问题 关于差异基因表达的问题

我的数据是种子在授粉后四个不同天数的转录组数据，经过分析得到了count值和fpkm值，请问我可不可以把其中一组数据作为对照，然后用其他三组数据去做差异表达分析

问题 群体结构clean.vcf.gz转换成phy文件失败

就是复制的w.sh里面的run_pipeline.pl -Xmx5G -importGuess $workdir/00.filter/clean.vcf.gz -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter，但是只停留在[pool-1-thread-1] INFO net.maizegenetics.analysis.data.FileLoadPlugin - Start Loading File: /work/my_pop_cucu/00.filter/clean.v...

问题 hmmsearch的选择

像这种 从一个开始 后面两个 from to 就不一致的应该如何选择呀?

问题 tiqu

为什么一加入gff文件就这样，在tbtools里做进化树，motif合在一起能把提出来，加入基因结构gff文件就提不出来了呢

文章 如何看懂从TCGA下载的甲基化数据

...A数据挖掘，请学习的我TCGA系列课程： 《TCGA-甲基化生存分析》 《TCGA-生存分析》 《TCGA-基因差异表达分析》 《TCGA-ceRNA调控网络分析》 《TCGA-转录因子调控》

文章 华大stereo-seq 添加上底片转换成10X格式方便scanpy和seurat读入分析

...结果目录展示： 4.R 读入绘制结果图： scanpy读入分析结果： 从 SAW v8.3 开始，所有的 *2h5ad 和 *2rds 子流程均已全面升级，支持图像嵌入 (Image embedding) 功能。您现在可以将一张显微镜图像直接添加到输出的结果矩阵...

问题 蛋白三级结构分析时，用PSI-blast和SWISS-MODEL自带的模板同时做了，发现SWISS-MODEL自带的模板做出来的相似度更高、GMQE和QMEAN值也更好，同时，两个方法也有重复的模板，想问问老师应该选择相似度更高的，还是选择两种方法都有的模板？

问题 单倍型结果的解读

hapVsPhenos.pdf，老师，您好，请问这个单倍型分析结果中，有关于表型和单倍型之间的关联分析，这个左边的热图代表的意思是每个单倍型之间的相关性，怎么判断具体是哪个单倍型和表型是相关的呢？

问题 基因共线性

最近在做基因共线性时，已经准备好GFF文件，调蛋白序列时出错，仔细看蛋白fa文件发现名称不一样，请问怎么解决

文章 北京2例鼠疫确诊，实验小鼠安全吗？

...么凶猛。 但是目前，鼠疫在我国非常非常少见，大家也不必恐慌。 国家疾控中心官网发文称，“北京市民不用过度担心感染鼠疫风险，此次疫情进一步扩散的风险极低。市民可正常工作、生活和去医疗机构就医，不用担心感...

文章 TCGA癌症和正常组织中的基因表达差异图

TCGA数据，做完差异表达分析，获得差异表达的基因之后，可以将差异表达的基因在癌症和癌旁中的数据拿出来进行比较一下，看看两者差别是否显著。 # 绘制差异表达基因在比对样本中的表达情况 # 将表达量进行log2 转换 normDat...

问题 biolinux

导入之后设置的时候发现无效设置。 显示硬件配置页中已启用硬件虚拟化，但主机并不支持，需要禁用硬件虚拟化才能启动虚拟机。是什么意思？怎么处理？谢谢解答

问题 提取保守结构域

我做的的家族分歧比较大 ，需要用结构域建树，不知道怎么操作，希望老师能详细说下

问题 vlookup使用

老师您好，我做PPI图时，按照视屏教学中的步骤使用的vlookup，但筛选不出结果，请问是excel的问题还是其他什么原因？

问题 xpclr绘图

染色体号不一致，参考基因组的染色体号是NC开头，xpclr是数字，与把染色体替换成一致吗？