老师，您好，我想向你咨询一下wgcna的问题，我通过ncbi里面寻找了18个样本，并且将其他对应的样本进行了RNa-seq的差异分析，通过将各组的rna-seq提取差异基因取交集，最后拿这些交集差异基因做wgcna可行吗
我最LD 分析的时候，用的参数是 PopLDdecay -InVCF $workdir/00.filter/Europe-snp-2.vcf.gz \ -SubPop ${i}_popid.txt -MaxDist 100 -OutStat ${i}.stat Plot_OnePop.pl -inFile ${i}.stat.gz -output ${i}.ld 数据是50k的山羊SNP芯片，位点有43000个snp,做出来的...
在分析xpclr Rod 时候，我发现计算出的value 和 smooth.value 结果有差别，我想知道smooth.value 是怎么计算出来的？ chrstartendvaluesmooth.value NC_062971.11100000-0.632539336016865-0.430585052618588 NC_062971.150001150000-0.632539336016865-0.433298065264543 NC_06297...
...原始数据，看了一些下载教程，方法各异，看完思路还是不清晰，以下记录我的操作步骤，仅供参考。其中红色圆圈为步骤记录，蓝色为补充或其他选择： 一、NCBI搜索 进入NCBI官网，选择“BioProject”，搜索文献中提供的项目...
...ackage ‘later’ ... ** package ‘later’ successfully unpacked and MD5 sums checked ** using staged installation Running configure script -latomic linker flag not needed. ** libs g++ -std=gnu++11 -I"/share/work/biosoft/R/R-v3.6.1/lib64/R/include" -DNDEBUG -pthread -DSTRICT_R_HEADERS -I"/s...
...单的样子。。。。 但是，大部分非专业人士应该是说不出所以然来的，所以今天学霸姐姐就为大家简单解析一下， 一是希望大家不要再相信什么红枣、阿胶、红糖能补血的伪科学了； 二是希望能给大家的研究方向带来一点...
我用的PGDspider，转换后是这个样子的，如果设置序列放在一行，又会导致相同ID有两条序列的现象，导致比对不成功，您有什么建议吗？
...k2,2n >pvalue.bed筛选关键的SNP时发现，生成的pvalue.bed文件不符合命令要求，我们是哦第一列、第二列、第二列、第四列，但生成的bed文件总是重复第四列，这个问题是出到哪里了呢？ pvalue.txt数据展示： 生成的bed的错误格式...
老师您好！ 我在做WRKY基因家族分析时，使用perl脚本KAKS_SHAIXUAN.pl筛选串联重复基因，找不到有序列符合教程中说的序列相似度75%以上，且比对到的长度大于长序列的75%长度，请问这合理吗？主要是第二个标准达不到要求，请问...
...那么在溶菌时，溶菌液很难和细菌液充分混合，导致溶菌不彻底的问题，这样会造成质粒的回收率比较低； 而如果细菌溶度比较低，溶菌液和菌液均分混合，会造成溶液中含有较多的蛋白质、染色体以及菌体碎片，在这...
老师您好，我在分析家族motif中出现了这个情况，请问是什么原因呢，我该怎么解决呢，我使用的是DOCKER,非常感谢老师！
...确吗？2、我用DNAMAN翻译的序列和用NCBI上查到的ORF区序列不太一样，我后续预测理化性质什么的话，我用哪一段比较好呢？
你好！ 在pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3中，第二步测序引物和barcode的去除中，barcode和引物是每个样本特定的，还是全长转录组-pacbio共有的？ 请问你知道从哪里可以找到barcode和引物的fa文件吗？？
老师您好! 做了选择清除分析后，得到了候选基因。 候选基因的gene id是这种格式：MA_10437256g0010。 这属于什么格式呢，我要怎么把这种格式转换成gene name、symbol（比如：ACOX1式）呢？
...个基因家族，用的文件（AT.gff，AT.collinearity）做基因加倍分析绘图，circos没有问题，怀疑是family.ctl，或者MADS_box_family.txt文件出现问题， 其中family.ctl文件如下： MADS_box_family.txt格式如下：