请教老师：我看大部分文献中在做结构方程模型的时候，大多数都用PCo1轴表示细菌或真菌群落组成，那能用NMDS1表示细菌或真菌的群落组成，并纳入结构方程模型分析吗？
老师你好，我想请问一下我通过HMMER软件筛选了一批基因 但是我无法筛选他 E-value值筛选<0.0001的值怎么也筛选不了 请问有什么好办法进行解决？我想先筛选E-value值后在进行SMART分析结构域，万分期待您的答复。
宏基因组结果解读及个性化分析，14 分箱结果系统发育树，执行以下代码： # 合并树文件和属级别tree_tax = full_join(tree,tax_info,by="label")点击tree_tax，发现其中的data为0×0 而课程视频显示的为：34×4请教，是哪里出问题，该如何解...
...、有着大好前途的女孩子依然决然低去赴死? 这里我们也不好妄加猜测， 但是据她的朋友猜测，她应该是压力太大，在生活和学术研究方面都有一些问题，并且急性焦虑症频繁发作，发作所以才会有这样的举动， 阿兰娜并不...
...相对定量表达，按照2^-ΔΔCt法(Livak法)计算出倍数后，想分析这个显著性， 因为我想做的是按照归一化法，2^-ΔΔCt这种形式的柱状图，这个显著性是实验组和对照组ct值的比较还是怎样比较啊，加Q1373917905有偿，
大家好，我想做一个物种的GWAS分析，但是我查到的该物种的参考基因组是组装到了scaffolds水平，请问如何利用这种参考基因组来构建index做比对。
得到的gene.txt文件，一般怎么使用，是一个个位点到https://www.ricedata.cn/gene/查找，还是先统计。想请老师指导后续的分析。
在进行单细胞测序过程中可不可以绘制细胞轨迹骨架图，此外，可不可以选择自己想要的细胞类群进行分析（不是root_cell）。
> # KEGG pathway 富集分析,针对ENTREZID > kegg = enrichKEGG(gene = DEG_list, + organism = 'hsa', + pvalueCutoff = 0.05) Reading KEGG annotation online: Reading KEGG annotation online: > head(kegg) ...
... 此时需要对重复的行名进行重命名处理，方法一： 先不读取行名，使用make.names函数给行命名： d<-read.table("test.xls", header = T, check.names = F) row.names(d)<-make.names(d[,1],TRUE) 查看： 此时只需要把文件多余列删除： d<-d[,-1]...
比较基因组分析最后一步时，运行 /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.graphics.karyotype --format=pdf --figsize=15x5 mcscan_seqid mcscan_layout报错，报错页面为 我的输入文件分别为 ATH.bed Anchors.simple Rapa.bed seqid layout 请问报错...
我现在在做重测序数据比对和call SNP 分析，有个问题我想咨询一下：每个测序序列生成的g.vcf.gz的文件比较大，所用能一下子生成所有的g.vcf.gz文件，所以只能先生成一部分g.vcf.gz文件进行合并成vcf.gz文件，然后在生成另外一部分...
我现在通过GWAS获得了显著性位点，该怎么去设计KASP分子标记呢？通过结合表型值判断不同基因型是否存在显著差异？还是通过基因单倍型分析找到优势单倍型，通过优势单倍型的tag位点设计KASP标记？
...您好！ 我在做植物中某蛋白酶基因家族研究中，取果实不同发育时期的转录组，看基因表达情况，使用log2处理作图，并在图中标注了原FPKM值。 如图中，自上数第2-5个条带，分别是4个基因，FPKM 都在在0-2的小数值，表现为基本...
...数据的正负性发生了改变，进而影响了我对logFC的判断，不知道该探针到底是上调还是下调了。