...轨迹、CytoTRACE 分化潜能评估与转录因子调控网络（TFRN）分析，系统解析细胞去分化与多能性获得过程。研究发现，木质部极中柱鞘（XPP）细胞是愈伤起始的源头细胞，经诱导形成LRPI‑like 细胞（类侧根原基起始细胞），该类细...
gff文件里没有5' 3'UTR信息，能继续做分析吗，没有UTR信息比如做出来的基因结构图只有CDS序列
...开了，如下所示： 注意，IP地址前面加sftp:// ,端口可以不填，默认是21。 用户名密码获得参考putty链接远程服务器： 之后就可以在最下面的两个窗口之间互相传递文件了，可以双击，或者点击右键上传指定的文件，或者下载...
...照对于一些该“目”下测过序的物种进行比较基因组学的分析，分析某一家族的基因功能，并且可能通过延伸实验的方式在物种"A"中加以验证，请问以上想法靠谱吗？ 注：问题的关键在于从分类学层面来说，同一“目”下的物...
...间在学习如何使用kvm创建虚拟机，在实践过程中遇到很多不太清楚的问题，靠AI帮我快速解决了这些疑问。 这里以如何修改kvm虚拟机root密码这个问题为例，看下AI的解决效果。 对话如下 ：https://www.doubao.com/thread/w986bf96b90261a31 ...
序列的提取是我们生物学分析的基础操作，在许多分析中都会使用到。在这里给大家提供几个提取序列的命令。 1. seqkit 使用 seqkit subseq 通过指定区域提取序列 -r 通过区域来截取序列，提取 in.fa 前12个字符，可以用--chr指定染...
...老师:请问为何测序公司三代转录组测序给出的CDS有很多不是ATG开头?我测的是真核植物,我的理解是真核生物CDS不是以ATG开头么?事实上很多确实都是以ATG开头的,但是就是大约有1/3测的的CDS序列是以什么GGG,GCG之类的碱基开头。无法...
我在做重测序分析中的call SNP， 我发现一个山羊的测序数据call snp 运行了两天还没有结束，是不是我给的内存太小了，我的服务器的内存是128G， 我给了100G， 是不是太小，请问给多大合适，需不需要加大内存？
...域相关的基因，并批量下载其CDS等序列，以便用于做后续分析；如定量，设计引物，同源比对等等； 首先，回到首页，1.点击想要搜索的物种， 2 选择find genes by keywords 得到很多关于NBS相关的基因，共有128个基因如下： ...
我用蛋白序列id无法提取出来的文件是空的，但是我用mRNA ID可以提取出来，请问为什么？(我下载的的蛋白fa文件使用每行开头是>XP，不知道是否有影响)。
...确吗？2、我用DNAMAN翻译的序列和用NCBI上查到的ORF区序列不太一样，我后续预测理化性质什么的话，我用哪一段比较好呢？
老师，您好，请问做启动子分析得到的plantCARE.tab文件，怎么得到feature.bed 文件呢？课程的那个shell命了还是没有看懂谢谢！
转录组分析中，针对新的转录本进行长链非编码RNA的预测，有什么软件可以预测？
最近我看了不少基因家族的文章，都是纯分析就发3分了，今年是不是不好发了啊？
老师您好，根据基因家族课程中共线性分析后的操作我没有筛选到大豆中一个基因家族的重复序列，请问是我操作有问题还是没有串联重复序列也是正常的呢？谢谢老师解答