问题 比较基因组学03.Phylo_Tree/aln_out

比较基因组学第三步比对完有的.cds_aln.fasta为0，没有内容 导致#合并成supergeneseqkit concat aln_out/*.cds_aln.fasta.renamed  >  single_copy.cds_msa.fasta  为0

文章 什么是RIN值？！

...首先要从评价核酸质量是否达标开始，RIN值是样本检测中比较重要的指标，今天就给大家聊聊RIN值！ RIN值简介 RIN值，即RNA integrity number（RNA完整值），是安捷伦公司开发的以数字化形式表示 RNA 完整性的参数。在高通量测序样...

问题 老师您好，请问家族蛋白基因多序列比较分析的研究思路是什么呢？

问题 比较基因组学分析时报错，无法生成 anchors文件

老师您好！附图是报错的截图和报错后生成的几个文件 生成了几个文件 请老师指点！感谢！！

问题 微生物16S分析物种功能预测PICRUSt2部分，进行代谢通路差异比较可视化

...生物16S分析物种功能预测PICRUSt2部分，进行代谢通路差异比较可视化时，如果是三组之间比较分析，这个代码应该怎么修改，谢谢老师！Rscript $scriptdir/ggpicrust2.r --daa_method $m  \     --pathway_table q2-picrust2_output/pathway_abundance.qza \  ...

问题 关于比较转录组的实验设计

我想通过转录组学对耐寒和不耐寒2个作物品种进行研究，在正常状态下，2个品种生长没差异，经过冷处理后表现明显不同。从有效性和成本来考虑，取处理前后2个点（即4个组）做全转录组分析是否可行？另外，关于生物学重...

文章 IF:8.8|TCGA+ceRNA+肝癌文献解析

...模型。5.模型中的RNA结合临床特征进行单因素、多因素cox回归分析，从而获得具有独立预后效果的RNA。6.探究具有独立预后效果的RNA与免疫浸润之间的关系，并通过富集分析来确定其在HCC中的潜在功能。 探究PTEN在HCC中的抑癌作...

问题 请问一下有没有比较好用的可以免费下载中文文献的网址呀？

文章 进化树美化操作详解- iTOL

...。这边以开口圆形进化树为例。 Rotation：旋转进化树，调整圆形开口方向。 Arc：调整圆形开口角度大小。 Branch lengths：是否展示进化枝的枝长。 Invert tree：是否将延伸方向由根枝叶转换成叶在内侧，进化枝在外侧。 Labels：...

问题 你好老师，在基因家族比较时候，准备bed文件和CDS文件问题

在基因家族比较时候，准备bed文件和CDS文件问题时，由于水稻的基因ID和转录本ID不一样，所以看了课程的最后一节课，此时有了OS.bed，然后去使用getgeneid_mrnaid的脚本，想得到基因ID和MRNA ID文件，可是在使用时出现这个报错。 ...

问题 基因家族分析课时20 比较基因组学分析最后一步生成图片时出现这个错误，无法生成图片

 老师好，在做基因家族分析课时20 比较基因组学分析最后一步生成图片时出现这个错误，无法生成图片，求解，谢谢输入文件

文章 如何鉴定长距离运输的mRNA?

...南瓜CDS序列进行blast比对得到转运mRNA基因ID。 两种方法比较 综合来看，两种方法思路类似，但也各有千秋，在基因组重建过程中，第一篇方法中多了物种特异基因组装过程这一步，而本篇文章在RNA数据比对时引入SNP概念也是...

问题 老师您好，请问在做基因家族分析时，遇到比较短的序列（aa

问题 动植物比较基因组分析实操中基因组的版本信息

动植物比较基因组分析实操中使用物种基因组的版本信息是什么？？论文写作的时候，需要提供这些版本信息和引用发表的论文。1.Vitis_vinifera， 2.Theobroma_cacao，3.Solanum_lycopersicum， 4.Papaver_somniferum，5.Oryza_sativa，6.Nelumbo_nucifera，7....

问题 TCGA的甲基化差异分析只分析配对样本，还是比较所有正常样本和肿瘤样本？