问题 运行代码的时候出错，我确认文件都存在，报错代码如下所示

...  ✔ purrr     1.0.2 ✔ forcats   1.0.0     ✔ stringr   1.5.0 ✔ ggplot2   3.4.4     ✔ tidyr     1.3.0 ✔ lubridate 1.9.3 ── Conflicts ────────────────────────────────────────── tid...

问题 老师，您好，找不到临床数据该如何解决？

... p_cutoff <- 0.05 > top_n_select <- 50 > # 工作目录如果不存在，则创建目录 > if( !file.exists(work_dir) ){ +   if( !dir.create(work_dir, showWarnings = FALSE, recursive = TRUE) ){ +     stop(paste("dir.create failed: outdir=",work_dir,sep="")) +   } + } &g...

问题 docker镜像设置

按照教程已经安装好了docker，设置镜像时的内容和教程上的不一样，按照教程的更改之后也不能保存，显示错误

问题 stringtie定量出现问题

命令如上。 报错信息如下：上面显示成功完成了，但是结果文件却是空的！不知道为什么！

问题 GAPIT使用异常

我在使用GAPIT时存在以下的异常，之前用都是好好的，代码和文件都没有变过，不知道什么原因，希望大家帮忙看看。

问题 基因家族建树

已经得到修剪后的序列，如何得到nwk格式得进化树得文件呢，我想通过下面得R语言脚本建树，因为得到基因数量只有五个不适合环状得树

问题 genes数据与mRNA数据

我从教案里找到的R代码，只能从TCGA下载并提取genes，miRNA，lncRNA的表达数据。但是我的老师让我分析一下mRNA，所以我就不会了。难道我提取的genes的数据就是mRNA的数据吗？分析mRNA能不能直接用genes数据呢？

问题 gvcf转vcf

老师，我在进行gvcf转成vcf这一步出现了这个问题，不知道改怎么弄了，求助

问题 老师，您好！在进行python版mcscan 共线性分析时，当执行#绘制共线性图片：准备两个配置文件为输入文件，出现以下错误layout文件是如何制作和生成的，改了好多次都没成功，里面的内容是在txt里写入的还是用Excel编辑后保存为制表符分隔格式；还有mcscanx里面的染色体输入文件也是读入出错。

问题 meme分析后显示error at: maxw

进行meme分析，输入命令：/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme ../pep_id-seq-F.fa -protein -oc ./ -nostatus -time 18000 -maxsize 6000000 -mod anr -nmotifs 10 -minw 6 maxw 100 显示：error at: maxw及以下信息，反复查看找不到原因，老师能否解决以下。 Usage:meme<dat...

问题 基因芯片探针与基因ID转化

基因芯片的探针与基因ID转化的过程是什么？很多教程里的GEOquery以及其他涉及到分析的包都没有办法下载。请问做过能不能推荐一个用可以下载的包进行分析的流程

文章 多组学联合分析—桑基图

...根本看不清逻辑…… 今天就给大家安利一款多组学整合分析的“可视化神器”——基因-通路-代谢物桑基图！它能把抽象的分子调控关系变成清晰的“流向图”，让你的科研逻辑一目了然，论文配图档次直接拉满！ 什么是基...

文章 基因组重复序列分类 转座子

...素、预测方法及标记开发等方面取得一系列成果，跟踪和分析植物转座子的最新研究进展对全面了解转座子的功能具有重要意义。为了理清植物转座子与基因表达调控关系，本文综述了植物转座子分类、起源和转座机制以及转座...

问题 虚拟机软件使用问题

 为什么按Hi+TAB不出现hisat软件的选项

问题 KAKS作图问题

1.请问如何调整kaks_plot.r包中参数才能使左边geneID上下不那么拥挤？ 2. 如何去掉下图中完全空白的部分重新作图？