...列表的形式返回键-值对。直到所有的元素都被访问过。在没有任何新的键-值对,此时each会返回空列表。 唯一适合使用each的地方就是在while循环中,例如: while(($key,$value)=each %hash){ print "$key =>$value\n";} 如果需要依...
...如序列、注释、表达量)并不简单,因为这些信息会储存在不同的表格里,这时候我们就需要利用基因ID从各个表格提取信息,使用Excel自带的vlookup函数即可实现。 2. 根据基因集的表达量信息绘制热图,如果交给公司可能会...
我在用orthofinder跑基因家族聚类的时候出现csv.error: line contains URL,请问下各位大佬怎么解决呢
这个是怎么回事啊,没有发现那个bush
...基因对然后再图中以连线的形式表达出来,那么请问老师在这些基因对中如何确定是不是segmental duplication events呢,是不是说在比对基因组过程中所有比对出来的同源基因都是属于segmental duplication events?请老师辛苦做出详细解答...
...得到了图三所示结果(图三)。 图一 图二 图三 在CD-search 里面,Incomplete出现N/C/NC端不完整的片段,是直接从XXXX.fa里面删除整条ID序列吗? 完成三大数据库的比对后,在hmmsearch第一次搜素结构域时,我的如何对接上?
老师,共线性分析结果有一条连线 但这个文件里面没有基因对,老师,是因为我研究的家族本身没有基因通过共线性发生加倍现象吗?但是有连线时怎么回事呢?
老师,您好,我在运行gatk的HaplotypeCaller时,因为样本过多(二三百个样本),运行成功的单个样本运行了24+个小时,尝试了采用ParaFly工具多任务并行,并且也尝试了同时运行多个nohup sh gatk.g.sh > gatk.g.sh.o&(一个gatk.g.sh对应...
具体报错信息如下: NOTICE: Running with system command <coding_change.pl ./indel_AT899.refGene.exonic_variant_function.orig /data/home/zhangzhi/genome-9-8//unknown_refGene.txt /data/home/zhangzhi/genome-9-8//unknown_refGeneMrna.fa -alltranscript -out ./indel_AT899.refGene.fa -newevf ....
我通过转录组和蛋白质组学分析筛选了一些关键基因,想进一步分析转录因子结合调控
在使用BaiduPCS-Go上传大量文件的时候,突然有一天无法上传了,卡在准备上传的界面不动了, 经过排查,发现 ~/.config/BaiduPCS-Go 目录中的 pcs_uploading.json这个文件异常的大,可能是因为上传错误的累积等原因导致他一直没有清空,我们...
...存并激活 最关键的一步就是制作过滤器: 首先,随便在pubmed中搜素一下找到:manager filters 点击进入(在右下角红框框处),当然我的IF已经设置好了。 其次,进入之后按下面步骤建立filter,关键为step2 制作过滤条件:...
运行脚本文件时出现上述问题,之前也遇到过,后来不知怎么就好了,今天又出现这个问题
老师,我安装EPIC报错了,是怎么回事儿呢?
...的domain为空。经过查证,是id格式不同导致的,但是应该怎么修改呢,希望各位老师能够答疑一下,附图片。 第二张图片是下载下来的pep.all.fa的文件。 第一张图片是通过命令分析出来的txt文件