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问题 WGCNA参考资料

购买了RNA-Seq的有参转录组自主分析课程，但是课程中的WGCNA的参考资料无法下载，公众号中发送关键词后没有擦模考资料的下载链接

文章 比赛现场做生化实验，这位药学女博士当选2020年美国小姐！

...就是非常有名的“大象牙膏”实验，虽然这个实验本身并不难，就是将浓缩的过氧化氢与发泡剂混合起来，加上一些碘化钾或其它催化剂，然后巨大的泡沫就像喷泉一样涌出……但是，这个“另类”的才艺表演，还是给观众及评...

问题 GEO数据处理

如果没有找到GPL注释信息，只下载了上传者的GPL数据，那这部分数据是不是就不能用，如果要使用这个GSE数据进行后续分析，那么R语言代码要做什么变化？

问题 片段复制和串联重复

老师您好，   按照视频讲解在使用MCscanX 进行基因组内共线性分析时，出来了串联重复的文件，可怎么判断片段复制？（视频中讲解在提取过程中，最后出来个片段复制，这是依据什么出来的？）

问题 uscs xena

请问老师，在ucsc xena 中的HTseq counts这个下载的是read counts值嘛？如果不是的话，能转换成read counts 值嘛，或者说如果要用这个进行下游差异分析的话，要用什么R包呢，DESeq 2 可以吗？

问题 Fst染色体数量不对

进行Fst分析之后染色体数量不对是什么原因呢？怎么确定Fst中曼哈顿图的阈值线呢？

文章 解读：2019年度高被引科学家名单透漏出哪些信息？

...的重要量化指标，通过每年度的“高被引科学家”的数据分析，甚至可以预测出诺贝尔奖得主。中国超越英国，排名第二！在2016年，中国“高被引科学家”人数还排在全球第4位，位于英国和德国之后，到今年，已经全面超越英...

问题 使用allhic挂载染色体时，长度排序前十的超长contig只有一个挂载到group中，如何将这些未挂载的超长contig也绘制到heatmap图中

老师您好！我分析的物种是二倍体高杂合植物，11条染色体，hifiasm组装后长度大于60M的contig有11条，剩余绝大部分contig都在100Kb以下。无近缘物种基因组。 为了进一步组装染色体级别基因组，并查看组装是否有错误，用allhic进行...

问题 群体遗传进化课程中基于pi用R脚本绘制曼哈顿图请问更改色板颜色的具体指令

...使用了默认的四个颜色，也用了ggplot2包自带的色版，都不可以，应该是代码没输入正确，请老师帮忙看看，谢谢！

文章 人源化抗体包含哪些？义翘抗体人源化服务简介

...会引起人抗鼠抗体（HAMA）反应， 导致抗体半衰期缩短（不到20 h），治疗效果减弱。利用DNA重组和蛋白质工程技术，对抗体基因进行重组，可在保留鼠源抗体对抗原有效结合部位的同时最大限度地降低非结合部位的鼠源性。这种...

问题 某物种没有基因组，做了转录组（RNA-seq）,蛋白组（ITRAQ），要研究该物种某个基因家族，怎么做？

如题。请大神们能够提供参考文献就好了，不需要多，谢谢！

问题 单细胞细胞周期相关基因文件准备中遇到的问题

...es和g2/m时期的g2/m.genes，没有G1时期的，能解释一下为什么不加G1时期的？ 3还有就是G2/M这里面的基因是包含G2，G2/M和M时期的所有基因还是只有G2/M时期的基因？

文章 HISAT和STAR比对软件比较

分析流程： 人基因组比对 比对参数 比对用时 比对率 找到的差异基因 参考文献：https://ieeexplore.ieee.org/abstract/document/10178793

文章 SCTransform ,Error: useNames = NA is defunct

SCTransform在seuratv4的时候没问题,升级到v5的时候不工作,出现报错 > brain <- SCTransform(rep, assay = "Spatial", verbose = TRUE)Running SCTransform on assay: SpatialRunning SCTransform on layer: countsvst.flavor='v2' set. Using model with fixed slope and excluding poisson ge...

问题 全基因组选择BayesC模型代码部分疑问

...-tcrossprod(X)/ncol(X)，分母的ncol(X)和常规的VanRaden G矩阵定义不一样，这个会对结果有影响吗？ （2）在K折交叉部分，训练集是1093个样本，但是代码中设置的sets是round取整，这样会导致set只有1090个，order之后产生3个NA，这一步会导...