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问题 为什么我的WGCNA分析运行到这一步就卡住了,但是显示分析中,WGCNA分析如何筛选数据啊,恳请各位大佬帮帮忙

... 0) dissTOM <- 1 - TOM # 调用层次聚类函数 之后,R就一直显示运行,之前尝试的时候并没有产生这种情况,请各位大佬帮忙解答一下,还有就是请问一下啊如何筛选计算WGCNA的数据

文章 在线绘制基因染色体位置图

...和颜色,染色体的宽高以及颜色,基因名称的字体大小及显示方式等。大家可以试着设置一下,绘制自己需要的图片,小编这里就不细讲了。绘制好图片后即可下载需要的图片格式。 好了,今天就到这里,大家操作一下试试...

问题 R下载GEO数据没有显示GSM1625995 = col_double()

...GSE, GSEMatrix = TRUE, AnnotGPL = TRUE,destdir = workdir)后有一段红字显示: Parsed with column specification:cols(     ID_REF = col_character()     GSM1625995 = col_double()     ....     ....)File stored at: F:/GEO/20180605/Download/GSE66597/GPL6480.annot.gz     但是我...

文章 monocle3分析结果解读

...,而不要求分化轨迹一定是树形结构。 注:黑色的线显示的是graph的结构。数字带灰色圆圈表示不同的结局,也就是叶子。数字带黑色圆圈代表分叉点,从这个点开始,细胞可以有多个结局。这些数字可以通过label_leaves和label_...

问题 老师好,我在使用TBtools时出现了一些问题,一些功能无法使用,如gtf sequence extractor,报错如图,不显示下拉选项,换了许多版本也还是存在这个问题

在使用TBtools时出现了一些问题,一些功能无法使用,如gtf sequence extractor,报错如图,不显示下拉选项,换了许多版本也还是存在这个问题,希望能得到解决,十分感谢!!!

文章 NCBI下载SRR并转换为fastq文件

...选择“BioProject”,搜索文献中提供的项目号 PRJNA356989 搜索结果如下: 点击BioSample对应的数字,跳转到以下界面: 任意点击一个样本,得到该样本的信息,之后点击下方SRA,点击 study 中的 all runs 进入到全部样本界面...

问题 pheatmap做cutree,分成了4组,怎样知道每组中都有谁,每组有多少个基因呢?我数据量比较大,不能全部显示

问题 pheatmap做cutree,分成了4组,怎样知道每组中都有谁,每组有多少个基因呢?我数据量比较大,不能全部显示

问题 pheatmap做cutree,分成了4组,怎样知道每组中都有谁,每组有多少个基因呢?我数据量比较大,不能全部显示

问题 GWAS分析中,PCA和群体结构分析,docker运行代码后最后均显示如下,segmentation fault,然后什么也不能生成,请问这是怎么回事

文章 部分基础绘图函数隐藏坐标轴(并重绘)

...轴刻度              labels  对应将在坐标轴刻度位置显示的标签                 LETTERS是R内置的一个常量,此处取其中24个元素(https://www.omicsclass.com/article/549) 对y轴进行隐藏后,同样可以利用axis进行重绘。 其他的一...

问题 老师,我更换镜像了,但本地镜像一直加载不了,显示如下。然后,我在服务器上,导入镜像,运行docker run -it --rm --name pangene --group-add keep-groups -v /home/us132/pangene:/work localhost/omicsclass/pan-gene-family:v2.0做了泛基因集构建。之后继续做其他分析,然而,运行镜像时一直出错,进不去,错误显示如下。

本地镜像导入:系统运行时

文章 pheatmap返回的结果解释(获得新的排序信息)

...,基于这个信息可以输出排序后的矩阵,从而获得与热图显示顺序一致的文件结果: > newOrder=mat[list$tree_row$order,]> newOrder              CK-WT-1      CK-WT-2      CK-WT-3   CK-tdr1-1   CK-tdr1-2   CK-tdr1-3AT1G01030   ...

文章 网站编辑器代码块 高亮显示使用技巧:

...注释行应该单独一行,前后各空一行,以免造成代码高亮显示错误; 2.在代码中已经添加代码高亮后,代码需要空行时可用 shift+enter键添加空行,而直接enter代码块会断裂; 如下是空行后,完美显示: use Bio::SeqIO;use Bio::Seq;us...

文章 2020年转录组文章到底有多难发?一文说明白!

...氧合酶(LOX)基因均显著上调;受MAPKs调控的WRKY转录因子也显示上调,如下图: 5. 二叉蚜采食后小麦叶片中过氧化氢(H2O2)积累和抗氧化酶活性的变化蚜虫采食明显上调活性氧清除基因的表达,进一步通过3,3 ' -二氨基联苯胺(DAB)...