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问题 基因ID

老师您好。我下载了一个苹果基因组进行基因家族分析。现在出现了两种基因ID，正常的ID是MdoChr17g0211这种，但是有一个成员是这样的MdoScaf049s0015。请问MdoScaf049s0015的基因ID是啥意思啊。能作为成员吗。看了他的保守序列也是完...

问题 docker运行mcscanX出现空指针

老师您好，我在docker运行共线性分析的时候，出现了这样的问题，百度说是空指针，但我不是很理解，已经检查了路径是正确的。

问题 用GATK call SNP时报错

...amtools index SRR3274663.new.sorted.bam此命令对输入文件做索引也不成功

文章 CentOS 7 清理删除卸载 Docker 环境

...m -rf /var/lib/dockershim# rm -rf /var/lib/docker     如果发现删除不掉，需要先 umount，如 # umount /var/lib/docker/devicemapper 6. 卸载 docker     查看已安装的 docker 包 # yum list installed | grep docker     卸载相关包 # yum remove docker-engine docker...

问题 BSA结果，只有一个SNP

请问，BSA结果分析之后，QTL和G-VALUE图都很好，但是区间内只有一个snp，去掉这个snp之后就没有峰值了，是为什么？ 需要跑一下indel么？

文章 linux给用户添加sudo权限

...加sudo权限 首先需要切换到root, su - (注意有- ，这和su是不同的，在用命令"su"的时候只是切换到root，但没有把root的环境变量传过去，还是当前用乎的环境变量，用"su -"命令将环境变量也一起带过去，就象和root登录一样)chmod u+w /e...

文章 如何绘制一份韦恩图

言不如表，表不如图，一图胜千言。见多了散点图，柱形图，折线图等这类代表数值大小及变化趋势的图。今天给大家介绍一类代表包含关系的图，那就是韦恩图。 韦恩图（Venn diagram） 又称为文氏图，是关系型图表，通过图形...

问题 mapman数据NA等的处理

老师，请问转录组数据用log2FC做mapman分析，数据中的NA， #NAME？，inf 等字符应该怎么处理呢？谢谢

问题 BSR-SEQ

您好老师~我在做BSR-seq数据分析的时候，总是出现Insert size out of range。我用的hasit2比对，samtools sort，然后再用java picard 来reoder，sort……。就出现了这个问题

文章 npx skills add 安装skill用法

...bal-g全局安装，对所有项目生效-g--list-l仅列出可用技能，不执行安装-l--yes-y自动确认所有提示（适合 CI/CD）-y 三、技能安装位置 Claude Code.claude/skills/<技能名>/~/.claude/skills/<技能名>/Cursor.cursor/skills/<技能名>/~/.cursor/s...

问题 老师，想请问一下WGCNA中绘制性状与模块相关性图出现colorMatrix[, c] : incorrect number of dimensions

前面的代码都没有问题，运行绘制的代码的时候出现错误： 我检查了数据的格式和维度，数据的情况如下： 性状数据的具体内容如下： textMatrix矩阵内容如下： 实在是不知道问题出在了哪里。。。

问题 怎么给外地的公司发原始数据呢？

我手里有十来个转录组样品的原始数据，想寄到公司重新分析下，但是太大了，应该怎么给他们呢？

问题 MCScanX 共线性区域太少

老师好，我的基因组组装注释完用busco评估完整性96.3%，然后进行共线性分析，染色体之内和之间共线性区域很少，请问是注释的有问题吗？该怎么检查呢？

问题 聚类前后，基因总数有较大差异

请问大家，对转录组数据进行聚类分析后，发现聚类后的基因总数比聚类前的基因总数少了大约40%，这是怎么回事呀。

问题 请问老师在植物中调控开花的基因有哪些？

想做个开花基因的家族分析。