找到约 15 条结果

问题 Fst染色体数量不对

进行Fst分析之后染色体数量不对是什么原因呢？怎么确定Fst中曼哈顿图的阈值线呢？

文章 解读：2019年度高被引科学家名单透漏出哪些信息？

...的重要量化指标，通过每年度的“高被引科学家”的数据分析，甚至可以预测出诺贝尔奖得主。中国超越英国，排名第二！在2016年，中国“高被引科学家”人数还排在全球第4位，位于英国和德国之后，到今年，已经全面超越英...

问题 使用allhic挂载染色体时，长度排序前十的超长contig只有一个挂载到group中，如何将这些未挂载的超长contig也绘制到heatmap图中

老师您好！我分析的物种是二倍体高杂合植物，11条染色体，hifiasm组装后长度大于60M的contig有11条，剩余绝大部分contig都在100Kb以下。无近缘物种基因组。 为了进一步组装染色体级别基因组，并查看组装是否有错误，用allhic进行...

问题 群体遗传进化课程中基于pi用R脚本绘制曼哈顿图请问更改色板颜色的具体指令

...使用了默认的四个颜色，也用了ggplot2包自带的色版，都不可以，应该是代码没输入正确，请老师帮忙看看，谢谢！

文章 人源化抗体包含哪些？义翘抗体人源化服务简介

...会引起人抗鼠抗体（HAMA）反应， 导致抗体半衰期缩短（不到20 h），治疗效果减弱。利用DNA重组和蛋白质工程技术，对抗体基因进行重组，可在保留鼠源抗体对抗原有效结合部位的同时最大限度地降低非结合部位的鼠源性。这种...

文章 linux 用户 环境变量 ~/.bash_profile、 ~/.bash_login、 ~/.profile

...,当登录时以及每次打开新的shell时,该该文件被读取。 （5） ~/.bash_logout: 当每次退出系统(退出bash shell)时,执行该文件. 另外,/etc/profile中设定的变量(全局)的可以作用于任何用户,而~/.bashrc等中设定的变量(局部)只能继承 /etc/profile...

问题 某物种没有基因组，做了转录组（RNA-seq）,蛋白组（ITRAQ），要研究该物种某个基因家族，怎么做？

如题。请大神们能够提供参考文献就好了，不需要多，谢谢！

问题 单细胞细胞周期相关基因文件准备中遇到的问题

...es和g2/m时期的g2/m.genes，没有G1时期的，能解释一下为什么不加G1时期的？ 3还有就是G2/M这里面的基因是包含G2，G2/M和M时期的所有基因还是只有G2/M时期的基因？

文章 HISAT和STAR比对软件比较

分析流程： 人基因组比对 比对参数 比对用时 比对率 找到的差异基因 参考文献：https://ieeexplore.ieee.org/abstract/document/10178793

文章 SCTransform ,Error: useNames = NA is defunct

SCTransform在seuratv4的时候没问题,升级到v5的时候不工作,出现报错 > brain <- SCTransform(rep, assay = "Spatial", verbose = TRUE)Running SCTransform on assay: SpatialRunning SCTransform on layer: countsvst.flavor='v2' set. Using model with fixed slope and excluding poisson ge...

问题 全基因组选择BayesC模型代码部分疑问

...-tcrossprod(X)/ncol(X)，分母的ncol(X)和常规的VanRaden G矩阵定义不一样，这个会对结果有影响吗？ （2）在K折交叉部分，训练集是1093个样本，但是代码中设置的sets是round取整，这样会导致set只有1090个，order之后产生3个NA，这一步会导...

问题 我做群体结构研究

没当到了绘图步骤的时候，就会报错，保存原因是：pi_manhattan_plot.rcommand not found…我做了不同的分析，发现只要调用.r结尾的软件，绘图之类的就会报错，怎么解决

文章 在Windows系统中安装并使用seqkit工具

...n level:  format   range   default  comment  gzip     1-9     5        https://github.com/klauspost/pgzip sets 5 as the default value.  xz       NA      NA       https://github.com/ulikunitz/xz does not support.  zstd     1-4     2        roughly equals to zst...

文章 R语言中的颜色以及色板

...个版面矩阵将五个色盘颜色全部显示出来： par(mfrow=c(1,5),mar=c(0.5,0.5,2,0.5),xaxs="i",yaxs="i") n<-1000 barplot(rep(1,times=n),col=rainbow(n),border=rainbow(n),horiz=T,axes=F,main="Rainbow Color") barplot(rep(1,times=n),col=heat.colors(n),border=heat.colors(n),horiz=T,axes=F,m...

问题 家族基因鉴定

老师您好！再按照基因家族分析视频的步骤建立了物种特异的NBs-LRR.hmm后再次进行NBs-LRR的搜索时，出现Error: TC bit thresholds unavailable on model SES208_domain。 操作步骤都是按视频上来的，为什么会出现这种情况呢？