问题 群体遗传进化分析课程中，如下图所示利用run_pipeline.pl -Xmx5G -importGuess $workdir/00.filter/clean.vcf.gz \ -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter这个代码并没有在01.phylo_tree文件夹中得到supergene.phy的文件

文章 一个预测基因保守结构域网站

今天跟大家分享一个分析蛋白保守结构域的的网站： 网址：http://www.ebi.ac.uk/interpro/ 在上图的方框导入蛋白序列，点击submit，就开始运行，结果如下图所示： 这个网站优点就是不仅分析了蛋白的保守结构域，还给出了他的...

问题 老师好，在基因家族分析课程视频里，鉴定基因家族成员时，里面实操用的是基因组的蛋白质序列（pep文件），然而我自己的实验数据是无参转录组，我想问下，我应该用什么文件来鉴定基因家族成员呢？我看到之前有类似问题的答案是unigene或者蛋白质序列，两者有什么区别呢？

基因家族成员鉴定

问题 关于动植物基因组组装课程mysql_server.sh

...ta:/var/lib/mysql \ -v $PWD/conf:/etc/mysql \ -e MYSQL_ROOT_PASSWORD=123456 \ -d mysql:5.7

问题 TBtools报错

想在tbtools中制作基因结构图，结果因为发育树中将基因ID改成WRKY1,WRKY2对应不上报错了，请问如何解决呢

文章 小公司如何管理好团队？

...让你的团队跟你是一条心做事，大家劲往一处使？”“我不在的时候，其他人就开始松懈了，怎样才能让员工，你在和不在都一样？”“作为一个领导，如何管理自己的员工，他做什么，不做什么,你怎么来把控，是每天自己来...

问题 GWAS假阴性过高，请问怎么解决

用tassel MLM模型绘制QQ图发现分析的结果假阴性，绘制曼哈顿图发现，没有点能够超过阈值，请问如何调整数据或前期分析的参数？

问题 nextpolish报错

老师，您好，我用的大讲堂的基因组组装的DOCKER,在用nextpolish的时候提示这样的报错，不知道是什么原因，麻烦看下，谢谢1

问题 nextpolish报错

老师，您好，我用的大讲堂的基因组组装的DOCKER,在用nextpolish的时候提示这样的报错，不知道是什么原因，麻烦看下，谢谢1

问题 用R语言绘制旭日图但无法控制配色

...： mypalette<-c("#8C8C8C","#87CEFA","#FF00FF","#B22222","#EE9A49","#858585","#080808","#836FFF","#87CEFF","#7FFFD4","#008B8B","#CD661D","#CDC9A5","#0000FF","#00FF00","#EDEDED","#FAEBD7","#666666","#EE0000","#8E388E","#C1FFC1") ggplot(data, aes(x=size, y=per,fill=species))+geom_col(position="fi...

问题 P值与矫正后P值

最近分析的好多组数据矫正后P值都是这样，或者干脆全部是1，用limma包分析的，请问这是什么原因导致的呢？能不能直接用P值呢？

问题 老师您好，我想用真菌线粒体基因组做群体遗传分析，已经组装好线粒体基因组，是需要把每个菌株自身的线粒体基因组当做ref还是用一个统一的线粒体基因组做ref?同时想请教也是按照重测序课程一个一个从线粒体基因组利用reads筛选snp么？

问题 老师您好，我想用真菌线粒体基因组做群体遗传分析，已经组装好线粒体基因组，是需要把每个菌株自身的线粒体基因组当做ref还是用一个统一的线粒体基因组做ref?同时想请教也是按照重测序课程一个一个从线粒体基因组利用reads筛选snp么？

问题 TCGA数据下载后保存出错

...a for project TCGA-STAD GDCdownload will download 407 files. A total of 105.663384 MB Downloading as: Sun_Aug__5_19_35_20_2018.tar.gz Downloading: 110 MB     >  > # 保存结果，方便后面使用 > data <- GDCprepare(query = query,  +                        save...

问题 PSMC

老师好！我的psmc结果时间尺度到千万年之后了，这正常吗？我看文献一般没有到这靠后的，这个PSMC结果是否不准确？或者是只看三百万年到距今几万年间的结果？