...d-DNA 进行了-r 2进行了两轮矫正，后面产生了很多小的scaf,不属于我的染色体（已经划分出20条了），这些小的片段怎么处理呢，3d-DNA中-m 是选单倍体好呢，还是二倍体模式，我的材料是自交的二倍作物，谢谢 -m --mode haploid/diploid ...
第一套数量比这套大多了，都能正常跑，这一次数据量一般，不知道为什么一直卡着不动。
在最终差异表达的数据里我不㤇Gene ID和GeneSymbol ID,我要的是探针ID,但是探针ID在这一步“"exptemp2 = aggregate(exptemp[,c(1:(ncol(exptemp)-2))], by = list(exptemp$GeneID),mean)”就去掉了，请问这一步怎么设置来保留探针ID，因为这里的探针ID实际上...
...但是跑出来是0，用的是自己的数据，前一步都还正常，不知道popid.txt如何设置，这里是按照示例文件，放了所有样品的集合，但是跑出来是如下这样 the Number of subPop samples[found in VCF] is 0 sub Group Population szie is too small, SubGroup samp...
...错： sudo pip install matplotlib 遇到报错： Downloading tornado-5.0.2.tar.gz (506kB): 506kB downloaded Running setup.py (path:/tmp/pip_build_root/tornado/setup.py) egg_info for package tornado Traceback (most recent call last): File "<string>", line 17, in <mo...
请问有已知基因家族的序列和名称，但是和基因组蛋白名称不一致，如何根据序列对应名称
不可以安装呢？？？
...s \ --kit-version="Stereo-seq T FF V1.3" \ --sequencing-type="PE75_50+100" \ --chip-mask=/saw/datasets/mask/C04042E3.barcodeToPos.h5 \ --organism=mouse \ --tissue=brain \ --fastqs=/saw/datasets/fastqs \ --reference=/share/ref/Mus_musculus/Mus_musculus_index \ ...
...，我现在通过转录组测序的数据找到某个蛋白质家族中的不同成员在两个实验对象中具有差异，所以想对这个蛋白质家族成员构建系统发生树，具体操作是从网上下载了她们的DNA序列和蛋白质序列，导入至maga软件中进行序列比...
...平等的。 如下图所示： 课程推荐：微生物扩增子分析课程实操 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读
...blastdb -dbtype nucl -in /share/work/biosoft/RepeatMasker/RepeatMasker-4.1.5/Libraries/test/RepeatMasker.lib > /dev/null 2>&1
就如上图这样，是提取什么数据来构建这个散点图的。 不知道怎么提取出这些数据，麻烦老师抽空说下。
...o/download/ 各个参数的含义： -r : 遍历所有子目录 -np : 不到上一层子目录去 -nH : 不要将文件保存到主机名文件夹 -R index.html : 不下载 index.html 文件
...作呢？是分别对两个群体做出来的结果取1%么？这个有点不太懂哈，请老师解答，谢谢！