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问题 R语言绘制数据地图中使用tmap程序包绘制的时候，想对图例的字体格式进行修改，不知该用什么参数，求大神指教！

...的字体的格式，如下图，里面图例的格式及字体的大小，不知图和修改，发现里面并没有修改字体格式的参数。在下面用粗体描述的参数后面应该加一个什么参数？ ```{R message=FALSE, warning=FALSE} setwd("D:/mapmaking/map") #### 导入所...

问题 TCGAbiolinks使用求助 Downloading genome information (try:0) Using: Human genes (GRCh38.p13) Error: $ operator is invalid for atomic vectors

...CGAbiolinks包的GDCprepare函数的时候，出现报错，请各位给予分析或者 Starting to add information to samples  => Add clinical information to samples Add FFPE information. More information at: => https://cancergenome.nih.gov/cancersselected/biospeccriteria => http://g...

文章 绘制HIC热图

...：AGATCT；hindiii：AAGCTT 文件格式如下： chr2    0       579     HIC_chr2_1      0       +chr2    579     1817    HIC_chr2_2      0       +chr2    1817    3145    HIC_chr2_3      0       +chr2    3145    3155    HIC_chr2_4      0    ...

文章 ascp 高速下载NCBI各种数据库中的数据（SRA NR NT 分类数据库，）

...在干啥，方便查错。 -T 取消加密，否则有时候数据下载不了 -i 提供私钥文件的地址，免密从SRA和ENA下载，不能少，地址一般是:/share/work/biosoft/aspera/latest/cli/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -l 设置最大传输速度，一般200m到500m，如果不设置...

问题 利用cicro绘图时遇到错误

老师您好，我在基因家族分析使用命令进行绘图时发现运行错误，错误代码如下，请您帮我查看一下，谢谢老师。  *** CIRCOS ERROR ***       cwd: /work/my_gene_family/09.circos       command: /share/work/biosoft/circos/latest/bin/circos -conf confi...

文章 win7使用“远程桌面连接”连接到另一台计算机

...允许远程桌面连接通过其防火墙。 如果你的用户帐户不需要密码即可登录，你需要先添加密码，然后才允许你启动与远程计算机的连接。 在要连接到的计算机上允许远程连接 打开“系统”，方法是单击“开始”按钮 、右...

文章 ssh-keygen和ssh-copy-id实现免密登录远程主机

...着就可以免密登录远程主机，这个过程似乎与我们想想的不太一样，我们可能希望远程主机免密登录本机。这就好比我要去朋友家，我先将我们家的钥匙放在朋友家，结果我就可以随便进入朋友家里。正常来说，我家钥匙在朋友...

文章 非模式物种单细胞转录因子 SCENIC 数据库创建

... 我们从 motifs-v10-nr.Sus.tbl提取出所有的motif，并过滤掉，不存在与singletons的motif grep -v '^#' motifs-v10nr_clust-nr.duck-m0.001-o0.0.tbl|cut -f 1 |sort -u > motif_all.txtls ../v10nr_clust_public/singletons | cut -d '.' -f 1 > motif_nr.txtgrep -Ff motif_all.txt motif_n...

问题 老师我的基因组都是Scaffold，没有染色体级别的基因组，这种适合做泛基因家族鉴定么。我是在BnPIR(http://cbi.hzau.edu.cn/cgi-bin/rape/download_ext)下载的

做JCVI做共线性分析时出现了这种情况

文章 抗体Fab段的主要功能及制备方法

...菌表达系统进行Fab抗体的表达。   由于很多抗体Fab片段不能很好地结合蛋白A、蛋白G或蛋白L亲和树脂，我们通常在抗体重链的C端添加poly-histidine标签，以便于纯化。在设计构建载体时，可在His标签和Fab之间加上蛋白酶识别位点...

文章 TCGA癌症数据库挖掘发表的大文章CNS级别汇总2019

...nes human glioblastoma genes and core pathwaysExit DisclaimerNature. 2008;455(7216):1061-1068. doi:10.1038/nature07385 2011Integrated genomic analyses of ovarian carcinomaExit DisclaimerNature. 2011;474(7353):609-615. doi:10.1038/nature101662012Comprehensive molecular characterization of human colo...

文章 merged.gtf 合并同一转录本的exon位置

...     gene_id "XLOC_000001"; transcript_id "TCONS_00000001"; exon_number "5"; gene_name "MD00G1000200"; oId "CUFF.2.1"; nearest_ref "mRNA:MD00G1000200"; class_code "j"; tss_id "TSS1"; 输出文件示例： Chr00   +       XLOC_000001     MD00G1000200    TCONS_00000001  exon    37990-38...

文章 merge_metadata_genexpdata.r 在metadata中添加基因表达数据

...例： 将免疫浸润的结果合并到metadata中方便后续做比较分析： Rscript $scriptdir/merge_metadata_genexpdata.r -m  ../08.Nomogram/nomogram_metadata.tsv -g ../03.TIME/immu/timer.res.tsv \   -b barcode -p metadata_risk_score_timer 脚本获取与使用课程：https://stu...

问题 重测序

重测序分析的是并行任务运行怎么出错？命令是nohup ParaFly -c  work285.sh -CPU 8 > work285.sh-4.o& ， 而不用并行命令 直接运行nohup sh work285.sh >work285-3.sh.o& 这个命令就不报错，这是怎么回事？ sh: -I: command not found warning, cmd:...

文章 细胞长不好？那是你没选对细胞因子！

...把控，如今市场上的细胞因子产品琳琅满目，质量也良莠不齐，到底怎么才能选到合适且优质的细胞因子呢?今天，学霸姐姐就带你了解一下。 选择细胞因子需要注意哪些问题？ 首先，你应该根据实验目的及细胞因子的功能...