找到约 15 条结果

问题 老师您好,我线下上过您的基因家族培训课程,目前尝试用大豆基因组进行分析,但我发现从ENSEMBLEPLANT下载的基因组序列格式跟拟南芥的注释格式不一样,我已经尝试着进行了 一些编辑,但还是无法统一ID,麻烦您帮我解决一下这种基因组注释格式修改问题

...lycine_max.Glycine_max_v2.1.pep.all.fa ,格式信息如截图所示(我基因家族培训QQ群里发布的那张图是我自己尝试编辑修改后的),期待您的帮助,非常感谢!

文章 借助perl脚本进行文件整理 | 将按第一列信息整理的文件改成按照第二列信息整理

perl data.pl id1.txt id2.txt 现有一文件,有两列,是按照第一列内容进行展示的,如下图:A    green;red;blueB    yellow;greenC    red;blue;grey;pink;blankD    green;grey现想将文件按照第二列数据进行整理查看,如下图:blank   Cblue    A Cgre...

文章 做进化树,到底哪种算法适合我?

...。独立元素法包括最大简约性法(Maximum Parsimony methods)最大可能性法(Maximum Likelihood methods) 距离依靠法(distance methods):是指进化树的拓扑形状由两两序列的进化距离决定的。进化树枝条的长度代表着进化距离。距离依...

问题 GAPIT使用异常

加载R包的过程中存这个问题,好像是这个R包被替代了 但不知道替代他的R包哪里下载 望老师帮忙 解决下。。

问题 GAPIT使用异常

加载R包的过程中存这个问题,好像是这个R包被替代了 但不知道替代他的R包哪里下载 望老师帮忙 解决下。。

问题 老师,您好。我完全按照视频课程整理好自己的数据,按照相同的操作,案例数据可以出图,自己的数据却不行。您可以指导一下么?我的OTU ID不对么?还是我的丰度值太大呢?我没有搞明白我的数据错哪里还是说筛选的时候要更改设置?感谢!

问题 基因家族分析的课程里,提取结构域序列,WRKY基因家族当时以提取第一个结构域序列为例,两个结构域都是WRKY DNA -binding domain,为什么要提取第一个结构域呢,我想知道怎末确定自己要提取哪个结构域序列?希望老师解疑惑

文章 stack的利用

...ack.pop() != '(': return False return len(stack) == 0 这个例子中,我们首先定义了一个空的栈(stack),然后遍历字符串中的每一个字符。如果当前字符是左括号“(”,就将其压入栈中;如果当前字符是右括号“)”,...

文章 biolinux导入虚拟电脑失败,报错VBOX_E_FILE_ERROR VirtualBox Machine settings file already exists.

...,学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程6. 生物信息入门到...

问题 遗传图谱分析课程

QTL定位这部分,如何实现多个环境下的多个性状同一张图中展示QTL定位结果,视频里只介绍了每个性状单独进行QTL定位。

文章 NCBI 中如何将GI号转换成Accession version

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门...

文章 2019最新影响因子出炉:生物类期刊有哪些变化?

...术界的一个传奇,去年发文量仅29篇,IF一年比一年高,去年达到244.585,今年回降到223.679,但依然保持第一名。 CNS: 四大医学期刊: 生物类综合期刊排名前10: 热门期刊: Scientific Reports SR年发文量一直降,今年...

问题 cafe5 Families with largest size 删掉这些基因家族后跑的非常慢

...行的非常慢是为什么?以前没有这个报错的时候运行basegamma模型都非常快,这一次出现这个报错,我按照脚本删掉了差异大的家族,然后跑了2天了还没结果. 另外,删掉这些基因家族后是重新运行base-k2~-k5还是只运行-k3就行...

问题 SRA数据上传无法继续

SRA数据上传填写过程中,出现如下问题(见图):多次修改都无法继续,不知道问题哪?

文章 紧扣前沿热点--多种研究培训,总有你需要的!

...因组时代,生物科研圈最大的矛盾是:与日俱增的数据量科研人员处理数据的能力不足之间的矛盾。所以,谁会生物信息分析,谁能处理基因数据谁就是课题组最靓的仔! 今年暑期(7月底开始)组学大讲堂为大家准备了丰富...