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问题 docker第三方镜像如何查看已安装的软件？

我们下载第三方镜像，尤其是整套分析流程的镜像之后，如何查看其安装的软件和软件版本？

问题 基因家族分析---没有蛋白序列可以做基因家族分析吗？

例如：只有***.genomic.fna文件和***.gff文件，能通过blast搜索家族基因吗？如何搜索呢个？

问题 老师，您好！全基因组选择，利用自己的SNP数据（芯片SNP）进行基因型数据处理，beagle.27Feb25.75f.jar处理完成后，得到的imputed_snp里面没有SNP标记信息。

Command line: java -Xmx8192m -jar beagle.27Feb25.75f.jar   gt=GENO.vcf   out=imputed_snp   nthreads=48 No genetic map is specified: using 1 cM = 1 Mb java.lang.IllegalArgumentException: Duplicate marker: 1 77806149        AX-90568401     C       T         at vcf.Markers.m...

问题 go term 不一样为什么go功能一样

就是go的注释号不一样而注释功能是一样的，这是什么原因，GSEA分析不能有重复的注释功能，应该怎么办

问题 请问这个代码或者脚本要更换吗

老师你好，我按照课程的代码”perl script/select_redundant_mRNA.pl mRNA2geneID.txt GRAS_domain_new_out_selected.txt GRAS_remove_redundant_IDlist.txt“输入后， 我的输出结果是这样的，请问这个怎么解决啊，我的两个输入文件都是对的。

问题 基因家族鉴定

...;90%, and match lengths >100 bp. 这个验证鉴定的基因的方法该怎么操作？ 谢谢

问题 BSA混池定位对混池规模大小的要求？

质量性状和数量性状做BSA定位时，混池规模大小的要求？

问题 GSDS网址定位问题

....omicsclass.com/question/2699  最后一张图片是demo里面的，感觉和我的差不多啊。

问题 基因家族分析时用大豆gff文件报错 killed

... next ************** Killed”请问对于这种没有ID的情况我应该怎么处理呢，谢谢老师

问题 Linux服务器上，运行提取结构域的脚本的时候，出现未安装Bio/SeqIO.pm in @INC的错误，请问如何解决

这样的在服务器上在安装biolinux吗

问题 请问PSI-blast 搜索不到结果是什么原因呢

PSI-blast 搜索结果为0，只有空的txt文件，没有pssm文件，是怎么回事呢

问题 tgsgapcloser 如何控制minimap占用的内存

tgsgapcloser --thread 15 --min_nread 3 --min_match 2000 --scaff ../genome.final.fa --reads ../ont.fasta --output  ONTReads --racon /share/work/biosoft/Racon/latest/build/bin/racon 占用了800个G的运行内存，内存不够，自动退出了，怎么设置参数控制内存吗

问题 HiC-Pro使用

请问老师，我已经成功安装了HiC-Pro, -h会有帮助信息出来，但是运行HiC-Pro -c config-hicpro.txt -i rawdata/ -o results，缺没有任何提示自动停止了，生成了仅包含链接的rawdata和config文件的结果文件夹，请问应该如何成功运行这个软件

问题 如何合并两个提取好的两个保守结构域的序列

一个基因家族的每个基因两个不同保守结构域，现在要怎么给它们合并啊，手动吗，还是可以通过命令实现呢

问题 SNP数据统计

...该文件SNP_gene_ann.stat中可以查到每个样品的SNP，但是总数和使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l获得SNP总数不一致，那SNP总数应该按哪个计算呢？