...: ①课程针对0基础学员设计,半自动化分析; ②采用docker虚拟机技术,不同操作系统保持一致分析步骤; ③云服务器上教学,避免电脑性能不足; ④提供回放视频,两年内可反复学习; ⑤问答社区解决售后技术问题。 ...
这是手动找出来的基因,在docker里list也是没问题的,检查了其他文件也没问题,基因也能对上很多 这是之前WRKY的截图,只有一个,后面做FAE1也是一模一样的情况 是list里面的基因格式有问题么?文件里是这种BnaA01G0038300GG BnaA0...
...易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下: 1.docker 生物信息工具安装 2.OTU网络图 3.R 语言入门与基础绘图 4. 转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容:linux、perl、R语言...
...前期数据准备与后续进化树构建分析: #运行环境准备:docker镜像启动#镜像下载:docker pull omicsclass/pop-evol-gwas:v1.3#启动遗传进化镜像docker run --rm -it -m 4G --cpus 1 -v D:\pop:/work omicsclass/pop-evol-gwas:v1.3#对vcf文件进行数据过滤...
...程 6. 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精...
老师您好,我在用 omicsclass 的docker 镜像进行基因组重复序列注释时,出现如下错误该如何解决? W tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:64] Could not load dynamic library 'libcuda.so.1'; dlerror: libcuda.so.1: cannot open shared object file: No ...
...果的CV值都随着K增大而递增,用的是群体遗传进化课程中docker的代码,如下: workdir=/work #设置工作路径 refdir=$workdir/ref datadir=$workdir/data scriptdir=$workdir/scripts export PATH=$scriptdir:$PATH GROUP=$datadir/yuan.txt #LD过滤 plink --vcf $wo...
...易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下: 1.docker 生物信息工具安装 2.OTU网络图 3.R 语言入门与基础绘图 4. 转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容:linux、perl语言画...
...课程6. 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到...
...研究微生物多样性,您选对区了吗?11.微生物多样性分析docker镜像使用12.生成OTU方法如何选择,去噪还是聚类?13.微生物多样性组间差异分析—STAMP使用!14.16S rDNA你知道多少?
...ormaticsFMRP/TCGAbiolinks") 或者用我们组学大讲堂提供的最新 docker镜像,里面已经更新了最新的TCGAbiolinks包: omicsclass/r-server:lastest 用命令行代码《tcga_gene_exp_download.r》自动下载表达数据,运行命令如下: Rscript tcga_gene_exp_download....
...,不可错过,内容涵盖: (1)生信语言与工具基础:Docker安装与使用、linux系统入门、Perl语言入门到精通、Python生信入门到精通、perl语言高级编程 (2)生信绘图技能:R语言基础与绘图、R语言绘图基础(ggplot2) (3...
... 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到...