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问题 请问老师密度图绘制出来为什么是这样？

还有后续步骤中分析B与A组的差异 求解，谢谢老师们 经过测试，用视频讲解里的GSE完全没问题，用我自己要分析的数据就会出现这种缺失值，请问该如何处理这种？如何继续分析下去

文章 细胞转染效率低怎么破？攻略在这里......

...生命过程，如何将目的基因导入细胞内是科学实验过程中不可缺少的实验技术，而细胞转染是完成这一过程的必需步骤。 在实验当中，我们经常遇到的一种情况就是转染完细胞，去跑qpcr验证，结果显示转染效率太低以至于无...

问题 TSS转录起始位点确定。

请问除了在数据库里找到注释的方式外，还有其他方式能够找到TSS位点或什么实验能验证TSS位点不?

文章 pRRophetic包预测药物敏感性

...面这条命令进行安装pRRophetic包 install.packages("pRRophetic_0.5.tar.gz", repos = NULL, dependencies = TRUE) 从CPG细胞系预测临床结果 根据基因表达谱数据进行预测患者化疗效果，基因表达谱数据中行名为基因名，并且数据为matrix矩阵 predictedTy...

文章 什么是GSEA?

GSEA的定义 Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分析)用来评估一个预先定义的基因集的基因在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势，从而判断其对表型的影响作用。其输入数据包含两部分，一是已知功能的基因集 (可以是GO注...

问题 GWAS中gapit分析没有结果，命令行输入与屏幕输出如下

Rscript ./gapit_gwas.r -i ../00.filter/hapmap.txt.gz -t ../trait.tsv  -m GLM  -n hd.GLM.GWAS.Results  WARNING: ignoring environment value of R_HOME --> Q&A for bioinformatics, please visit the website: https://www.omicsclass.com/ --> R beginners ? I suggest your  learning  R langua...

文章 2020国自然热点预测：2019最火的7大方向解读！

...的项目，这不就有方向了吗? 今天学霸姐姐就来给大家分析解读一下2019国自然医学部的热门方向，2020年的风向标这就来了! 今年医学科学部共批资助10138项(不含杰出青年基金项目)，批准资助金额共计44.13亿元，单项平均资助...

问题 用ALLHIC挂载时，划分Group出现问题

...染色体，在 划分GROUP的时候，其中第一条GROUP很长，有 395 Mb，其余都很小。如下：       1.   sample.clean.counts_GATC.12g1   394863216       2. sample.clean.counts_GATC.12g10  160144       3. sample.clean.counts_GATC.12g11  117827       4. sam...

问题 circos图的名字显示问题

如何书写配置文件让基因名字显示在一起且不重叠呀，改成这个样子的呢

问题 保留蛋白编码基因代码出错——2

最后出现这个警告他就不运行了，之后跳出去之后会出现空的文件

问题 blastp提示ensemble中提取的序列文件不对

...令  blastall -i Homo_sapiens.pep.fa -d query_pep.fasta -p blastp -e 1e-5 -b 1 -v 1 -m 8 -o human.out 提示WARNING: ENST00000501597: Could not calculate ungapped Karlin-Altschul parameters due to an invalid query sequence or its translation. Please verify the query sequence(s) and/or filtering o...

问题 WGCNA相关问题

老师您好，我按照课程中给的代码读取WGCNA基因表达数据，数据格式与示例数据相同，为什么每次dim之后就只有0行和1列呢，后面的筛选也筛选不到基因，聚类树也画不出来，求解答

问题 基因家族鉴定数据准备

老师您好，通过查阅文献可知要用Draper这个做参考基因组做基因家族鉴定，这个那个基因组数据和我们课程上讲的示例不一样，可以用这个做吗

文章 蛋白质纯化方法及注意事项有哪些？

...附分离（利用颗粒吸附力的强弱不同达到分离目的） （5） 根据配体特性的分离——亲和层析（利用蛋白质分子与另一种称为配体的分子能够特异而非共价地结合这一生物性质） (6)　低温有机溶剂沉淀法: 用与水可混溶的有机...

问题 利用Perl遍历哈希

上次的问题不太明确，这次重新提问一下，谢谢各位老师！ 读入cucumberprotein.fasta文件，创建一个id和序列对应的hash, 遍历该hash，并输出到一个新创建的文件中