老师，您好。我在做motif分析时，MEME展示出来的motif名字就是motif1、motif2、motif3……但我在看文献时发现很多文章展示的是保守结构域（C图），它是从motif命名转化而来的吗？如果是，我怎么知道MEME搜索出来的每个motif是什么名...
我报名了conet网络构建的课程，用提供的数据文件分析完全可以，但是用我的数据文件就报错。我尝试了用测序公司提供的xlsx格式，并把数据形式改成和课程提供数据完全一样，再转化成txt制表符文件格式后输入，选择第二个选...
补问：在用官网的biolinux系统做motife分析的时候，输入meme软件的时候，显示没有这个软件，请问怎么安装？ 初涉生物信息，不胜感激
你好，我的参考基因组scaffold有24条，做CNV分析时，命令改怎么调整呢？
...-Linux是功能齐全的、强大的、可定制的、易于维护的生物分析工作站。Bio-Linux基于Ubuntu提供500多个生物分析程序，由一个 图形化的菜单进行管理，能方便地访问到其生物分析文档系统及对测试程序有用的样本数据。用于处理新...
...ator_modify.py -i subsample.reheader.min4.fasta -t test_set1.tsv）进行分析的出现了错误，但是也出现了结果。最后运行的结果如下：这是说明结果是没有检测到基因渗入吗？运行命令出现的错误对结果有影响没有？ test_namep1p2p3p4outdfoil_modes...
...后一列染色体颜色的设置，这个文件染色体的设置，好像不支持其他颜色，大家一定要注意； 更多circos颜色设置可参考官方说明： http://circos.ca/documentation/tutorials/configuration/colors/lesson 更多生物信息课程：https://study.omicsclass...
...Execution halted 多次运行一直没跑过去，可能就是网络信号不太好，过一段时间后就可以跑通了。
...include = FALSE 'asis': 将运行结果直接插入文档，不添加其他容器元素。默认情况下，knitr 在生成 .md 文件时会将代码的文字输出在放在 Markdown 的代码块 ``` 中 'markup' 默认设置include: 是否显示代码块和运行...
...单细胞测序结合bulk测序纯生信 ：LUAD的scRNA-seq进行了全面分析，以剖析肿瘤浸润NK细胞的分子特征并识别标记基因。随后，作者构建了一个NK细胞标记基因特征（NKCMGS），并分析该特征与LUAD预后和免疫治疗反应之间的关系。Song P,...
绝大数生信分析都要用到参考基因组数据，但有些基因组的数据会让人十分头疼，例如NCBI上的基因组数据。 其gff文件是这样的： 什么基因ID、染色体编号都是有自己命名规则的，跟我们通常用到的完全不一样。遇到这种情...
...为例，如何解决。 这个报错的原因是缺少这个字体。分析：1. 在安装完程序后，重置环境变量 .bashrc 或者.bash_profile ， 可以先重新启动终端。 2.如果是之前安装的程序，可以对其进行升级，升级之后，旧版的没...
...么来做基因组调研图？ 基因组的调研图一般都会使用kmer分析来实现。kmer分析通常都是基于30到80×的二代测序数据去完成。 如何预估自己所需测序数据量？ 1. 流式细胞仪： 通过测量细胞核的DNA含量来估算基因组大小，1pg=978M...
老师，这个网站打不开，是需要翻墙么？ 还是网站歇菜呢？ 在染色体位置和转录本结构分析时有没有其他可以代替的网站或者软件。
用cafe5做基因家族扩张和收缩分析，一开始会报错Families with largest size differentials，删除这些差异太大的家族，一直重复删除到如下提示： 不再具体提示差异大的家族ID，但还是报错Failed to initialize any reasonable values，请问各位老...