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问题 生信技能-引物设计课程脚本里SSR引物设计中为啥我把全基因组fa文件放进去会报错

生信技能-引物设计课程脚本里SSR引物设计中为啥我把全基因组fa文件放进去会报错,如果按照染色体分割基因组文件再跑可以,我想咨询一下,这个可以改成支持超大格式基因组fa输入来寻找SSR吗?

文章 Mapchart绘制基因染色体位置图

...染色体位置图都不方便。在这里,编给 大家介绍一个比较早的软件Mapchart,来帮助我们解决这一烦恼。 Mapchart是Windows系统下,进行基因在染色体上定位图片绘制的工具,主要是针对遗传连锁图和QTL。区别于遗传图谱中遗传距...

问题 请问麦基因家族分析电脑内存,提取的文件是空的,这个问题解决了吗?求指导

但我直提取的1A染色体还是不行,我看回答中说用get_fa_by_id.pl脚本把染色体分隔开,然后合并,具体是怎么操作,求指导

文章 QTL定位方法介绍

...两个及两个以上样本均数差别的显著性)、t检验、线性回归等方法进行检验,如果有差异说明标记可能与表型连锁,如果没差异表示随机与表型不连锁。如下图所示,每一行是一个样本的基因型与表型数据,每一列为不同的标...

问题 用enrichGSEA和用官方GSEA软件跑出的多条通路都是相反的,是为什么呢

...文件,提供组别信息,如果我不把四组列出来,只列我想比较的两组,跑出来的结果也会有好多条我认为标志性的通路时反的。

问题 具体用那些数据分析 是两两比较还是总的比较

你好 老师 我做了5个时期的种子的转录组,其中有两两比较,具体怎么分析,请老师知道一下

文章 什么是RIN值?!

...首先要从评价核酸质量是否达标开始,RIN值是样本检测中比较重要的指标,今天就给大家聊聊RIN值! RIN值简介 RIN值,即RNA integrity number(RNA完整值),是安捷伦公司开发的以数字化形式表示 RNA 完整性的参数。在高通量测序样...

文章 博士单身的多吗?调查发现:博士平均恋爱次数是6.87次

...文的经历 常年呆在实验室的博士们,身边的异性其实比较少, 所以,他们总是有一种错觉: 学妹/学弟又我帮忙了,肯定是对我有那么点意思, 内心涟漪四起,以为这就是恋爱的味道。。。。 4,可能算上了对paper的爱? ...

文章 ConsensusClusterPlus 包对基因表达数据进行一致性聚类

...遇到缺失数据时将报错everything:遇到缺失数据时,相关系数的计算结果将被设为missingcomplete.obs:行删除pairwise.complete.obs:成对删除,pairwisedeletion (2)calcICL函数:用法: calcICL(res,title="untitled_consensus_cluster",plot=NULL,writeTable=FALS...

文章 基因组组装质量评估

...te(90%以上)以及coverage(95%以上)认为组装结果和reads有比较好的一致性。 2. 序列完整性评估 评估组装得到的基因组对基因区的覆盖程度。一般需要借助RNA方面的证据进行评估,如EST数据或RNA reads。由于用来评估的RNA方面证...

问题 ks计算物种共同祖先WGD事件的问题

同一个物种,物种内的ks比较它们的共同祖先基因组复制时间,物种A3是物种A1和物种A2的共同祖先,计算结果显示物种A1与物种A3的ks值为0.7,物种A2与物种A3的ks值为0.9,结果如何解读?感觉矛盾

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...站等; 科研技能:进化树构建、美化,多序列比对,比较基因组学,蛋白功能预测等生物学技能或知识,不断更新; 生活·常用:新闻、社区、财经、交通等生活常用网站; 购物·休闲:视频、购物、音乐等工作外常用...

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问题 老师好 进化树美化时电脑页面没有出现教程中的历史记录的那个框怎么办,怎么将其调出来?

文章 如何有效利用企业资源,发挥Scrum最大优势?

...大多数人在想要达成的目标方面有共识。而通常会在决定如何达成目标时出现分歧。 共识可以是正式的(例如,在企业中确立敏捷的愿景或创建一个专注于敏捷的团队),也可以是非正式的,通过谈话达成共识。关键是要使...