老师你好,在用ALLHIC1或者2的时候都报错,均有显示[E::idx_find_and_load] Could not retrieve index file for '/work/genome/assembly/output/docker/GM/30.ALLHiC2/sample.bwa_mem.bam'。但该地址下是有该文件的。 第二个问题是ALLHIC1时形成了sample.clean.counts_GATC.13...
...根,使用qRT-PCR检测以上6基因的表达模式变化情况,结果显示UGT73基因家族的4个基因在处理后12h表达开始上调,而UGT74家族的2个基因中一个基因未表现上调,另一个在处理及对照样品中均未检测到。通过qRT-PCR作者将候选基因范围...
...置环状曼哈度图中不同染色体之间的间隔cir.chr 设置是否显示染色体的边界cir.chr.h 设置染色体边界的高度cir.legend 设置是否显示图例cir.legend.cex 设置图例字体的大小cir.legend.col 设置图例的颜色LOG10 设置是否对p-value...
... -none- charactera1 273 -none- character 如上结果显示 五组一共获得31各区域的数据,可以利用返回的list提取每一个区域的结果,譬如取出a1区域(共273)的前10个: > area$a1[1:10] [1] "AT3G27960" "AT4G12170" "AT1G58270" "AT3...
pwd命令目录基本操作 pwd命令以绝对路径的方式显示用户当前工作目录。命令将当前目录的全路径名称(从根目录)写入标准输出。全部目录使用/分隔。第一个/表示根目录,最后一个目录是当前目录。执行pwd命令可立刻得知您...
... '{print NF}' /etc/passwd //显示每行有多少字段awk -F: '{print $NF}' /etc/passwd //将每行第NF个字段的值打印出来 awk -F: 'NF==4 {print }' /etc/passwd //...
...的相似性聚集或分离不同的spots,揭示空间异质性 左图显示了每个spots 的聚类分配结果根据其所属的聚类用不同颜色标记,并投射到组织图像,可以直观地看到不同基因表达区域在组织中的分布右图展示了t-SNE算法降维后的二维...