问题 拟南芥UVR8有7个RCC1蛋白保守结构域，在之前一些文献的图片中可以直观的看到，为什么现在输入序列，结果却是长长的一条，怎么才能做出文献中那种图？求解，谢谢

问题 老师您好！请问一个处理只有5重复，能用这5个重复在MENA中做16S网络图分析吗（相当于MENA分析的样本量为5）？MENA网络图分析对样本量的要求是多少呢？

问题 老师您好，我用mutmap的方法分析了f2群体，有三个峰，有个一个峰在99阈值之上，但是做基因分分型时 要么是突变体基因型要么是野生型基因型，而且区间前半段设计不出引物

文章 R语言逻辑运算符与算术运算符

... 下表显示了R语言支持的算术运算符。运算符对向量的每个元素进行操作。 加法(+)， 相加两个向量。示例代码：v <- c( 2,5.5,6); t <- c(8, 3, 4); print(v+t); 执行上面示例代码，得到以下结果 -[1] 10.0 8.5 10.0 减法(-)， 将一个向量减...

问题 请问老师SNP注释报错这个信息怎么办解决.

NOTICE: Running with system command <coding_change.pl  snp.refGene.exonic_variant_function.orig /data/SNPINDEL/unknown_refGene.txt /data/SNPINDEL/unknown_refGeneMrna.fa -alltranscript -out snp.refGene.fa -newevf snp.refGene.exonic_variant_function&gt; Error: invalid notation found: <gene-Pdu...

文章 IF=13.8 | 甘油/二醇脱水酶是后肠发酵食肉动物肠道微生物群的关键功能

...，作者采用了一种非靶向方法，对代表不同饮食类型的25个粪便样本（17个食草动物，3个食肉动物，5个杂食动物）以及不同肠道生理（11个前肠发酵者和14个后肠发酵者）生成了宏基因组序列。通过鸟枪法测序得到的经过质量控...

问题 请问老师，我已经成功在docker挂载我自己的基因组文件了，和01dataprepare前几个步骤一模一样，但是最后链接到01dataprepare的文件还是红色的无法打开

检查了其他都没问题，是我挂载数据的地方不对么 docker run -it --name pangenefamily --group-add keep-groups -v /home/us367/pan-gene-family:/work omicsclass/pan-gene-family:v2.0  这是我挂载用的代码

文章 Linux Shell 编程基础 简化自己的工作批量运行命令

...linux命令处理生物大数据、 Shell是什么？ shell本身是一个命令解释器，介于操作系统的内核（kernel）态和用户态之间，可以执行系统调用及系统命令等，让用户以此来与操作系统实现互动。同时，它也用来指一种计算机程序语...

文章 单次与多次跨膜蛋白的特点和功能：多次跨膜蛋白的意义

...有些蛋白质完全位于双层膜外（内侧或外层），仅通过一个或多个共价附着的脂类基团与膜相关联(C)。 还有些蛋白质通过与膜蛋白的相互作用，间接地与膜表面相结合(D)。   4. 多肽通常以α螺旋的形式穿过脂双层 对于许多跨...

问题 拟南芥UVR8有7个RCC1蛋白保守结构域，在之前一些文献的图片中也可以直观的看到，为什么现在输入序列，结果却是长长的一条，怎么才能做出之前那种图？求解，谢谢。

问题 转录组基因表达差异分析分组问题，我是有3个样品数据，如下分别是Carambola_K007-01-T01（花序），Carambola_K007-01-T02（花苞），Carambola_K007-01-T01（叶），该如何分组呢

问题 老师好，为什么我用杓兰七个物种的fasta组装起来比对后用DnaSP做出的图是这样的呢？跟老师您做出来的图存在差异，请问老师是对数据进行处理吗?

文章 单细胞转录组如何将UCell CytoTRACE2 infercnv等结果添加到总的rds中

... 合并这些信息： -b barcode 指定共同的列名字 Rscript $scripts/merge_tsv_files.r -i infercnv.metadata1.tsv UCell1.metadata1.tsv CytoTRACE2.metadata1.tsv -b barcode -p metadata 添加metadata信息到rds文件中： Rscript $scripts/addMetadata_to_seurat_obj.r  -i GSE...

文章 蛋白序列三维结构预测

...似的蛋白质结构。补充说明：已知的蛋白质结构有十几万个，但其所具有的不同的结构拓扑只有1393个，也就是说，所有结构都落在这1393个拓扑内！因此，选择匹配能量最低的拓扑。要求：没要求，比较任性。一般是不能同源建...

文章 科研汪专属花式表情包，不懂不是科研人！

... 1、自我介绍 不要问我为什么辣么那么穷，没错我就是个科研搬砖民工， 你以为读了硕士读了博士就是搞科研吗? 见过太多人读了研究生之后变成搬砖机器人了，尤其是实验居多的专业，比如材料、生物等等。 日常做实验...