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问题 比较基因组绘图时报错

比较基因组分析最后一步时,运行 /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.graphics.karyotype  --format=pdf  --figsize=15x5 mcscan_seqid mcscan_layout报错,报错页面为 我的输入文件分别为 ATH.bed Anchors.simple Rapa.bed seqid layout 请问报错...

问题 比较基因组学报错,如下图

问题 请问扩增子分析的时候保留多少条OTU/ASV比较合适?

请问扩增子分析的时候保留多少条OTU/ASV比较合适

问题 基因组质量比较差,处于草图阶段,可以做基因家族分析吗?

基因组质量比较差,处于草图阶段,可以做基因家族分析吗?

问题 比较基因组MCScanX 绘图报错

问题 比较基因组学共线性

请问运行这个脚本的时候提示这个错误是什么意思啊?

问题 单倍型基因组组装问题

...装了两个单倍型hap1跟hap2,两个单倍型跟同一个参考基因组比较,结果都比较好,但是将hap1跟hap2比较,8.9号染色体结果就不好,这种情况正常吗? hap1与参考基因组比较 hap2与参考基因组比较 hap1与hap2比较

文章 diff比较两个文件的内容

在 Linux 中,你可以使用 diff 命令来比较两个文件的内容。diff 命令会显示文件之间的差异。下面是 diff 命令的基本用法: diff file1.txt file2.txt 这将比较 file1.txt 和 file2.txt 两个文件的内容,并显示它们之间的差异。如果文件相...

问题 python版本的MCScanX绘图(比较基因组学)

如图所示,我在做比较基因组学python版本的MCSanX绘图最后一步根据配置文件出图时显示这样的错误提示,这是为什么呢,我检查了一下我的文件格式什么的都没有错,命令也没有输错。请老师指点一下。

文章 HISAT和STAR比对软件比较

分析流程: 人基因组比对 比对参数 比对用时 比对率 找到的差异基因 参考文献:https://ieeexplore.ieee.org/abstract/document/10178793

问题 测目的细菌或真菌用什么方法比较

文章 进化树美化操作详解- iTOL

...。这边以开口圆形进化树为例。 Rotation:旋转进化树,调整圆形开口方向。 Arc:调整圆形开口角度大。 Branch lengths:是否展示进化枝的枝长。 Invert tree:是否将延伸方向由根枝叶转换成叶在内侧,进化枝在外侧。 Labels:...

文章 转录组如何与其他实验手段结合?(第二篇文献)

...表,做好高级个性化分析发表高分1区不是梦!T2T基因组/比较基因组/泛基因组分析学习链接:T2T基因组组装与注释分析;动植物泛基因组分析 ;比较基因组分析 4. 群体重测序遗传进化分析+GWAS文章,篇篇10+分,缩短分析周期,...

问题 比较基因组,无法获得pep和cds序列

在学习比较基因组课程中,我使用从葫芦库基因组数据库中下载的genome.fa,cds.fa,pep.fa,gff文件运行01.prepare_data.sh脚本时可以正常的获得gff文件,但是在提取cds和ped时,出现报错 报错如下

问题 三倍体等多倍体怎么做比较基因组

三倍体等多倍体怎么做比较基因组,是用全基因组做,还是挑其中一套染色体做呢。因为担心如果用全基因组做单拷贝基因会很少。,一套染色体做又担心不能说明亚染色体的情况