...老师:请问为何测序公司三代转录组测序给出的CDS有很多不是ATG开头?我测的是真核植物,我的理解是真核生物CDS不是以ATG开头么?事实上很多确实都是以ATG开头的,但是就是大约有1/3测的的CDS序列是以什么GGG,GCG之类的碱基开头。无法...
我在做重测序分析中的call SNP， 我发现一个山羊的测序数据call snp 运行了两天还没有结束，是不是我给的内存太小了，我的服务器的内存是128G， 我给了100G， 是不是太小，请问给多大合适，需不需要加大内存？
...域相关的基因，并批量下载其CDS等序列，以便用于做后续分析；如定量，设计引物，同源比对等等； 首先，回到首页，1.点击想要搜索的物种， 2 选择find genes by keywords 得到很多关于NBS相关的基因，共有128个基因如下： ...
我用蛋白序列id无法提取出来的文件是空的，但是我用mRNA ID可以提取出来，请问为什么？(我下载的的蛋白fa文件使用每行开头是>XP，不知道是否有影响)。
...确吗？2、我用DNAMAN翻译的序列和用NCBI上查到的ORF区序列不太一样，我后续预测理化性质什么的话，我用哪一段比较好呢？
老师，您好，请问做启动子分析得到的plantCARE.tab文件，怎么得到feature.bed 文件呢？课程的那个shell命了还是没有看懂谢谢！
...点 代码如下： n<-round(runif(1000,0,100))hist(n, breaks = c(0,25, 50, 75,100)) 第二种：指定分隔好的区间的个数，会根据区间个数自动去计算区间的大小 代码如下： n<-round(runif(1000,0,100))hist(n, breaks = 8) （2）freq: 逻辑值，默认...
转录组分析中，针对新的转录本进行长链非编码RNA的预测，有什么软件可以预测？
最近我看了不少基因家族的文章，都是纯分析就发3分了，今年是不是不好发了啊？
老师您好，根据基因家族课程中共线性分析后的操作我没有筛选到大豆中一个基因家族的重复序列，请问是我操作有问题还是没有串联重复序列也是正常的呢？谢谢老师解答
购买了RNA-Seq的有参转录组自主分析课程，但是课程中的WGCNA的参考资料无法下载，公众号中发送关键词后没有擦模考资料的下载链接
...就是非常有名的“大象牙膏”实验，虽然这个实验本身并不难，就是将浓缩的过氧化氢与发泡剂混合起来，加上一些碘化钾或其它催化剂，然后巨大的泡沫就像喷泉一样涌出……但是，这个“另类”的才艺表演，还是给观众及评...
如果没有找到GPL注释信息，只下载了上传者的GPL数据，那这部分数据是不是就不能用，如果要使用这个GSE数据进行后续分析，那么R语言代码要做什么变化？
老师您好， 按照视频讲解在使用MCscanX 进行基因组内共线性分析时，出来了串联重复的文件，可怎么判断片段复制？（视频中讲解在提取过程中，最后出来个片段复制，这是依据什么出来的？）
请问老师，在ucsc xena 中的HTseq counts这个下载的是read counts值嘛？如果不是的话，能转换成read counts 值嘛，或者说如果要用这个进行下游差异分析的话，要用什么R包呢，DESeq 2 可以吗？