文章 linux 命令当中出现特殊字符无法传递参数怎么办

...命令行中要注意这些符号的使用，不然会报错的。 举个例子，我这里有个目录：目录的名字中间有个空格（aa bb  是一个目录，不是两个只是中间有空格）： 当我们想删除他的时候，直接删除会报错，rm会认为是两个目录：...

文章 密度图--ggplot2

library('ggplot2')########################画图library('reshape2')########################meltA =rep( c("A","B","C","D"),each=2)B = c(6.332968,9.368328,6.674348,4.127901,5.192845,6.652865,7.829350,6.995062)C = c(5.367671,7.286253,5.217053,3.875520,6.679444,6.127819,5.091166,7.942029)D = c(5.171107,...

文章 IF=4.2 | 不同西瓜品种果实品质的转录组代谢组联合分析

...谢组联合分析 文章将代谢组和转录组相结合，研究了四个西瓜品种中与糖酸和果肉颜色相关的差异表达基因和差异代谢物。在有机酸和糖代谢途径中鉴定出 58 个基因和 9 个代谢物。在与果肉颜色形成相关的途径 （类胡萝卜素...

问题 课程里TCGA数据下载代码问题

请问老师TCGA头颈肿瘤在GDC网页上看有528个样本  但在按照课程的r代码怎么有546个  而且肿瘤和正常的加起来好像还少了两个 这是怎么回事 第二个问题，我按照给的代码运行，运行到这步报错了，不知道该怎么解决，希望老师...

问题 老师，您好。想问一下，我做的基因家族有好几个pfam文件，hmmer搜索后，除去各个文件的重复转录本，最后合并成一个文档。但这个文档还是有重复的转录本，是什么原因造成的呢？

问题 在做基因家族分析时，有几个基因能找到目标结构域，但是基因碱基数太小，与以往文献中提到的碱基数不匹配，并且在建进化树时总是出错，请问可以删除这三个基因吗

问题 老师你好！我通过blast比对获得了BHLH基因家族的目的基因，我现在想要分析这些目的基因的结构，怎么获取某几个基因的注释文件，利用GSDS官网弄出他们的结构图呢？

问题 老师您好，请求帮助！MENA分子生态网络分析时，上传200个OTU节点，但是最后显示nodes为383 （其中一部分不包括上传的节点），请问这样的结果合理吗？为什么会出现这样的情况呢

问题 老师您好，多序列比对完后构建进化树遇到了错误，建不了树，但是删掉几个序列较短的基因又能建树，这种情况怎么办，如果在筛出一些基因要怎么筛除

问题 如果是基于已知的两个遗传位点，用GWAS分方法的目的是研究这两个位点随时间序列的跟踪，处于这样的目的40个品种够吗，出于这样的目的的话对品种数量有要求吗？

问题 关于比较转录组的实验设计

我想通过转录组学对耐寒和不耐寒2个作物品种进行研究，在正常状态下，2个品种生长没差异，经过冷处理后表现明显不同。从有效性和成本来考虑，取处理前后2个点（即4个组）做全转录组分析是否可行？另外，关于生物学重...

问题 PASA预测基因数目过少

...运行PASA_assembly时，因为做的是真菌，best_candidate.gff3有6514个基因，有编码潜力的只有588个，最后筛选的high_quality_gene.gff3只有1538，过滤掉距离太短的只剩下994。您说2500个基因左右即可，但是我预测出来的基因远低于这个数值。有...

文章 PM必须懂的4种项目管理模型

...、结构各有不同。采取抛弃型原型模型往往是为了和用户更好地沟通，大家一定要注意区分。 原型模型适用的项目特点： i 处理简单过程明确、涉及面窄的小型系统； ii 大型系统的需求阶段，用原型去跟用户交流，需求分...

问题 全基因组选择运行Bayesian_train.r时报错

...选择课程中，模型训练时，出现报错。运行的命令为Rscript $scripts/Bayesian_train.r -g ../01.data_prepare/train_data.csv -t $datadir/train_pheno.csv -tr Trait02 -m BayesC -o BayesC -p BayesC_Trait02；报错为/work/scripts/Bayesian_train.r: error: unrecognized arguments: -o Bayes...

文章 组学大讲堂周年庆特大优惠---VIP最高返礼6800元！！

...价21980元的超级VIP限时限量6.9折优惠（券后15166元，限量10个名额），还送独享服务器 7.8 折券，租服务器都能省钱。 注：亦可选择原价购买享优惠差价返礼（大约价值6800元的大额返礼）。 效率火箭蹿，学习超丝滑支持双人同...