找到约 15 条结果

文章 sci分区，是按JCR还是中科院分区？哪个更靠谱？

...平均影响因子10分以上、2年内总被引达302306次、各种话题不断、Nature亲儿子....... 然而，它却被划中科院划到了2区。 到底分区的高低是不是判断一刊杂志好坏的一种标准呢? 我们发SCI论文到底以哪个分区为准呢? 今天，学霸...

文章 Braker 有转录组数据预测基因 多样本转录组

...nome.hardmasked.fa .ln -s $datadir/genome.fasta  genome.fa#拆分基因组不同染色体，方便后续软件使用多线程加快注释速度##seqkit split -p 2 genome.softmasked.fa --out-dir ref.split.softmaskedseqkit split -p 2 genome.hardmasked.fa --out-dir ref.split.hardmasked##mkdir 02.Brake...

文章 python特殊属性和方法的详解与运用

Python 用下划线作为变量前缀和后缀指定特殊变量 _xxx 不能用’from module import *’导入 __xxx__ 系统定义名字 __xxx 类中的私有变量名 核心风格：避免用下划线作为变量名的开始。   因为下划线对解释器有特殊的意义，而且是...

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(E-MTAB-8107)

...mp;& $0~/Breast/){print $0}'>E-MTAB-8107_BRCA_metadata.tsv 数据分析： 会根据metadata数据筛选乳腺癌数据： Rscript $scripts/seurat_sc_qc.r --rds GSE210347_counts.Rds \ --project BRCA_E-MTAB-8107 \ --nUMI.min 500 \ --nUMI.max 50000 \ --nGene.min 250 \ --m...

问题 老师，请问sample type出现这种情况怎么解决，麻烦老师解惑一下，谢谢啦。

...#######################> # 查询需要下载的甲基化数据（本次分析只下载肿瘤样本）> query.met <- GDCquery(project = tcga_project, +                       legacy = legacy,+                       data.category = data_category,+              ...

文章 vif.cca 筛选环境变量：VIF是非常有用的指示符，表明数据集中存在多重共线性。 它不能很好地指示应从模型中删除哪个预测变量。

...$spec)~., env)vif.cca(mod)#      pH  fakepH1  fakepH2#26.82960 12.63575 14.49851plot(mod)CCA of the SWAP calibration set with the predictor pH between two fake predictors correlated with pHThe VIF for pH is greater than the threshold 20, and so under the above procedure is dropped. If we fit ...

文章 什么是转录因子？

...知TF寻找未知TFBS，或通过已知TFBS找出其对应TF生物信息学分析（computational methods）:生物信息学方法主要是基于已有的研究数据，用于转录因子和序列间相互关系的预测，即通过序列保守性分析，通过已知TF预测未知TF，或通过已...

文章 怎么做一张好看的分类学树状图

在做微生物多样性分析时，经常会接触到分类学树状图。今天分享一款很不错的分类学组成信息可视化软件——GraPhlAn，用它生成的图会更好看哦！ GraPhlAn 安装 首先，是GraPhlAn 的下载安装。 在linux环境下使用如下命令进行下...

文章 细胞凋亡、增殖、周期检测明星试剂盒推荐

...稳定，由基因控制的细胞自主有序的死亡。凋亡的发生并不是一蹴而就，从最初的细胞皱缩到后续的DNA片段化至最终形成凋亡小体整个旅程有多个标志性事件发生，因此，针对不同凋亡事件的检测方法和产品众多，在凋亡的不同...

文章 NCBI批量下载数据,省时又省力

...大批量的数据下载，手动下载无疑是繁琐而又痛苦的，若不巧再碰上网站不稳定，小圆圈转半天就是不出来，此刻的人生必定是绝望的。 对此，小编深有体会，只70多个基因，就用了三四个小时来下载，费时又费力。还好...

问题 使用Launch_PASA_pipeline.pl 脚本报错

...报错 报错信息： (base) admin1@admin1-PowerEdge-R730xd:/mnt/6aa0485e-9dc6-4840-b61a-0798134475bf/jiegou$  /usr/local/src/PASApipeline/Launch_PASA_pipeline.pl  -c alignAssembly.config -C -R -t Trinity-GG.fasta --ALIGNERS minimap2 -g ./genome.fasta --CPU 68 1>pasa.log-connecting to SQLite...

文章 从罗永浩直播刷屏，来看如何做好项目管理

...额超过1.1亿元，直接刷新了抖音带货记录。 虽然收入不菲，但是罗永浩似乎还是忘记不了自己的锤子科技，在给极米投影仪带货时，把品牌口误成了“坚果”，最后不得不向直播的观众老爷们鞠躬道歉，才算勉强过关。   ...

文章 非小细胞肺癌 （GSE139555）

...t/*.afterQC.rds` \    -o $project/01.qc -p lung 单细胞转录组分析课程推荐：https://bdtcd.xetslk.com/s/4i88K6

问题 tassel报错，[Thread-9] ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - 0，软件运行有些表型数据时无问题，但大部分表型数据运行时出现该错误

...maizegenetics.analysis.filter.FilterTaxaBuilderPlugin: time: Feb 16, 2024 15:09:50 [Thread-9] INFO net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin -  FilterTaxaBuilderPlugin Parameters filterName: Filter minNotMissing: 0.0 minHeterozygous: 0.0 maxHeterozygous: 1.0 includeTaxa: true taxaList: #...

文章 重磅：全球科学家排行榜出炉！中国科学家排名最高的是......

不管你愿不愿意，“成绩单”的排名，总是会如约而至， 即使你已经成为了一名顶级的科学家， 还是逃脱不了各种被比较、被排名的“恐惧”。 当然，能排上名号也是一种荣幸，我们普通小白，怕是永远排不上了。。。。 ...