问题 在基因家族分析过程中，进化树的构建过程中遇到了如下图的问题：完全按照视频要求删减后加载，并经行的分析。insufficient data available for ml analysis.please validate your sequence data

问题 老师，一般在鉴定基因家族成员时，成员最少为多少个就可以做家族分析，还是不管多少个都可以做，我想着少于5个的话是不是做出来的那些图就不太好看了，就不适合做了

问题 请问在获取基因与mRNA的对应关系这一步，会出现提示说mRNA没有相对应的gene id 呢，可是文件中有gene id 呢，如图所示，而且输出的mRNAgeneID.txt里也没有转录本信息

问题 bioconductor一直安装不对

...485 bytes (4.3 MB) downloaded 4.3 MB 程序包‘lme4’打开成功，MD5和检查也通过 下载的二进制程序包在 C:\Users\陈立新\AppData\Local\Temp\RtmpGgnxVM\downloaded_packages里 Old packages: 'lme4', 'MASS', 'survival' Update all/some/none? [a/s/n]: a 有二进制版本的...

问题 想请教一下，conet网络构建的课程，用提供的数据文件分析完全可以，但是用我的数据文件就报错。我尝试了用测序公司提供的xlsx格式，并把数据形式改成和课程提供数据完全一样，再转化成txt制表符文件格式后输入，选择第二个选项（由biom格式转化来的文件），结果报错。把测序公司提供的biom格式文件输入，选择第三个选项（biom HDF5格式，还是报错）。这是什么问题呢？

文章 ROC曲线的含义

...价越低，模型的性能就越好。 x 轴为假阳性率（FPR）：在所有的负样本中，分类器预测错误的比例 y 轴为真阳性率（TPR）：在所有的正样本中，分类器预测正确的比例（等于Recall） 从FPR,TPR的定义来看，两者是一个相互制约...

问题 在WGCNA分析中，利用动态剪枝法划分模块后，通过剪枝高度合并模块，发现某一模块基因大量增多，这可能是这一些模块相似性太高了，我想可不可以不进行模块合并，直接进行后面与模块进行关联

问题 老师，我想问一下直接从某植物对应的基因组数据库里下载的FPKM文件可以直接用吗？比如说里面有各个基因在各个组织器官上的表达量，我可以直接用里面的数据做热图吗？

问题 尊敬的老师，在按照咱们课程进行选择消除分析 fst pi ROD时，可以正常输出pi.wild，为什么画图的时候图为空的，是不是数据有问题，我的数据是真菌的，fai文件只有1kb，

问题 老师您好，在做GWAS分析的时候，性状数据不是连续的数字，是0，1这种，这样的数据也可以按照上课讲的流程分析吗？性状数据没有多年数据，在后续的分析步骤中，不定义tassel_trait这个变量可以吗？

文章 R语言基础入门—判断语句

...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容：linux、perl、R语言画图，更多免费课程请点击以下链接： htt...

问题 Cytoscape的CoNet插件相关性阈值的设定

        在Method menu进行相关性、相似性以及距离计算时，我想设定pearson,spearman系数>0.6的边构建网络。         请问老师设置参数的时。是在进行permutation时设置，还是在进行Bootstrap时设置。此外我发现在设置相关性参数后...

问题 老师好，我才开始接触生信。我先在NCBI下载了大豆的G基因的fasta文件。然后和水稻基因序列进行blastn对比得到了result2.txt 的文件结果。再通过Perl脚本运行得到evalue值小于e-5的基因ID名称文件。前面都能运行。现在我需要用Bioperl利用得到的符合条件的基因ID名称文件查找各ID对应的序列，但是网上的我试了很久，一直不行，老师能帮我看看嘛？

文章 论文重复部分如何自动修改？！

...；其中Plagiarisma网站小编是比较喜欢的，该网站主打查重和语法检查，注册后可免费查询，是免费软件中比较好用的一款查重软件。 Plagiarisma的使用 Plagiarisma需要注册使用，注册后可以获得使用有限的使用权限，小编亲测，免...

问题 PSMC分析得到的psmc.fa文件总为空

PSMC 在最后fq.gz文件转换为psmcfa文件的时候，psmcfa文件为空，未见报错。在进行逐条语句纠错后仍不起效。后根据网络查找更换参考基因组未起效；改变reads深度参数，不起效。测序深度在8x左右，远低于要求的18x，请问是测序深...