问题 老师你好，我是在NCBI上面下载的枣的gff，以及蛋白质序列，做共线性分析的时候，perl get_gene_position.pl GCF_000826755.1_ZizJuj_1.1_genomic.gff AT.gff输出之后的文件与perl get_fa_by_id.pl AT1.gff GCF_000826755.1_ZizJuj_1.1_protein.faa pep.fa输出的文件是空的，应该怎么办。

问题 基因家族启动子顺势作用元件预测网站plantcare对昆虫适用嘛？

...于动物的网站，或者根据植物预测结果如何联系动物进行分析？ 此外还想请教一下根据mitof分析结果可以看到在一个基因位置基因id:9852 发生了2个拷贝，这种情况需要把这个基因拆成2个吗？9852在基因组注释结果里是1个基因，...

文章 linux命令之mv

...文件移至一个目标目录中。源文件被移至目标文件有两种不同的结果：如果目标文件是到某一目录文件的路径，源文件会被移到此目录下，且文件名不变。如果目标文件不是目录文件，则源文件名（只能有一个）会变为此目标文...

问题 情况是这样，去年我测了一个转录组，当时我做的物种还没测全基因组，也就是当时是无参的情况，今年最近该物种的全基因组数据发布了，我在全基因组中做了一个基因家族的分析，然后想在去年测得转录组中找到全基因组中相对应的基因，然后看其表达量，能否通过简单blast实现？或者有其他更为准确地方法吗？请各位老师赐教。

问题 老师我一个一个步骤进行，一个基因一个基因分析，是这个命令有问题才出现domain_final.bed只有一个基因，代码有问题么:grep -v '#' ZS11.v10.FAE1_hmmerOut.final.txt|awk 'BEGIN{OFS="\t"}$10==1 {print $1,$18,$19 }' >ZS11.v10.domain_final.bed,这是我刚刚使用的这步的代码，前一步产生的hmmerOut.final.txt文件还整常

如果代码没问题，只能手动筛选么，怎么保存成domain_final.bed格式呀

问题 lr2rmats软件

您好，lr2rmats这个软件您使用过吗？已按照要求进行安装，测试文件报错，想请您帮助解决一下。下图是测试文件出现的报错，不知道该如何解决，谢谢！

问题 您好，想问一下苹果电脑的powershell怎么导入数据？

您好，想问一下～苹果电脑的powershell怎么导入数据？因为苹果电脑就一个盘，不知道该怎么编辑代码～谢谢～

问题 纯生信的基因家族文章，比较推荐投什么期刊?

纯生信的基因家族文章是不是不太好投啊，要投的话有什么推荐的期刊吗？

问题 NGS数据分析时，使用ANNOVAR的table_annovar.pl报错。

使用自建数据库。用ANNOVAR的annotate_variation.pl进行注释时，没有报错。 [*****@head ****]$ perl ../tessDSS/annovar/annotate_variation.pl -geneanno -buildver HP ./bin/M5-31.avinput HPdb/NOTICE: Output files are written to ./bin/M5-31.avinput.variant_function, ./bin/M5-31.avinput....

文章 关于virtualbox下bioLinux设置共享文件夹出错的问题

...打开shell，输入eject后，再次在设备里选择安装增强功能 5. 点击run，输入密码，待加载结束后看提示按回车键返回cmd窗口 6. 再按视频中操作输入代码，成功设置共享文件夹。这里要注意，视频代码中windows共享文件夹标识为Window...

问题 对于标准化的数据应该如何绘制火山图呢？

因为数据有正负之分，此时直接求比值就不能够体现出二者的大小差异，可以作差比较吗？

问题 在运行命令时出现segmentation default

在重新下载过一个软件后发现在miniconda的bin目录下运行就会报错segmentation default，在其他位置就好了。 在运行admixture命令时也出现了这种情况，但是admixture官网已经不维护了，请问现在如何下载admixture？

文章 Linux系统删除/share分区合并到/home

...磁盘和分区结构 sudo fdisk -l 删除逻辑卷 rl_omicsclass--a05-share sudo lvremove /dev/mapper/rl_omicsclass--a05-share 确认删除操作（输入 y）。 4. 扩展 rl_omicsclass--a05-home 逻辑卷 将释放的 空间添加到 /home 对应的逻辑卷： sudo lvextend -l +100%FR...

问题 ssh登录服务器容易断连

ssh方式登录共享服务器，一定时间下不输入命令（比如在等命令完成）就断连接报“send disconnect: Broken pipe”；比起我在用的另一个服务器断连时间快太多了，有无方法可以解决这个问题？

问题 core_pan_gene_curve.r 运行时报错

动植物泛基因组分析：03.gene_family_pav分析自己的数据时，运行命令Rscript $scriptsdir/core_pan_gene_curve.r -i Orthogroups_PAV.tsv   --prefix core_pan_curve 出现以下报错信息 运行终止后，生成的结果文件如下 尝试从demo数据中cp Orthogroups_PAV.t...