RNA SEQ数据有原始的计数数据，标准化后的计数数据，还有转化后的FPKM或者RPKM数据这么多种。请问各位老师，应该拿哪一种数据来构建WGCNA网络
...象直接可以绘制出每一个样本芯片的灰度图， 以GSE66196数据为例，绘制第一个样本灰度图。 image(AffyBatch[,1]) 相关课程：GEO芯片数据挖掘、GEO芯片数据标准化、R语言画图 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你...
已发表的文章的原始数据往往会公布出来，大家可以基于原始数据进行信息深挖，结合自己的生物学问题也可以撰写出不错的文章。 这些公开的数据大部分会上传到大型数据库，少部分会进行自己网站的构建后放在自己的网站...
...上，遇到质疑时最有力的回击方式之一就是提供原始实验数据。遗憾的是，并不是所有原始实验数据都能被很好地保存。一方面，古老文章的实验数据往往记载在纸上，时间一长比较容易受损或者丢失。另一方面，在管理不善的...
...列等。拿到序列后，面临的一个重要问题就是：选择什么数据库进行比对才能得到较好的分类鉴定结果呢？其实针对每一类生物的主要marker序列都有相应的数据库以方便比对鉴定。今天卢瑟菌就和大家简单聊一下微生物生态研究...
老师好，GWAS教程最后一章提到了LD热图的做法以及候选基因的筛选，但“优势单倍型”结果的统计并没有提及。想问一下老师，有没有这部分的教程？
在我们的课程中介绍了TCGA下载miRNA数据的方法，但是下载的数据是miRNA 基因水平的表达量，而不是miRNA的5p 或3p的表达量。那么如何下载miRNA的5p, 3p 表达量呢？ 可以参考如下的代码： # 设置下载的参数 project <- "TCGA-CHOL" data_cat...
老师您好！我在使用你们提供代码在GDC数据库下载数据在询问目录下载TCGA-CHOL项目时候用R跑代码提示以下错误请老师帮我看看谢谢！ GDCdownload(query = query, + directory = DataDirectory,files.per.chunk=6, method='client') Downloading...
老师，请问能够再分享一下hgmd数据库的下载版本嘛，最近HGMD数据库进不去了