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文章 awk批量输出同分类内容至同文件

一次性 利用 awk 将文件内分属同类型的数据输入到同的文件中。结合分类命名文件,批量完成。 以下方数据为例:数据以tab分隔,基于第二列新型分属同类别,基于这些分类将数据拆分  写入同文件。 Sme2.5_00225.1_g0000...

问题 请问,在3个数据库中进行结构域确认时,为什么我出来和老师一样的结果,是是使用的_pep_need_to_confirm.fa文件里面基因名称一行需要修改?

结构域确认用到的序列文件: 导入Interpro后我的结果: 老师的结果: 为什么一样呢,没有出来结构域信息

文章 腾讯云服务器获取指南

...器关联的 SSH 密钥文件本地存放地址。 3、您的密钥必须公开可见,SSH 才能工作。请使用此命令:chmod 400 [密钥文件路径]。 4、输入命令:ssh [-i 密钥文件路径] root@公网IP。      

文章 kraken2生成的biom文件处理

...做宏基因组或扩增子项目物种注释项目的时候,如果后续使用bracken则可能会遇到一个问题,结果生成的biom文件中taxonomy并是最终结果,比如下面这样 可以用脚本来处理,删除未具体命名的分类级别 import argparse from biom imp...

问题 ORF (bp) ,domain starteend,Sub-cellular localization和No. of introns怎么找

老师,我想请教一下,根据我们基因家族分析课程的结果,ORF (bp) ,domain starteend,Sub-cellular localization和No. of introns怎么找

问题 在SNPcalling结束后进行合并gvcf文件的时候发现文件里只有双亲的信心,核查发现两个子代的gvcf文件的表头中两个池的名字都是感亲的名字这个怎么修改

...字这个怎么修改?或者是哪里出现了问题? 四个文件并一样大小 感病亲本 子代感池,名称那一栏,子代的名字变为了Sparent 子代抗池,里面抗池名称那一栏变为了Sparent

问题 利用ParaAT2.0生成计算KaKs所需要的AXT文件,但是AXT文件为空

我想通过ParaAT2.0批量生成AXT文件,用于后续的Kaks_Calculator分析。在用ParaAT2.0时我发现生成的比对结果(AXT格式文件)都是空文件,里面没有序列比对结果。我又用软件里提供的例子文本运行了一遍,结果也是一样。请问这是为什...

问题 老师,在下过程中一晚上了,请问如何解决?

>                       sample_type <- "Primary Tumor" > # 该癌症总样品数量 > samplesDown <- getResults(query.met,cols=c("cases")) > cat("Total sample to download:", length(samplesDown)) Total sample to download: 582 > # 下甲基化数据,数据非...

问题 请问WIN11基于WSL2安装了docker,但是怎么像基于hyper-v安装的docker一样来获取别人分享的公共镜像,这个setting中的daemon中没有registy mirror 可以修改,应该怎么办?

如下图,在Ubuntu中安装了docker,但是能使用docker search omicsclass, 怎么修改添加自己的镜像,跟hyper-v安装的docker并一样

问题 我的转录组数据与参考基因组比对后发现基因间区及内含子比例较高,是怎么回事?

我的转录组数据分析发现基因间区及内含子比例超过了30%,是是很高,一般是多少?是什么原因造成这两类比例高?

问题 请问老师我做了一个植物 基因原核表达到体里验证功能 验证这个植物基因TPS家族的一些基因。

请问老师如果我做TPS家族的基因家族分析,我的这个实验结果可以放到文章里面吗? 我的实验得出了这个植物的一些基因的TPS功能表达。

文章 siRNA

...的降解能够有效“敲除”相应蛋白质的表达。然后可研究分析靶蛋白浓度降低造成的影响。 siRNA 的作用原理: 将双链 RNA (dsRNA) 引入细胞。 细胞中的 Dicer 蛋白将 dsRNA 消化为 21 bp 的 dsRNA (siRNA)。 siRNA 被整合到 RNA 诱导沉默复...

问题 带编制!招聘博后、讲师、副教授。福建农林大学转录系统生物学课题组招聘

...量MNase-seq,ATI,SELEX,ChIP-seq,ATAC-seq,RNA-seq数据,以及分析指导。以下背景优先: 1.基于高通量测序的表观遗传学技术 2. Linux、r或python编程、功能基因组分析 3. 蛋白质/核酸化学、分子机器设计、超分子化学   相关待...

文章 组学大讲堂教程优惠信息

...,涵盖转录调控、群体重测序、癌症数据库挖掘、基因组分析、Linux系统使用、微生物研究、计算机语言(Python、R、Perl)等方向,学员数量已超过35000人!多门课程被推送到网易首页推荐位,并在网易官方的金云奖评选中荣获平...

文章 ImmuCellAI 免疫细胞估算,RNA-seq 和芯片数据

...于2020年4月发表在AdvancedScience 杂志上 (IF = 15.8)。 在该分析方法中,ImmuCellAI能够基于RNA-Seq或芯片的转录组数据,准确地估计18种T细胞和6种其他类型免疫细胞的比例,包括B细胞,NK细胞,单核细胞,巨噬细胞,中性粒细胞和树...