在 Linux 中，你可以使用 diff 命令来比较两个文件的内容。diff 命令会显示文件之间的差异。下面是 diff 命令的基本用法： diff file1.txt file2.txt 这将比较 file1.txt 和 file2.txt 两个文件的内容，并显示它们之间的差异。如果文件相...
...权重和 SOM 网格中靠近它的神经元会朝着输入矢量的方向调整。一旦确定了 BMU，下一步就是计算其它哪些节点在 BMU 的邻域内。自组织的组成部分初始化：将所有连接权重初始化为随机值。竞争：输出节点相互竞争激活的机会，...
如图所示，我在做比较基因组学python版本的MCSanX绘图最后一步根据配置文件出图时显示这样的错误提示，这是为什么呢，我检查了一下我的文件格式什么的都没有错，命令也没有输错。请老师指点一下。
...换网站：1、BioMart：asia.ensembl.org/biomart，该网站参数配置比较麻烦；2、DAVID：https://david.ncifcrf.gov/conversion.jsp，该网站参数配置一般，但是网站响应速度太慢。
在学习比较基因组课程中，我使用从葫芦库基因组数据库中下载的genome.fa,cds.fa,pep.fa,gff文件运行01.prepare_data.sh脚本时可以正常的获得gff文件，但是在提取cds和ped时，出现报错 报错如下
三倍体等多倍体怎么做比较基因组，是用全基因组做，还是挑其中一套染色体做呢。因为担心如果用全基因组做单拷贝基因会很少。，一套染色体做又担心不能说明亚染色体的情况
GDC上的TCGA的转录组数据，目前支持3中类型下载，分别是Count, FPKM和FPKM-UQ， 下载哪一种比较好呢？
老师您好，我在使用raxml-ng构建进化树时，发生了报错，模型选的是LG+G8+F，错误如下：
...都是基于比对结果来进行后续各项分析的，比对结果格式比较常见的是sam和bam文件，例如转录组Tophat分析软件输出的比对结果为.bam文件，而重测序中BWA、bowtie等比对软件则主要输出为.sam文件。 samtools是一个用于操作sam和bam文件...
...的方法包括：随机森林（RF）、支持向量机（SVM）和逻辑回归（LR）。作者分别对发病土壤和健康土壤的微生物群落进行学习并构建分类模型，根据准确度，作者选择了随机森林（一种用于分类和回归分析的稳定机器学习算法）...
...码gene (pc gene） 间的表达相关性，一般采用皮尔逊相关系数。具体如何做呢？ 1. 首先获得lncRNA 的表达矩阵 > head(lncRNA) lncRNA1 lncRNA2 lncRNA3 lncRNA4 lncRNA5 sam1 7.80 5.81 6.40 6.11 4.87 sam2 1.47 1.75 2.49 2.20 2.02 s...
使用fpocket计算出来的蛋白质靶点不能使用pocketmatch比较，它报这个错误Step0-cabbage-core: malloc.c:2401: sysmalloc: Assertion `(old_top == initial_top (av) && old_size == 0) || ((unsigned long) (old_size) >= MINSIZE && prev_inuse (old_top) && ((unsig...
高通量测序横行的时代，主角分子标记也从SSR变成了SNP；无论是重测序还是转录组都会生成SNP信息，下面，小编教你画一个高逼格的SNP标记在不同的染色体的分布密度图（如下图所示）： 该图使用 CMplot 包来绘制，不过需要...