下载速度较慢，容易中断等情况。 针对这个问题，可以采用国内的Bioconductor 镜像加速来解决。 我们采用清华大学的开源镜像。 使用方法如下： source("http://bioconductor.org/biocL...
...ewpage()grid.draw(venn.plot) 之后基于相关代码调整即可。 2 如何获取各区域信息是绘制Venn图的一个关键问题 可以基于VennDiagram提供的计算函数 calculate.overlap 或者get.venn.partitions 以前者为例： area=calculate.overlap(xList)> typeof(area...
好像就只有最后一步没提取出来，我不知道什么原因，请老师解答