问题 老师，您好，请问知道登录号的情况下，怎么在EMBL数据库里下载全基因组的表达数据，我想从中提基因家族的表达数据做热图

文章 O2PLS-DA分析

两组学数据的正交偏最小二乘法判别分析（2-way orthogonal Partial Least Square with Discriminant Analysis ） O2PLS 模型用于两个数据组间的整合分析，包括系统生物学组学间关联、分子调控机制-表型间关联等各种大数据组的内在联系都可通...

文章 Excel数据分析技巧之方差分析

...次重复，用以检测该处理对水稻产量的影响。具体操作：数据--数据分析--方差分析：单因素方差分析--确定。 1选中目标数据，点击工具栏中“数据”选项。 相关概念解释：方差分析中，所要检验的对象称为因素（factor），...

问题 怎么下载ICGC数据库里，某个基因的所有的突变数据

问题 老师你好，请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量我有几个不同浓度胁迫下的转录组数据，想利用此数据分析一下某基因家族，请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量?依据表达量画差异表达图？

问题 WGCNA分析中，导入txt的性状数据时（数据为12行样本，10列性状数据），报错Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec, : line 1 didot have 12 elements。但是数据如果是12行样本，8列性状，不会报错

各位老师，WGCNA分析中，导入txt的性状数据时（数据为12行样本，10列性状数据），代码为traitData = read.table("liunatrait1.txt",row.names=1,header=T,comment.char = "",check.names=F)但是报错Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec...

文章 Linux环境下从百度网盘上传、下载数据

...tall bypy -i https://pypi.doubanio.com/simple 2. 授权     首先把数据上传到百度网盘，打开浏览器，登陆百度网盘，保持此页面。     回到linux系统，输入 bypy info     从Linux输出屏幕中得到一个链接，复制到浏览器打开（第一步...

文章 Excel多数据数值运算

准备好数据，在空白位置输入要上调的数字，这里以100,000,000为例。 按住Ctrl+C复制好100,000,000，然后选中要上调的数据。接着右键，点击选择性粘贴。 在选择性粘贴里面有个运算，选择里面的加 最后，所有的数据就会加...

问题 请问没有我研究物种的基因组数据，可以用近源物种的基因组数据进行基因家族成员鉴定吗

我能查到的是转录组数据还是SRA，和叶绿体基因组数据，就是没有全基因组数据

问题 hmm文件搜索问题

你好，我做小麦基因家族分析时筛选得到的Terpene_synth_C_removed_redundant_and_confirmed_IDlist.txt这个文件的基因是141个，运行下面的命令，得到的Terpene_synth_C_domain_new_out_removed_redundant.txt这个文件怎么是147个？谢谢老师 ！ manager@bl8vbox[ge...

问题 老师您好，请问怎么从GEO中几万个基因数据中找出几千个想要的基因数据呢？或者我已经筛选出了差异表达基因，我怎么找到这些差异表达基因的具体数据？

问题 老师您好，您之前的文章有一篇《TCGA临床数据各列含义》，有一部分临床数据找不到，请问有没有官方文档可以找到全部临床数据各列含义？

问题 想请问安捷伦双通道芯片数据得到了cy5和cy3通道的数据，想要做一些其它的分析，请问可以单独提取cy5的数据吗？然后对cy5中的数据重新进行别的分析？比如细胞类型反卷积之类的

我想要分析cy5通道样本的变化，能否只单单提取出cy5通道的样本呢？表达矩阵是通过exp=exprs.MA(averMAList)这个操作得到的

问题 数据分析

通过GEO数据库和TCGA数据库分析得到的关于同种癌症的差异表达基因，能不能通过韦恩图将两个差异基因数据合并寻找交集进行分析？

问题 转录组数据

老师您好，我想画热图，所以在GEO数据库中下载了转录组数据，但是我发现下载的数据基因ID和我的对不上，这怎么办呢？