...有一个 Screen 会话： screen -r 分离 Screen 会话 你可以在不终止程序的情况下分离 Screen 会话： 按 Ctrl-A，然后按 D 这样你就可以退出 Screen 会话，而其中运行的程序依然在后台运行。 高级用法 创建多个窗口 在一个 Screen 会话...
想法是获取拟南芥植物的所有成员序列，然后通过分析获取隐马可夫文件，然后通过该文件在新的物种中获取该物种的一些信息？ 以及如何构建隐马可夫模型
这是共线性分析视频中blastall 这一步报错如图： 具体： manager@bl8vbox[mcsanX] blastall -i pep.fa -d pep.fa -e 1e-10 -p blastp -b 5 -v 5 -m 8 -o mcscan/AT.blast [11:41AM] [blastall] WARNING: Unable to open output file mcscan/AT.blast: [blasta...
老师好，最近在学习您的课程《基因家族分析》，在获取基因与mRNA的对应关系时遇到一个问题。由于根据结构域预测导出的结果中给的是mRNA的Name,而不是ID，因此无法参照您给的命令得到想要的结果，但又不知如何操作，望指点...
各位老师： 请问WGCNA可以将来自不同组织的表达量数据放在一起计算吗？ 我有四个不同组织的表达量，每个组织三个重复，可以当作12个样本将表达量进行WGCNA分析吗
R语言中的函数调用报错，一般不是很精确，很难查找到出错的具体原因。但是在R中可以采用traceback 进行初步的判断。 以下是一个示例：在运行gdcCEAnalysis 这个函数时，报错“names' attribute [11055] must be the same length as the vector [2777...
您好，我看了您发布的《pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3》的文章，另外我在github 上也看了isoseq3的流程，发现您的文章中没有isoseq3 refine 这个步骤。不过虽然github上有这个步骤，但是isoseq3 中并没有refine 这个工具（...
老师好，请问我在群体遗传分析构建进化树这一步运行转换为phy格式的文件，“run_pipeline.pl -Xmx180G -importGuess $workdir/00.filter/clean.vcf.gz -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter” 得到了如下结果，一直提示不能有染色体名...
... 我们期望是TPR越大越好，而FPR越小越好。 在《TCGA-生存分析》课程中，我们就是采用多因素COX回归构建一个Risk Score ,基于Risk Score 值的划分边界不同，可以筛选出最优的预测模型。
...核酸降解成3~5个碱基长度的5'-单磷酸寡核苷酸。义翘神州不仅可以提供研究级核酸酶，依托于ISO 13485和GMP体系，还可提供高效、高质量、应用广的GMP级别全能核酸酶。同时我们提供核酸酶残留检测试剂盒，在解决生物制品核酸污...
...软件包就会尝试从TCGA源或任何内部研究中有效地汇总，分析，注释和可视化MAF文件. 使用说明： https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/maftools/inst/doc/maftools.html
...基因有多个转录本，出现多个utr是正常的，那应该XM也是不一样的，而这个基因XM一致，说明是同一个转录本，但是有两个UTR。
...置于文章中，但该图片无法直接保存，而截图获得的并是不矢量图，在后续应用中可能会有麻烦。 下面我们介绍如何使用软件TBtools从xml文件中获取“motif locations”的矢量图。 1.选择工具 选择Java打开软件TBtools，这个软件有很...
进行植物基因注释之前，需要对植物基因组重复序列进行注释，直接用EDTA流程进行注释是否可行？相比《动植物基因组组装与注释分析实操》的流程，EDTA流程是否只是遗漏了串联重复序列和小部分的反转录转座子？
老师： 您好！ 我最近在做玉米基因芯片的数据分析工作。但是我发现芯片文件（GPL.soft）中这些ID都很生僻（如图）,不知如何转换成传统ID？ 貌似那个TIGR ID已经绝版了？我在TIGR ID的对应网站无法下载到对应的转换文件（http:/...